More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0176 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3074  glycosyl transferase family 51  47.17 
 
 		 854 aa  684    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.846458 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3220  glycosyl transferase family 51  46.42 
 
 		 785 aa  689    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259437  normal  0.206704 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0981  hypothetical protein  54.86 
 
 		 786 aa  833    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.250374 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4764  glycosyl transferase family 51  46.67 
 
 		 850 aa  705    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193555  normal  0.0626376 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5029  glycosyl transferase family 51  50.28 
 
 		 765 aa  711    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1915  glycosyl transferase family 51  45.26 
 
 		 815 aa  683    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.70734 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1305  glycosyl transferase family 51  49.25 
 
 		 767 aa  703    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.551332 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0176  glycosyltransferase  100 
 
 		 762 aa  1585    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.368405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1888  glycosyltransferase  45.38 
 
 		 743 aa  677    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0246487 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3131  glycosyltransferase  55.69 
 
 		 759 aa  834    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.47312  normal  0.698693 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0889  glycosyl transferase family protein  43.48 
 
 		 768 aa  632  1e-180  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1474  glycosyl transferase family 51  43.28 
 
 		 772 aa  629  1e-179  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0249209  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0388  glycosyl transferase family 51  43.62 
 
 		 740 aa  629  1e-179  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03455  penicillin-binding protein 1A  42.17 
 
 		 773 aa  603  1.0000000000000001e-171  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6609  glycosyl transferase family 51  41.59 
 
 		 794 aa  575  1.0000000000000001e-162  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.911258  normal  0.0344936 
 
 
-
 
NC_002950  PG0794  penicillin-binding protein 1A, putative  40.13 
 
 		 786 aa  545  1e-154  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0274  penicillin-binding protein, 1A family  37.74 
 
 		 783 aa  479  1e-134  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0343  penicillin-binding protein, 1A family  36.83 
 
 		 774 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.314658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1945  penicillin-binding protein 1A  37.61 
 
 		 752 aa  472  1.0000000000000001e-131  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.419198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0242  penicillin-binding protein, 1A family  37.61 
 
 		 730 aa  465  1e-129  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000113999  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1252  glycosyltransferase  37.55 
 
 		 776 aa  465  1e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.314687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0316  penicillin-binding protein, 1A family  37.95 
 
 		 750 aa  460  9.999999999999999e-129  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.223118 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0301  1A family penicillin-binding protein  36.08 
 
 		 760 aa  450  1e-125  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0590  penicillin-binding protein 1A  36.88 
 
 		 762 aa  451  1e-125  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2643  penicillin-binding protein, 1A family  36.62 
 
 		 755 aa  452  1e-125  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0887  peptidoglycan glycosyltransferase  36.03 
 
 		 841 aa  434  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.24195 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2469  glycosyl transferase family protein  36.36 
 
 		 846 aa  419  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0192266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4835  peptidoglycan glycosyl transferase  36.45 
 
 		 826 aa  419  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191037  normal  0.0433282 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4875  peptidoglycan glycosyltransferase  35.09 
 
 		 850 aa  418  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2324  1A family penicillin-binding protein  35.64 
 
 		 787 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2197  putative penicillin-binding 1 (peptidoglycansynthetase) transmembrane protein, MrcA  36.26 
 
 		 838 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.633683  decreased coverage  0.00350534 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3113  penicillin-binding protein  35.5 
 
 		 839 aa  413  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.988566  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2055  1A family penicillin-binding protein  35.5 
 
 		 839 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.635838  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1120  glycosyl transferase family 51  35.97 
 
 		 907 aa  413  1e-114  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1451  penicillin-binding protein  35.5 
 
 		 928 aa  413  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.49387  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3229  membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein  35.5 
 
 		 844 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.258839  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1080  penicillin-binding protein  35.5 
 
 		 844 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.366397  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2346  penicillin-binding protein  35.5 
 
 		 844 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1363  penicillin-binding protein  35.5 
 
 		 844 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2061  glycosyl transferase family protein  33.6 
 
 		 810 aa  413  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2013  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.4 
 
 		 834 aa  414  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.155902 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2081  glycosyl transferase family protein  36.04 
 
 		 846 aa  410  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.45351  normal  0.431878 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3899  peptidoglycan glycosyltransferase  35.4 
 
 		 821 aa  410  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1674  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.74 
 
 		 846 aa  408  1.0000000000000001e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.339847  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5993  peptidoglycan glycosyltransferase  34.69 
 
 		 858 aa  405  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4006  peptidoglycan glycosyltransferase  34.69 
 
 		 857 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237546  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4361  peptidoglycan glycosyltransferase  34.69 
 
 		 857 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.885871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4244  peptidoglycan glycosyltransferase  34.53 
 
 		 857 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0392  peptidoglycan glycosyltransferase  34.73 
 
 		 742 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.431383 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1659  peptidoglycan glycosyltransferase  34.53 
 
 		 862 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0514214  normal  0.169753 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2329  glycosyl transferase family protein  34.38 
 
 		 801 aa  400  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.212398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3770  peptidoglycan glycosyltransferase  34.38 
 
 		 870 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345724  normal  0.277872 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4259  peptidoglycan glycosyltransferase  33.92 
 
 		 888 aa  396  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.990931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5259  peptidoglycan glycosyltransferase  34.73 
 
 		 743 aa  399  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.297119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5014  peptidoglycan glycosyltransferase  34.58 
 
 		 743 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0205014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3108  peptidoglycan glycosyltransferase  34.73 
 
 		 743 aa  399  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3455  peptidoglycan glycosyltransferase  34.05 
 
 		 787 aa  394  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4618  glycosyl transferase family protein  34.73 
 
 		 728 aa  392  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5146  peptidoglycan glycosyltransferase  34.43 
 
 		 732 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.725403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1773  glycosyl transferase family penicillin-binding protein transpeptidase  35.52 
 
 		 698 aa  385  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.488731  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2084  peptidoglycan glycosyltransferase  34.44 
 
 		 675 aa  366  1e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2676  1A family penicillin-binding protein  30.03 
 
 		 795 aa  331  4e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.21019 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4231  penicillin-binding protein 1A  32.27 
 
 		 748 aa  322  1.9999999999999998e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0189  penicillin-binding protein, 1A family  28.99 
 
 		 827 aa  316  9.999999999999999e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1298  1A family penicillin-binding protein  28.33 
 
 		 833 aa  313  9e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.144183  normal  0.788784 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4406  1A family penicillin-binding protein  29.52 
 
 		 818 aa  313  1e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000928316  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0171  penicillin-binding protein, 1A family  28.82 
 
 		 829 aa  311  2e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000166752 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0324  penicillin-binding protein 1A  29.45 
 
 		 830 aa  311  2.9999999999999997e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5843  1A family penicillin-binding protein  29.52 
 
 		 808 aa  306  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.36925  normal  0.15552 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0354  penicillin-binding protein 1A  29.13 
 
 		 841 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.75585  normal  0.103015 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2078  penicillin-binding protein 1A  28.61 
 
 		 777 aa  305  3.0000000000000004e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0754  penicillin-binding protein, 1A family  30.67 
 
 		 796 aa  303  8.000000000000001e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3195  1A family penicillin-binding protein  29.3 
 
 		 773 aa  300  5e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0209  penicillin-binding protein 1A  30.01 
 
 		 771 aa  300  8e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3662  1A family penicillin-binding protein  28.4 
 
 		 833 aa  298  2e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3955  penicillin-binding protein, 1A family  28.4 
 
 		 805 aa  298  2e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.204833  normal  0.755336 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3949  penicillin-binding protein, 1A family  29.01 
 
 		 805 aa  298  2e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.665129 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6049  penicillin-binding protein, 1A family  29.65 
 
 		 805 aa  298  2e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141532  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0987  hypothetical protein  28.52 
 
 		 794 aa  297  5e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4359  1A family penicillin-binding protein  29.55 
 
 		 810 aa  297  5e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0956  hypothetical protein  28.52 
 
 		 794 aa  297  6e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2462  penicillin-binding protein 1A  30.24 
 
 		 791 aa  294  5e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2754  1A family penicillin-binding protein  27.16 
 
 		 800 aa  293  7e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2976  penicillin-binding 1 transmembrane protein  29.75 
 
 		 801 aa  292  1e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.893289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0366  1A family penicillin-binding protein  29 
 
 		 797 aa  292  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.941804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1936  penicillin-binding protein, 1A family  28.81 
 
 		 790 aa  291  3e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3274  penicillin-binding protein 1A  29.24 
 
 		 792 aa  291  3e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2720  penicillin-binding protein 1A  29 
 
 		 797 aa  291  3e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0387  1A family penicillin-binding protein  29 
 
 		 797 aa  291  3e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.495893  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3486  penicillin-binding protein 1A  29.14 
 
 		 796 aa  291  4e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0306  1A family penicillin-binding protein  28.97 
 
 		 797 aa  290  8e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3408  1A family penicillin-binding protein  28.73 
 
 		 766 aa  288  2e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000649652 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3022  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.43 
 
 		 817 aa  288  2e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.369948  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0290  1A family penicillin-binding protein  28.39 
 
 		 797 aa  287  4e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308967  normal  0.891054 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0324  penicillin-binding protein, 1A family  26.71 
 
 		 802 aa  287  4e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2266  1A family penicillin-binding protein  28.17 
 
 		 819 aa  287  4e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0315  1A family penicillin-binding protein  29.01 
 
 		 795 aa  287  4e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.640379 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0727  penicillin-binding protein, 1A family  29.02 
 
 		 804 aa  287  5.999999999999999e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3133  1A family penicillin-binding protein  27.4 
 
 		 796 aa  286  9e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0916  penicillin-binding protein 1A, putative  28.55 
 
 		 819 aa  285  2.0000000000000002e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.274618  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>