More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0106 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0106  membrane-associated sensory histidine kinase-like ATPase  100 
 
 
632 aa  1277    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.100844  normal  0.392929 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1316  sensor histidine protein kinase  37.92 
 
 
525 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.176896  normal  0.0650582 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0699  histidine kinase  34.59 
 
 
526 aa  134  6e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00253859  normal  0.376247 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2056  histidine kinase  38.07 
 
 
475 aa  134  6.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0708  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 
553 aa  124  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5408  histidine kinase  37.16 
 
 
494 aa  121  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0406252  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1265  two-component sensor histidine kinase  33.33 
 
 
585 aa  121  3.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6528  histidine kinase  34.98 
 
 
592 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2388  histidine kinase  37.67 
 
 
653 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255891  normal  0.393123 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5497  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.92 
 
 
459 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170786 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4945  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.92 
 
 
459 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0549839 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4277  histidine kinase  35.47 
 
 
659 aa  118  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.186124 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4503  histidine kinase  33.96 
 
 
643 aa  118  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.604782 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3669  histidine kinase  27.27 
 
 
489 aa  117  5e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1697  histidine kinase  33.17 
 
 
664 aa  117  6e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.182651 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1809  histidine kinase  23.2 
 
 
640 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.12 
 
 
459 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.134921 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2136  histidine kinase  35.61 
 
 
638 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.204065  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1231  histidine kinase  26.9 
 
 
482 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1399  PAS  32.9 
 
 
683 aa  114  5e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.04458 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6398  histidine kinase  33.03 
 
 
461 aa  114  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.176497 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0301  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.41 
 
 
748 aa  114  5e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4714  Two-component sensor histidine kinase  33.72 
 
 
447 aa  113  9e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4564  histidine kinase  31.58 
 
 
460 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.562879  normal  0.0736505 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0027  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
461 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.755533 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5844  histidine kinase  31.78 
 
 
270 aa  112  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5188  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 
480 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0357  sensor histidine kinase  31.6 
 
 
459 aa  112  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5671  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 
480 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0241273 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.47 
 
 
485 aa  112  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12569  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2111  ATP-binding region ATPase domain protein  31.51 
 
 
645 aa  111  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.184163  normal  0.230765 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1462  sensor kinase protein  31.67 
 
 
466 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2334  sensor histidine kinase  31.8 
 
 
470 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3247  putative sensor histidine kinase  31.67 
 
 
466 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1193  histidine kinase  25.53 
 
 
497 aa  110  6e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0280854  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1573  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  33.49 
 
 
373 aa  110  6e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3132  putative sensor histidine kinase  31.54 
 
 
466 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2344  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 
480 aa  110  7.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.165919 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5015  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.51 
 
 
399 aa  110  7.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.324397 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0560  histidine kinase  31.73 
 
 
670 aa  110  8.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.618015  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0895  sensor histidine kinase  33.5 
 
 
451 aa  110  9.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.622783  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2070  sensor histidine kinase  31.25 
 
 
466 aa  109  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2961  ATP-binding region ATPase domain protein  32.05 
 
 
645 aa  110  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.10084  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.97 
 
 
471 aa  110  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629472  normal  0.491206 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 
478 aa  109  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.304751 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1378  sensor histidine kinase  31.25 
 
 
466 aa  109  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.922617  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1099  sensor histidine kinase  31.25 
 
 
466 aa  109  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2159  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 
439 aa  109  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0525823 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0746  histidine kinase  34.32 
 
 
387 aa  108  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  32.06 
 
 
325 aa  109  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0789  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 
469 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2363  sensor histidine kinase  31.25 
 
 
466 aa  109  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2388  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 
535 aa  109  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.219764  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4528  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 
461 aa  108  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25442  normal  0.575982 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1055  diguanylate cyclase  34.32 
 
 
598 aa  108  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6559  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 
541 aa  108  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.59439 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2311  putative two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  33.8 
 
 
383 aa  107  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.615957  normal  0.235814 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2912  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.42 
 
 
339 aa  107  6e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3230  sensory box histidine kinase  29.83 
 
 
518 aa  107  7e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4477  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 
471 aa  107  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5078  histidine kinase  30.46 
 
 
368 aa  107  7e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.9788 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3575  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 
475 aa  107  9e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2416  histidine kinase  32.13 
 
 
344 aa  106  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2464  ATPase domain-containing protein  32.13 
 
 
344 aa  106  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.47 
 
 
541 aa  106  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.163324  normal  0.507763 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3748  histidine kinase  33.05 
 
 
287 aa  105  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06640  histidine kinase  30.8 
 
 
404 aa  105  3e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.106239  normal  0.143286 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3937  histidine kinase  33.06 
 
 
366 aa  105  4e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0383335  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2882  two-component hybrid sensor and regulator  28.57 
 
 
740 aa  104  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1872  sensor histidine kinase  31.28 
 
 
1046 aa  104  5e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4627  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
603 aa  103  7e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5914  histidine kinase  31.03 
 
 
288 aa  103  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0349357  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2510  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 
640 aa  103  8e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1580  histidine kinase  30.59 
 
 
349 aa  103  9e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1345  putative membrane sensor histidine kinase  30.21 
 
 
575 aa  103  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1847  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 
509 aa  103  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.645356  normal  0.352228 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5200  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 
695 aa  103  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.49 
 
 
490 aa  103  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1215  PAS  27 
 
 
515 aa  103  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3418  sensor histidine kinase  29.07 
 
 
481 aa  103  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.986219  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1268  histidine kinase  32.71 
 
 
392 aa  103  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3993  histidine kinase  30.67 
 
 
456 aa  103  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3668  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.54 
 
 
650 aa  103  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1485  two-component hybrid sensor and regulator  29.79 
 
 
575 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1352  putative membrane sensor histidine kinase  29.79 
 
 
575 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4515  two-component regulatory system sensory histidine kinase  28.05 
 
 
383 aa  102  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0377261  normal  0.0581519 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.86 
 
 
682 aa  102  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1232  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 
334 aa  102  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380961  normal  0.783946 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003135  sensor histidine kinase  31.62 
 
 
451 aa  102  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.291514  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1783  histidine kinase  30.92 
 
 
501 aa  102  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211372 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0877  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 
474 aa  102  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.858486  normal  0.37178 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2291  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 
464 aa  102  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4381  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.39 
 
 
372 aa  102  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01020  sensory box histidine kinase  31.14 
 
 
710 aa  101  4e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0755055  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0893  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.74 
 
 
359 aa  101  4e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06146  sensory box histidine kinase  31.14 
 
 
710 aa  101  4e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0682167  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5452  sensor histidine kinase  31.63 
 
 
556 aa  101  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0674  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 
447 aa  101  5e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.504244  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1988  putative signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 
479 aa  100  7e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00146198  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1357  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.88 
 
 
403 aa  100  8e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246673  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>