275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0181 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0181  F0F1 ATP synthase subunit B  100 
 
 
167 aa  332  1e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03050  ATP synthase F0, subunit B  43.9 
 
 
164 aa  149  2e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3214  ATP synthase F0, B subunit  45.12 
 
 
164 aa  147  7e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0394  ATP synthase F0, B subunit  41.72 
 
 
165 aa  137  4.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.501074 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1231  ATP synthase F0, B subunit  40.24 
 
 
164 aa  135  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1057  F0F1 ATP synthase subunit B  45.22 
 
 
166 aa  134  7.000000000000001e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0063  ATP synthase F0 subunit B  39.63 
 
 
164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1716  ATP synthase F0, B subunit  45.12 
 
 
163 aa  124  5e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000198199  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5023  ATP synthase F0, B subunit  41.61 
 
 
151 aa  121  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.203888  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2096  F0F1 ATP synthase subunit B  38.65 
 
 
175 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  37.89 
 
 
175 aa  111  5e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0066  F0F1 ATP synthase subunit B  37.89 
 
 
175 aa  111  6e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.391852  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2883  F0F1 ATP synthase subunit B  37.27 
 
 
175 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126633  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  37.89 
 
 
175 aa  107  6e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5434  F0F1 ATP synthase subunit B  39.02 
 
 
168 aa  102  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5487  F0F1 ATP synthase subunit B  39.02 
 
 
168 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115712  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5520  F0F1 ATP synthase subunit B  38.41 
 
 
168 aa  102  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000205849  hitchhiker  2.15653e-17 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3829  F0F1 ATP synthase subunit B  36.81 
 
 
168 aa  101  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.242608  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2489  F0F1 ATP synthase subunit B  33.75 
 
 
175 aa  100  6e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000305387  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2707  F0F1 ATP synthase subunit B  37.89 
 
 
175 aa  100  7e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5107  F0F1 ATP synthase subunit B  36.81 
 
 
168 aa  100  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.164846  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0313  ATP synthase F0, B subunit  38.85 
 
 
171 aa  99.8  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154955  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  36.36 
 
 
178 aa  99  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5159  F0F1 ATP synthase subunit B  37.8 
 
 
168 aa  97.8  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4992  F0F1 ATP synthase subunit B  37.8 
 
 
168 aa  97.8  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.416511  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5009  F0F1 ATP synthase subunit B  37.8 
 
 
168 aa  97.8  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5551  F0F1 ATP synthase subunit B  37.8 
 
 
168 aa  97.8  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0100473  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5400  F0F1 ATP synthase subunit B  37.8 
 
 
168 aa  97.8  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.95382e-52 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5431  F0F1 ATP synthase subunit B  36.2 
 
 
168 aa  97.8  7e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0030165  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0110  F0F1 ATP synthase subunit B  39.26 
 
 
156 aa  97.1  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000261662  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1713  F0F1 ATP synthase subunit B  35.71 
 
 
171 aa  95.1  3e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4485  ATP synthase F0, B subunit  34.78 
 
 
175 aa  95.5  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.594987  normal  0.141672 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2181  F0F1 ATP synthase subunit B  36.36 
 
 
173 aa  95.1  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.273543  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2143  F0F1 ATP synthase subunit B  36.36 
 
 
173 aa  95.1  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.631434  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4874  F0F1 ATP synthase subunit B  38.69 
 
 
156 aa  94  8e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0323  F0F1 ATP synthase subunit B  38.52 
 
 
156 aa  93.2  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.190975  normal  0.601696 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3288  F0F1 ATP synthase subunit B  36.57 
 
 
156 aa  90.5  9e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.160099  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  32.69 
 
 
194 aa  89.7  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52200  F0 sector of membrane-bound ATP synthase, subunit B  35.56 
 
 
152 aa  89.7  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1041  ATP synthase F0, B subunit  31.48 
 
 
206 aa  88.2  5e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0637468 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0193  F0F1 ATP synthase subunit B  37.04 
 
 
156 aa  87.4  7e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.882585 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2169  F0F1 ATP synthase subunit B  33.58 
 
 
156 aa  86.7  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000388738  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4474  ATP synthase F0, B subunit  34.78 
 
 
179 aa  86.7  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4511  F0F1 ATP synthase subunit B  34.25 
 
 
156 aa  85.9  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00356652  normal  0.0257912 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2801  F-type H+-transporting ATP synthase, subunit B  35.61 
 
 
156 aa  86.3  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0112017  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4314  F0F1 ATP synthase subunit B  34.25 
 
 
156 aa  85.9  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0812029  hitchhiker  0.0000000000716533 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4370  F0F1 ATP synthase subunit B  34.25 
 
 
156 aa  86.7  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000255144  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3307  F0F1 ATP synthase subunit B  37.01 
 
 
179 aa  86.3  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000544388  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0416  F0F1 ATP synthase subunit B  40 
 
 
156 aa  85.9  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.489173  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4369  F0F1 ATP synthase subunit B  34.25 
 
 
156 aa  85.9  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.011989  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0251  F0F1 ATP synthase subunit B  38.52 
 
 
156 aa  86.3  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4049  F0F1 ATP synthase subunit B  31.79 
 
 
156 aa  85.1  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0368  F0F1 ATP synthase subunit B  37.78 
 
 
156 aa  85.1  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.685642  normal  0.393865 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0476  F0F1 ATP synthase subunit B  37.78 
 
 
156 aa  85.1  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.219933  normal  0.615826 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2434  F0F1 ATP synthase subunit B  31.17 
 
 
146 aa  85.1  4e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0912679  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3350  F0F1 ATP synthase subunit B  34.81 
 
 
156 aa  84.7  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0868788  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4493  ATP synthase F0, B subunit  34.78 
 
 
179 aa  84.7  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4338  ATP synthase F0, B subunit  34.16 
 
 
179 aa  84.3  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209021  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2386  F0F1-type ATP synthase subunit b-like protein  33.96 
 
 
173 aa  84  8e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4751  F0F1 ATP synthase subunit B  33.56 
 
 
156 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4611  ATP synthase F0, B subunit  34.31 
 
 
156 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3191  F0F1 ATP synthase subunit B  36.36 
 
 
156 aa  83.6  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3498  F0F1 ATP synthase subunit B  34.07 
 
 
156 aa  83.2  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00465631  normal  0.23975 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2144  F0F1 ATP synthase subunit B  34.46 
 
 
156 aa  83.2  0.000000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0180  F0F1 ATP synthase subunit B  34.46 
 
 
156 aa  83.2  0.000000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3530  F0F1 ATP synthase subunit B  34.81 
 
 
156 aa  82  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.037276 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3898  F0F1 ATP synthase subunit B  33.58 
 
 
156 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4902  F0F1 ATP synthase subunit B  32.21 
 
 
156 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000735989  normal  0.257522 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0036  F0F1 ATP synthase subunit B  33.58 
 
 
156 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00144365  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2591  ATP synthase F0, B subunit  34.85 
 
 
156 aa  80.9  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.165312  normal  0.0791897 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3849  F0F1 ATP synthase subunit B  32.88 
 
 
156 aa  80.9  0.000000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.28383  hitchhiker  0.0000250407 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0058  ATP synthase F0, B subunit  32.89 
 
 
156 aa  80.9  0.000000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3063  F0F1 ATP synthase subunit B  34.07 
 
 
156 aa  80.5  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4490  F0F1 ATP synthase subunit B  32.19 
 
 
156 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00698245  hitchhiker  0.00000569533 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0299  F0F1 ATP synthase subunit B  37.78 
 
 
156 aa  80.5  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.199967  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0304  F0F1 ATP synthase subunit B  37.78 
 
 
156 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00801796 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3321  F0F1 ATP synthase subunit B  34.09 
 
 
156 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00311324  normal  0.130575 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3284  F0F1 ATP synthase subunit B  33.82 
 
 
156 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.294476  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  33.82 
 
 
156 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000584216  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3309  F0F1 ATP synthase subunit B  33.56 
 
 
156 aa  79.3  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.384998  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73290  F0F1 ATP synthase subunit B  34.21 
 
 
156 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6360  F0F1 ATP synthase subunit B  34.21 
 
 
156 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3879  ATP synthase F0, B subunit  38.58 
 
 
156 aa  79.3  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0000993244  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  33.09 
 
 
156 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0367309  normal  0.480955 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3516  F0F1 ATP synthase subunit B  34.09 
 
 
156 aa  79  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.346164  hitchhiker  0.000127019 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3756  F0F1 ATP synthase subunit B  32.19 
 
 
156 aa  79  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0289991  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0093  F0F1 ATP synthase subunit B  33.09 
 
 
156 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0481406  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0189  F0F1 ATP synthase subunit B  34.07 
 
 
156 aa  79  0.00000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046503 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3031  F0F1 ATP synthase subunit B  32.85 
 
 
156 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0004  F0F1 ATP synthase subunit B  31.51 
 
 
156 aa  78.6  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000383011  hitchhiker  0.00333744 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  30.19 
 
 
162 aa  78.6  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0118  F0F1 ATP synthase subunit B  33.09 
 
 
156 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100936  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2953  F0F1 ATP synthase subunit B  33.09 
 
 
156 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.043981  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  33.09 
 
 
156 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0776663  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0183  F0F1 ATP synthase subunit B  33.09 
 
 
156 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.939973  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4046  F0F1 ATP synthase subunit B  33.09 
 
 
156 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4543  F0F1 ATP synthase subunit B  30.82 
 
 
156 aa  77.8  0.00000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000204898  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3011  F0F1 ATP synthase subunit B  33.09 
 
 
156 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209415  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3312  F0F1 ATP synthase subunit B  33.09 
 
 
156 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0288951  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3972  F0F1 ATP synthase subunit B  33.09 
 
 
156 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.993966  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>