More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0089 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0089  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 957 aa  1960    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5439  TonB-dependent receptor plug  36.91 
 
 		 962 aa  589  1e-167  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.648524  normal  0.961509 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4228  TonB-dependent receptor plug  37.16 
 
 		 931 aa  584  1.0000000000000001e-165  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0830  TonB-dependent receptor  29.52 
 
 		 933 aa  410  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.926876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0176  TonB-dependent receptor  31.13 
 
 		 924 aa  374  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1988  TonB-dependent receptor plug  28.49 
 
 		 1003 aa  301  3e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.485528  normal  0.175493 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3601  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 1090 aa  281  5e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000169408  hitchhiker  0.00028286 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2560  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 		 957 aa  279  2e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.184362  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3857  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 		 1077 aa  221  5e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0313  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 		 897 aa  209  2e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.552035  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3993  TonB-dependent receptor  25.12 
 
 		 897 aa  202  3e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.494791  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2575  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 897 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.118608 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0379  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 		 888 aa  199  2.0000000000000003e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0418446  normal  0.660962 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01815  TonB-dependent receptor  23.99 
 
 		 927 aa  193  1e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3580  TonB-dependent receptor, plug  24.53 
 
 		 894 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0553281  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03436  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 		 856 aa  181  8e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0545  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 922 aa  176  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6376  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 920 aa  163  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1716  TonB-dependent receptor  22.91 
 
 		 1051 aa  139  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.854404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4721  TonB-dependent receptor  27.38 
 
 		 917 aa  127  9e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2398  TonB-dependent receptor plug  29.54 
 
 		 932 aa  122  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0532  TonB-dependent receptor  23.17 
 
 		 936 aa  116  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0904706  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2523  TonB-dependent receptor  29.08 
 
 		 943 aa  114  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2207  TonB-dependent receptor  29.48 
 
 		 944 aa  113  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2082  TonB-dependent receptor  30.59 
 
 		 942 aa  111  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1893  TonB-dependent receptor  30.43 
 
 		 941 aa  107  7e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.175561 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02398  putative tonB-dependent receptor  30.36 
 
 		 901 aa  103  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.835744  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0637  TonB-dependent receptor  30.35 
 
 		 916 aa  101  6e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0978738  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1056  TonB-dependent receptor  39.42 
 
 		 888 aa  101  6e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0268559  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2111  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 917 aa  100  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1368  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 		 962 aa  99.4  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2438  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 		 892 aa  97.8  9e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.615124  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4000  hypothetical protein  28.09 
 
 		 972 aa  92.8  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.463681 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1557  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 853 aa  92.4  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1535  TonB-dependent receptor  29.41 
 
 		 972 aa  92  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.39302  normal  0.5632 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1034  TonB-dependent receptor  29.05 
 
 		 938 aa  92  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1070  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 991 aa  91.3  7e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1493  outer membrane protein  31.13 
 
 		 929 aa  91.3  8e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.684854  normal  0.108065 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0102  TonB-dependent receptor  28.51 
 
 		 946 aa  87.8  9e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.436886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2444  TonB-dependent receptor  28.51 
 
 		 1001 aa  87.4  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2472  TonB-dependent receptor  25.66 
 
 		 1004 aa  87.4  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1121  TonB-dependent receptor plug  31.19 
 
 		 919 aa  86.7  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3988  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 		 945 aa  85.9  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.647159  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0295  TonB-dependent receptor  38.51 
 
 		 964 aa  86.3  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.050609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0122  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 964 aa  84.7  0.000000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00390144  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00302  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 746 aa  84.3  0.000000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0777336  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4064  TonB-dependent receptor  31.25 
 
 		 836 aa  82  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.200466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2369  TonB-dependent receptor  23.42 
 
 		 935 aa  82  0.00000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.415062 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1968  TonB-dependent receptor  31.75 
 
 		 828 aa  80.9  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04960  TonB-dependent receptor  31.62 
 
 		 842 aa  80.9  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.143885  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3242  TonB-dependent receptor, putative  29.85 
 
 		 838 aa  80.1  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3110  TonB-dependent receptor  26.64 
 
 		 943 aa  79.3  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.183565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0332  TonB-dependent receptor  24.52 
 
 		 869 aa  77  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879303  normal  0.710919 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 836 aa  72  0.00000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  33.09 
 
 		 894 aa  70.9  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4146  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 		 961 aa  70.5  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0960595  normal  0.432652 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1282  TonB-dependent receptor  24.64 
 
 		 852 aa  69.7  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0691192  normal  0.241515 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3514  TonB-dependent receptor  33.78 
 
 		 874 aa  69.3  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1097  TonB-dependent receptor  32.43 
 
 		 869 aa  68.9  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1171  TonB-dependent receptor  32.03 
 
 		 888 aa  69.3  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.527297  normal  0.739172 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2872  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 		 934 aa  68.6  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.15635  normal  0.94613 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  30.23 
 
 		 927 aa  68.2  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3024  TonB-dependent receptor  29.26 
 
 		 874 aa  68.2  0.0000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.673188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5762  hypothetical protein  28.44 
 
 		 965 aa  68.2  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  33.83 
 
 		 934 aa  67.8  0.0000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  33.09 
 
 		 958 aa  67.4  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1161  TonB-dependent receptor  25.33 
 
 		 935 aa  67.4  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880371  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4269  TonB-dependent receptor, plug  23.7 
 
 		 797 aa  66.6  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  27.92 
 
 		 1066 aa  67  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5164  TonB-dependent receptor  29.1 
 
 		 813 aa  67  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2204  TonB-dependent receptor  30.26 
 
 		 845 aa  67  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4091  outer membrane insertion C-terminal signal  32.37 
 
 		 919 aa  67  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.798393 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0181  TonB-dependent receptor  35.11 
 
 		 911 aa  66.6  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.331528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1305  TonB-dependent receptor  29.41 
 
 		 900 aa  66.6  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.988822 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  32.59 
 
 		 1097 aa  66.6  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5196  TonB-dependent receptor  25.78 
 
 		 829 aa  66.6  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.283017  normal  0.121855 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1112  TonB-dependent receptor  31.37 
 
 		 874 aa  66.6  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  31.03 
 
 		 915 aa  66.2  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1208  TonB-dependent receptor  31.17 
 
 		 870 aa  65.9  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.888079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1074  TonB-dependent receptor  31.37 
 
 		 872 aa  65.9  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.834793  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  34.53 
 
 		 914 aa  65.9  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3698  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 961 aa  65.5  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3278  TonB-dependent receptor  27.94 
 
 		 973 aa  65.5  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02336  TonB-dependent receptor  22.44 
 
 		 889 aa  65.1  0.000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0825116  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6739  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 832 aa  65.1  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.616271  normal  0.465298 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0304  TonB-dependent receptor  29.35 
 
 		 880 aa  64.7  0.000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1021  TonB-dependent receptor  29.87 
 
 		 845 aa  64.7  0.000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0889  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  30.08 
 
 		 992 aa  64.3  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000114339  unclonable  0.0000000138215 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2209  outer membrane insertion C-terminal signal  28.8 
 
 		 908 aa  63.9  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.368358  hitchhiker  0.00248616 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2085  outer membrane insertion C-terminal signal  27.47 
 
 		 908 aa  64.3  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1467  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 802 aa  64.3  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.148814  normal  0.0599921 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  31.43 
 
 		 951 aa  63.9  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  29.94 
 
 		 1147 aa  63.9  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  31.43 
 
 		 951 aa  63.9  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3396  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 881 aa  63.5  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2029  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 908 aa  63.5  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2708  TonB-dependent receptor  29.05 
 
 		 882 aa  63.2  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0443118  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2944  TonB-dependent receptor plug  25.21 
 
 		 878 aa  63.2  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1437  TonB-dependent receptor plug  25.21 
 
 		 878 aa  63.5  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2300  outer membrane insertion C-terminal signal  27.47 
 
 		 908 aa  63.5  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417684  normal  0.431246 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>