More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0147 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_05155  putative DNA mismatch repair protein MutS  58.71 
 
 		 869 aa  1055    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1219  DNA mismatch repair protein MutS  40.23 
 
 		 858 aa  635    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.34292  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  43.2 
 
 		 871 aa  689    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0095  DNA mismatch repair protein MutS  53.47 
 
 		 891 aa  961    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0480084 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  41.85 
 
 		 873 aa  640    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1033  DNA mismatch repair protein MutS  45.38 
 
 		 872 aa  745    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.256802  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1381  DNA mismatch repair protein MutS  42.73 
 
 		 862 aa  680    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1883  DNA mismatch repair protein MutS  60.72 
 
 		 858 aa  1099    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.245146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1709  DNA mismatch repair protein MutS  43.7 
 
 		 871 aa  725    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  41.74 
 
 		 869 aa  656    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0767  DNA mismatch repair protein MutS  62.73 
 
 		 863 aa  1136    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  43.71 
 
 		 872 aa  715    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  42.47 
 
 		 896 aa  686    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1599  DNA mismatch repair protein MutS  46.03 
 
 		 875 aa  771    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  43.53 
 
 		 869 aa  702    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  44.16 
 
 		 900 aa  681    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  42.92 
 
 		 863 aa  656    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2234  DNA mismatch repair protein MutS  43.52 
 
 		 894 aa  647    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.282824  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  43.4 
 
 		 870 aa  695    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1317  DNA mismatch repair protein MutS  47.01 
 
 		 873 aa  761    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0784135  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  44.66 
 
 		 872 aa  721    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0837  DNA mismatch repair protein MutS  44.97 
 
 		 878 aa  732    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1900  DNA mismatch repair protein MutS  57.76 
 
 		 868 aa  1052    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.419193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1753  DNA mismatch repair protein MutS  41.12 
 
 		 837 aa  643    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.581518  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  41.88 
 
 		 891 aa  660    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1896  DNA mismatch repair protein MutS  45.66 
 
 		 872 aa  736    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0824451  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  41.45 
 
 		 881 aa  638    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  42.59 
 
 		 932 aa  666    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  42.35 
 
 		 887 aa  703    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2983  DNA mismatch repair protein MutS  67.52 
 
 		 864 aa  1217    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.773158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  42.13 
 
 		 867 aa  646    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  41.61 
 
 		 882 aa  677    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  44.19 
 
 		 870 aa  728    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1542  DNA mismatch repair protein MutS  52.07 
 
 		 898 aa  867    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.883963  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  44.16 
 
 		 872 aa  709    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0147  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 		 856 aa  1768    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.692226  normal  0.372979 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1002  DNA mismatch repair protein  39.88 
 
 		 858 aa  647    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  41.67 
 
 		 859 aa  663    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0516  DNA mismatch repair protein MutS  67.32 
 
 		 886 aa  1203    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.544146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1723  DNA mismatch repair protein MutS  60.09 
 
 		 855 aa  1064    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0842  DNA mismatch repair protein MutS  58.01 
 
 		 860 aa  1027    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.899937  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  41.05 
 
 		 870 aa  646    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  41.47 
 
 		 889 aa  649    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1029  DNA mismatch repair protein MutS  40.65 
 
 		 858 aa  634  1e-180  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0324603  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  41.24 
 
 		 868 aa  635  1e-180  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1478  DNA mismatch repair protein MutS  41.63 
 
 		 828 aa  621  1e-176  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  39.51 
 
 		 857 aa  620  1e-176  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  41.2 
 
 		 853 aa  616  1e-175  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0919  DNA mismatch repair protein MutS  40.23 
 
 		 863 aa  618  1e-175  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1594  DNA mismatch repair protein MutS  39.65 
 
 		 871 aa  616  1e-175  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0845017  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1950  DNA mismatch repair protein MutS  40.18 
 
 		 872 aa  616  1e-175  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.998424  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4078  DNA mismatch repair protein MutS  38.67 
 
 		 928 aa  616  1e-175  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980246  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2743  DNA mismatch repair protein MutS  39.71 
 
 		 868 aa  615  9.999999999999999e-175  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0346  DNA mismatch repair protein MutS  41.22 
 
 		 823 aa  613  9.999999999999999e-175  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0580477  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  41.13 
 
 		 887 aa  613  9.999999999999999e-175  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2247  DNA mismatch repair protein MutS  40.65 
 
 		 882 aa  609  1e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136567  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0834  DNA mismatch repair protein MutS  38.95 
 
 		 884 aa  608  9.999999999999999e-173  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.63588 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0978  DNA mismatch repair protein MutS  38.95 
 
 		 884 aa  608  9.999999999999999e-173  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0621  DNA mismatch repair protein MutS  38.59 
 
 		 859 aa  605  9.999999999999999e-173  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.947929  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1485  DNA mismatch repair protein MutS  40.3 
 
 		 878 aa  607  9.999999999999999e-173  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2735  DNA mismatch repair protein MutS  40.62 
 
 		 850 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  40.25 
 
 		 868 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2087  DNA mismatch repair protein MutS  37.17 
 
 		 874 aa  605  1.0000000000000001e-171  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104539  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3422  DNA mismatch repair protein MutS  39.57 
 
 		 880 aa  603  1.0000000000000001e-171  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0998408  normal  0.0667766 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  38.72 
 
 		 910 aa  603  1.0000000000000001e-171  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  41.72 
 
 		 882 aa  605  1.0000000000000001e-171  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0935  DNA mismatch repair protein MutS  41.17 
 
 		 874 aa  602  1e-170  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1113  DNA mismatch repair protein MutS  43.23 
 
 		 863 aa  599  1e-170  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000302948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  38.66 
 
 		 910 aa  601  1e-170  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1061  DNA mismatch repair protein MutS  39.39 
 
 		 861 aa  601  1e-170  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4137  DNA mismatch repair protein MutS  38.67 
 
 		 872 aa  598  1e-169  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.757749  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2157  DNA mismatch repair protein MutS  40.76 
 
 		 882 aa  596  1e-169  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.404203  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1925  DNA mismatch repair protein MutS  40.62 
 
 		 865 aa  595  1e-169  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1698  DNA mismatch repair protein MutS  41.63 
 
 		 882 aa  597  1e-169  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1214  DNA mismatch repair protein MutS  38.26 
 
 		 855 aa  596  1e-169  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  39.18 
 
 		 860 aa  595  1e-168  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2107  DNA mismatch repair protein MutS  41.29 
 
 		 882 aa  593  1e-168  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0317076 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0986  DNA mismatch repair protein MutS  39.01 
 
 		 871 aa  593  1e-168  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0879  DNA mismatch repair protein MutS  38.89 
 
 		 859 aa  593  1e-168  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1207  DNA mismatch repair protein MutS  39.47 
 
 		 862 aa  595  1e-168  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3341  DNA mismatch repair protein MutS  39.26 
 
 		 858 aa  595  1e-168  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.285192  unclonable  0.0000000411572 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2125  DNA mismatch repair protein MutS  41.4 
 
 		 897 aa  595  1e-168  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0565829  normal  0.043993 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03081  DNA mismatch repair protein(MutS)  38.76 
 
 		 863 aa  592  1e-167  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0008  DNA mismatch repair protein MutS  38.53 
 
 		 848 aa  589  1e-167  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3186  DNA mismatch repair protein MutS  40.51 
 
 		 854 aa  590  1e-167  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0251089 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1194  DNA mismatch repair protein MutS  37.92 
 
 		 859 aa  591  1e-167  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0412  DNA mismatch repair protein MutS  40.22 
 
 		 857 aa  589  1e-167  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3734  DNA mismatch repair protein MutS  37.53 
 
 		 883 aa  586  1e-166  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648477  decreased coverage  0.000000000582755 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1299  DNA mismatch repair protein MutS  38.43 
 
 		 859 aa  588  1e-166  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.537227  hitchhiker  0.00000000408163 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0948  DNA mismatch repair protein MutS  38.58 
 
 		 868 aa  588  1e-166  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2421  DNA mismatch repair protein MutS  39.88 
 
 		 895 aa  587  1e-166  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3118  DNA mismatch repair protein MutS  38.35 
 
 		 856 aa  587  1e-166  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3127  DNA mismatch repair protein MutS  38.41 
 
 		 856 aa  587  1e-166  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407005  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1125  DNA mismatch repair protein MutS  38.7 
 
 		 861 aa  588  1e-166  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3270  DNA mismatch repair protein MutS  38.47 
 
 		 856 aa  588  1e-166  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.820026  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38640  DNA mismatch repair protein MutS  38.93 
 
 		 855 aa  585  1.0000000000000001e-165  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.477357  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2957  DNA mismatch repair protein MutS  38.86 
 
 		 854 aa  585  1.0000000000000001e-165  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3226  DNA mismatch repair protein MutS  38.16 
 
 		 892 aa  585  1.0000000000000001e-165  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1124  DNA mismatch repair protein MutS  38.59 
 
 		 861 aa  585  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1195  DNA mismatch repair protein MutS  38.47 
 
 		 861 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>