More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0130 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0130  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  100 
 
 
401 aa  830    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0750166  normal  0.238012 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3841  amidohydrolase  66.67 
 
 
397 aa  572  1.0000000000000001e-162  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.677455 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4957  amidohydrolase  66.41 
 
 
395 aa  572  1.0000000000000001e-162  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00657786 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0273  amidohydrolase  66.24 
 
 
395 aa  551  1e-156  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1096  hypothetical protein  59.34 
 
 
400 aa  486  1e-136  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081293 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7287  amidohydrolase  59.49 
 
 
391 aa  488  1e-136  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0545  amidohydrolase  51.01 
 
 
400 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.502241  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1020  peptidase M20D, amidohydrolase  43.96 
 
 
407 aa  346  3e-94  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0205344 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1361  amidohydrolase  43.8 
 
 
405 aa  345  1e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1324  amidohydrolase  43.72 
 
 
410 aa  339  5.9999999999999996e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0903  peptidase M20D, amidohydrolase  44.07 
 
 
409 aa  336  3.9999999999999995e-91  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1044  amidohydrolase  44.42 
 
 
408 aa  331  1e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210114  unclonable  0.00000194036 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1254  amidohydrolase  42.86 
 
 
404 aa  328  9e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.226068  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0066  amidohydrolase  42.89 
 
 
390 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1330  amidohydrolase  42.05 
 
 
407 aa  324  2e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1225  amidohydrolase family protein  43.33 
 
 
398 aa  316  4e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0413476  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1415  amidohydrolase family protein  43.34 
 
 
398 aa  313  3.9999999999999997e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486637  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0528  amidohydrolase  44.19 
 
 
390 aa  310  2e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3743  carboxypeptidase  40.05 
 
 
465 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3816  carboxypeptidase  40.05 
 
 
465 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0302  amidohydrolase  40.05 
 
 
437 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2791  amidohydrolase  42.6 
 
 
390 aa  305  8.000000000000001e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3340  amidohydrolase  41.18 
 
 
394 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4430  amidohydrolase  41.18 
 
 
403 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0208  amidohydrolase  39.9 
 
 
466 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.132335  normal  0.813004 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3557  amidohydrolase  41.6 
 
 
405 aa  303  4.0000000000000003e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0217903 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0256  peptidase M20D, amidohydrolase  42.18 
 
 
408 aa  303  4.0000000000000003e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1491  amidohydrolase  39.95 
 
 
396 aa  303  4.0000000000000003e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2218  peptidase M20D, amidohydrolase  41.01 
 
 
405 aa  302  5.000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3175  amidohydrolase  41.69 
 
 
394 aa  302  5.000000000000001e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4368  amidohydrolase  40.91 
 
 
403 aa  301  1e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2714  amidohydrolase  41.18 
 
 
449 aa  301  1e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0259  amidohydrolase  39.95 
 
 
435 aa  300  4e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0605709 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1843  amidohydrolase  41.08 
 
 
405 aa  299  5e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4131  amidohydrolase  39.75 
 
 
471 aa  298  9e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4257  amidohydrolase  39.51 
 
 
465 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.15916 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0206  amidohydrolase  39.51 
 
 
471 aa  297  2e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.196253  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3941  carboxypeptidase  39.66 
 
 
470 aa  297  2e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1059  peptidase M20D, amidohydrolase  40 
 
 
392 aa  296  6e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996259  decreased coverage  0.0000027158 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0017  amidohydrolase  41.12 
 
 
394 aa  294  2e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1597  amidohydrolase  41.21 
 
 
399 aa  293  3e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0486539 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3487  peptidase M20D, amidohydrolase  40.4 
 
 
435 aa  291  1e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00054557  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4369  amidohydrolase  40.21 
 
 
405 aa  290  3e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0982  amidohydrolase  40.52 
 
 
404 aa  289  5.0000000000000004e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4224  amidohydrolase  40 
 
 
391 aa  288  1e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000104143  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1431  amidohydrolase  41.22 
 
 
396 aa  288  1e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00950334  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3266  amidohydrolase  39.3 
 
 
438 aa  288  1e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.309281 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3690  amidohydrolase  39.33 
 
 
400 aa  287  2.9999999999999996e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.824469 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2091  amidohydrolase  39.44 
 
 
395 aa  286  5e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000150957 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0493  amidohydrolase  41.9 
 
 
391 aa  286  5e-76  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.642244  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4687  amidohydrolase  39.38 
 
 
395 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2073  amidohydrolase  40.25 
 
 
393 aa  282  8.000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1764  amidohydrolase  42.67 
 
 
389 aa  281  1e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1358  carboxypeptidase  37.77 
 
 
459 aa  281  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03984  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  39.04 
 
 
438 aa  281  2e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1988  amidohydrolase  40.38 
 
 
399 aa  280  4e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000688604  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2420  amidohydrolase  39.74 
 
 
398 aa  279  5e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.797936  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2708  amidohydrolase  39.4 
 
 
415 aa  279  5e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6019  amidohydrolase  40.82 
 
 
389 aa  279  6e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00571  Peptidase M20D, amidohydrolase  38.52 
 
 
432 aa  279  6e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1263  aminoacylase (N-acyl-L-amino acid amidohydrolase)  38.62 
 
 
389 aa  278  9e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.804068  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2224  amidohydrolase  41.48 
 
 
396 aa  278  1e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.355102  normal  0.809475 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0022  amidohydrolase  42.74 
 
 
380 aa  278  1e-73  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  40.89 
 
 
389 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1289  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  38.62 
 
 
389 aa  278  2e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1261  aminoacylase (N-acyl-L-amino acid amidohydrolase)  38.62 
 
 
389 aa  277  2e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1426  aminoacylase  38.89 
 
 
389 aa  277  2e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1532  aminoacylase  38.36 
 
 
389 aa  277  2e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1392  n-acyl-l-amino acid amidohydrolase  38.62 
 
 
389 aa  278  2e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  40.64 
 
 
403 aa  277  2e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0207  amidohydrolase  37.5 
 
 
480 aa  278  2e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1258  peptidase M20D, amidohydrolase  39.55 
 
 
431 aa  276  4e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.248557  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0570  amidohydrolase  39.54 
 
 
392 aa  276  4e-73  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1490  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  38.89 
 
 
389 aa  276  5e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06010  amidohydrolase  39.21 
 
 
413 aa  276  5e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.842798  normal  0.268708 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  40.72 
 
 
387 aa  275  7e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0586  amidohydrolase  40.15 
 
 
391 aa  275  7e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0572  amidohydrolase  40.15 
 
 
391 aa  275  7e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.176394  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1463  aminoacylase  38.36 
 
 
389 aa  275  8e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  39.43 
 
 
389 aa  275  9e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3918  aminoacylase  38.89 
 
 
389 aa  275  9e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0190  amidohydrolase family protein  39.25 
 
 
389 aa  274  2.0000000000000002e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0261019  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1178  amidohydrolase  38.54 
 
 
398 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1094  amidohydrolase  39.58 
 
 
394 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2667  peptidase M20D, amidohydrolase  42.24 
 
 
404 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1205  amidohydrolase  38.54 
 
 
398 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.811982  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3491  amidohydrolase  41.1 
 
 
403 aa  273  3e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207753  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0004  amidohydrolase  39.9 
 
 
399 aa  273  3e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.209653  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4586  putative amidohydrolase family protein  41.28 
 
 
389 aa  273  5.000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  39.95 
 
 
387 aa  272  6e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3877  amidohydrolase  36.9 
 
 
402 aa  272  7e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0606835  normal  0.924655 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0021  peptidase M20D, amidohydrolase  40 
 
 
425 aa  272  8.000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3677  amidohydrolase  38.52 
 
 
399 aa  271  1e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  40 
 
 
387 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1222  amidohydrolase  38.5 
 
 
393 aa  270  4e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115214  normal  0.142567 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  39.48 
 
 
387 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5885  amidohydrolase  39.47 
 
 
449 aa  269  5.9999999999999995e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1296  amidohydrolase  37.17 
 
 
392 aa  269  7e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.224852  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  39.48 
 
 
387 aa  269  8e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  39.74 
 
 
387 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>