More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0123 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0123  Fe-S oxidoreductase, dehydrogenase subunit  100 
 
 
262 aa  543  1e-153  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.920784 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4016  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  75 
 
 
265 aa  429  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.112727  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5544  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  73.85 
 
 
267 aa  428  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0746  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  72.14 
 
 
266 aa  409  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.30347  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5887  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  70.87 
 
 
259 aa  396  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4582  hypothetical protein  68.99 
 
 
263 aa  387  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11058  putative iron-sulfur-binding reductase  67.44 
 
 
262 aa  381  1e-105  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0507  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  67.19 
 
 
257 aa  378  1e-104  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.757481  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3765  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  51.16 
 
 
712 aa  285  5e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0441363  normal  0.184331 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1700  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  54.03 
 
 
683 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.102017  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1777  hypothetical protein  53.39 
 
 
678 aa  279  3e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4528  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  50.97 
 
 
694 aa  276  2e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3646  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  50 
 
 
694 aa  276  2e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2860  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  50 
 
 
699 aa  270  2e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4809  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  50.95 
 
 
762 aa  268  1e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26190  Fe-S oxidoreductase  49.6 
 
 
1388 aa  259  4e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0051  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  49.18 
 
 
676 aa  256  3e-67  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3345  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  48.26 
 
 
699 aa  255  4e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000110964  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0242  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  47.35 
 
 
717 aa  255  6e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5262  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  47.21 
 
 
737 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0261  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  47.23 
 
 
748 aa  254  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.618986  normal  0.510874 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0238  hypothetical protein  48.99 
 
 
739 aa  253  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.855121  normal  0.712535 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3407  hypothetical protein  47.73 
 
 
699 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5473  CoB--CoM heterodisulfide reductase  49.59 
 
 
737 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3454  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  47.88 
 
 
698 aa  253  3e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0071  hypothetical protein  48.67 
 
 
727 aa  253  3e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4350  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  49.39 
 
 
743 aa  252  3e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5143  hypothetical protein  45.95 
 
 
703 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38640  Fe-S oxidoreductase  48.12 
 
 
762 aa  252  4.0000000000000004e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5476  ferredoxin, 4Fe-4S  45.95 
 
 
703 aa  252  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5194  ferredoxin, 4Fe-4S  45.95 
 
 
703 aa  252  5.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0190376  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5029  ferredoxin, 4Fe-4S  45.95 
 
 
703 aa  252  5.000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5045  ferredoxin, 4Fe-4S  45.95 
 
 
703 aa  252  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.047294  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5438  ferredoxin, 4Fe-4S  45.95 
 
 
703 aa  252  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0164712 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5590  ferredoxin, 4Fe-4S  45.95 
 
 
703 aa  252  5.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5484  ferredoxin, 4Fe-4S  45.95 
 
 
629 aa  252  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00120718  hitchhiker  1.1586099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9137  hypothetical protein  50.2 
 
 
716 aa  252  5.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.793292 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5468  ferredoxin, 4Fe-4S  45.95 
 
 
703 aa  252  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000379951  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5523  ferredoxin, 4Fe-4S  45.95 
 
 
703 aa  252  6e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1593  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  49.43 
 
 
722 aa  251  7e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.910394  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0008  hypothetical protein  46.92 
 
 
711 aa  251  8.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1856  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  44.44 
 
 
686 aa  251  1e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0059  hypothetical protein  47.21 
 
 
718 aa  250  2e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.149051  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0008  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  46.54 
 
 
711 aa  249  3e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.787604  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0207  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  48.75 
 
 
774 aa  249  3e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.987392 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0009  hypothetical protein  47.79 
 
 
678 aa  249  3e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0195  putative iron-sulphur-binding reductase  48.11 
 
 
716 aa  249  4e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0008  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  47.39 
 
 
711 aa  249  4e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6953  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  48.21 
 
 
758 aa  248  7e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3866  hypothetical protein  45.56 
 
 
703 aa  248  8e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00245399  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0054  hypothetical protein  46.84 
 
 
732 aa  248  9e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0451564  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0278  hypothetical protein  46.86 
 
 
1044 aa  245  4e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4404  hypothetical protein  46.42 
 
 
1033 aa  246  4e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.326408  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2474  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  48.37 
 
 
721 aa  243  3e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2113  hypothetical protein  48.75 
 
 
683 aa  239  2e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.177792 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0619  hypothetical protein  46.13 
 
 
1027 aa  239  2e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.321206  normal  0.108108 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0465  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  46.18 
 
 
1131 aa  239  4e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0442  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  45.76 
 
 
1046 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0429  hypothetical protein  45.76 
 
 
1042 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.811487  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0452  hypothetical protein  45.76 
 
 
1046 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.506631  normal  0.0226595 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0809  hypothetical protein  45.42 
 
 
727 aa  235  6e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0335326 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0685  hypothetical protein  46.69 
 
 
659 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.808103  normal  0.989456 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1213  hypothetical protein  47.15 
 
 
661 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0874  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  42.16 
 
 
989 aa  232  4.0000000000000004e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  normal  0.996162 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2255  hypothetical protein  46.47 
 
 
655 aa  232  5e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000010012  hitchhiker  0.0000000000013579 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4337  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  44.65 
 
 
1215 aa  231  8.000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4457  hypothetical protein  43.51 
 
 
730 aa  231  9e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458302  normal  0.390978 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2065  hypothetical protein  45.04 
 
 
658 aa  229  4e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.810314 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4458  hypothetical protein  43.73 
 
 
752 aa  228  7e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000771252  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2795  iron-sulfur cluster-binding protein  44.81 
 
 
661 aa  227  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.623048  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1468  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  47.52 
 
 
656 aa  227  2e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0698  putative iron-sulfur-binding reductase  45.88 
 
 
714 aa  226  4e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0314835  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2621  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  41.22 
 
 
713 aa  225  7e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2785  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  47.52 
 
 
656 aa  224  1e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2367  hypothetical protein  42.21 
 
 
683 aa  223  2e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2426  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  41 
 
 
679 aa  221  6e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1527  hypothetical protein  46.72 
 
 
654 aa  221  7e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.583345 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2414  hypothetical protein  44.81 
 
 
652 aa  221  7e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0570  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  45.04 
 
 
655 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0837064  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2925  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  44.4 
 
 
658 aa  219  3e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1382  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  42.5 
 
 
722 aa  219  5e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2831  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  41.53 
 
 
714 aa  218  7e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1359  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  43.57 
 
 
658 aa  218  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.548906  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10343  iron-sulfur-binding reductase  44.61 
 
 
882 aa  216  2e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.557854  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1463  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  41.67 
 
 
662 aa  216  2e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1035  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  40.82 
 
 
661 aa  214  8e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1502  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  45.54 
 
 
664 aa  214  9e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2714  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  45.54 
 
 
664 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.793769 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2791  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  39.76 
 
 
662 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.589243 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1714  hypothetical protein  41.06 
 
 
671 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1600  hypothetical protein  42.92 
 
 
661 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3039  hypothetical protein  42.17 
 
 
661 aa  212  3.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2087  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  42.15 
 
 
663 aa  210  1e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.371437  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3229  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  39.59 
 
 
661 aa  209  3e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2131  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  41.63 
 
 
663 aa  207  1e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000140494 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2070  hypothetical protein  41.25 
 
 
663 aa  207  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000208921  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2264  hypothetical protein  39.53 
 
 
661 aa  206  3e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.968326  hitchhiker  0.00000860072 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1051  hypothetical protein  38.43 
 
 
390 aa  205  8e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.132653 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2808  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  40.16 
 
 
383 aa  196  3e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1721  hypothetical protein  42.52 
 
 
549 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.180785 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>