152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0088 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0088  transmembrane protein  100 
 
 		 190 aa  377  1e-104  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1039  hypothetical protein  37.84 
 
 		 186 aa  141  5e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0164  hypothetical protein  42.93 
 
 		 212 aa  136  2e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1141  protein of unknown function DUF502  39.68 
 
 		 214 aa  119  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.280818  normal  0.107608 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3031  protein of unknown function DUF502  32.29 
 
 		 197 aa  114  6e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.21839  hitchhiker  0.00579514 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0976  protein of unknown function DUF502  37.5 
 
 		 206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5011  protein of unknown function DUF502  34.39 
 
 		 207 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1880  protein of unknown function DUF502  31.44 
 
 		 198 aa  107  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000754337  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2407  protein of unknown function DUF502  30.53 
 
 		 197 aa  106  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2258  protein of unknown function DUF502  30.85 
 
 		 198 aa  101  7e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.260414 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2747  hypothetical protein  31.94 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0319017  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0597  hypothetical protein  30.57 
 
 		 229 aa  91.7  5e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0143  hypothetical protein  29 
 
 		 201 aa  91.7  6e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.419695  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1143  protein of unknown function DUF502  29.08 
 
 		 217 aa  85.9  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2706  hypothetical protein  29.08 
 
 		 219 aa  84  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0607  protein of unknown function DUF502  34.55 
 
 		 231 aa  84  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0446  hypothetical protein  34.55 
 
 		 231 aa  84  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.371395  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2731  hypothetical protein  28.95 
 
 		 192 aa  81.3  0.000000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0836269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1038  hypothetical protein  26.11 
 
 		 213 aa  79  0.00000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1789  protein of unknown function DUF502  28.42 
 
 		 203 aa  79  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.858117  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0363  hypothetical protein  29.84 
 
 		 193 aa  79  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0266005  normal  0.517964 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1551  hypothetical protein  30.21 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1102  protein of unknown function DUF502  29.7 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.771192  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0268  hypothetical protein  29.63 
 
 		 213 aa  77.4  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.130221  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1433  hypothetical protein  31.25 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0474  protein of unknown function DUF502  23.98 
 
 		 225 aa  75.1  0.0000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0103134  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3463  hypothetical protein  31.25 
 
 		 200 aa  74.7  0.0000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.286648  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0427  hypothetical membrane spanning protein  29.1 
 
 		 209 aa  73.9  0.000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.811019  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1746  hypothetical protein  29.1 
 
 		 209 aa  73.9  0.000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.120309  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1826  hypothetical protein  28.71 
 
 		 232 aa  73.2  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000356216  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1520  hypothetical protein  31.72 
 
 		 202 aa  71.6  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2699  hypothetical protein  29.57 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0602  hypothetical protein  30 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.880988  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1202  protein of unknown function DUF502  26.84 
 
 		 219 aa  69.3  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0172325  normal  0.43521 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1911  protein of unknown function DUF502  27.04 
 
 		 235 aa  68.9  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.274539  normal  0.934804 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2309  hypothetical protein  26.6 
 
 		 240 aa  68.6  0.00000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0182653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1402  hypothetical protein  23.62 
 
 		 230 aa  68.6  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.183629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0635  hypothetical protein  28.8 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000323056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0380  hypothetical protein  30.26 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.52452  normal  0.460896 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1152  hypothetical protein  28.8 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000214061  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1598  protein of unknown function DUF502  27.92 
 
 		 217 aa  67.4  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1647  protein of unknown function DUF502  28.06 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000282003  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1705  hypothetical protein  25.5 
 
 		 234 aa  67  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00122818  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2385  hypothetical protein  28.27 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.476873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12550  hypothetical protein  27.04 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2566  protein of unknown function DUF502  28.06 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000782195 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1869  protein of unknown function DUF502  25.71 
 
 		 230 aa  64.7  0.0000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.566704  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4044  hypothetical protein  29.23 
 
 		 237 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.130299  normal  0.634474 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1069  putatives membrane protein  27.14 
 
 		 216 aa  64.7  0.0000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0655  protein of unknown function DUF502  29.23 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1729  hypothetical protein  28.87 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.183823  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1727  protein of unknown function DUF502  26.77 
 
 		 235 aa  63.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1357  hypothetical protein  27.98 
 
 		 243 aa  62.8  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3638  hypothetical protein  26.37 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0465  hypothetical protein  28.06 
 
 		 243 aa  62  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0054  hypothetical protein  29.38 
 
 		 220 aa  62  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.473477 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0851  hypothetical protein  28.5 
 
 		 216 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.415191  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2753  hypothetical protein  28.5 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.904049  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2325  hypothetical protein  28.5 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0674  hypothetical protein  28.5 
 
 		 216 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.745943  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0690  hypothetical protein  28.5 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.183628  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2405  hypothetical protein  28.5 
 
 		 216 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1878  protein of unknown function DUF502  25 
 
 		 234 aa  61.6  0.000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1611  hypothetical protein  23.5 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.201117  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4123  protein of unknown function DUF502  27.55 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.132754  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2777  hypothetical protein  27.98 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0513  protein of unknown function DUF502  26.29 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0170  hypothetical protein  26.54 
 
 		 235 aa  60.8  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2644  hypothetical protein  27.98 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392534  normal  0.186242 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0149  hypothetical protein  26.54 
 
 		 235 aa  60.8  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0802  protein of unknown function DUF502  25.37 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0340  protein of unknown function DUF502  27.55 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0889  hypothetical protein  22.84 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000902902  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0559  hypothetical protein  28.5 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0377  hypothetical protein  26.67 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.176904 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0873  hypothetical protein  25.37 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.61217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1171  protein of unknown function DUF502  27.32 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0355  protein of unknown function DUF502  27.55 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.727659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6053  hypothetical protein  27.18 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0573  hypothetical protein  27.46 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2753  hypothetical protein  27.46 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0641592  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0989  hypothetical protein  29.63 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0179773  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2114  hypothetical protein  27.32 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2726  hypothetical protein  27.32 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0409906  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1325  hypothetical protein  25.37 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865808 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0880  hypothetical protein  29.63 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.677623  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1546  hypothetical protein  23.35 
 
 		 270 aa  58.5  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.172364 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0865  hypothetical protein  24.49 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.123958 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0557  protein of unknown function DUF502  25.82 
 
 		 214 aa  57.8  0.00000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3078  hypothetical protein  29.59 
 
 		 249 aa  57  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.181609 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0441  transmembrane protein  24.61 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.534189 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2928  protein of unknown function DUF502  25 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0948  protein of unknown function DUF502  23.74 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.944318  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0786  hypothetical protein  25.38 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1488  hypothetical protein  25.25 
 
 		 223 aa  54.3  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.664901 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2935  protein of unknown function DUF502  24.87 
 
 		 267 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2681  hypothetical protein  27.32 
 
 		 219 aa  53.5  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0401595  normal  0.577134 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1622  hypothetical protein  25.26 
 
 		 194 aa  53.1  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.267647  normal  0.10718 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3889  protein of unknown function DUF502  23.7 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1260  protein of unknown function DUF502  23.83 
 
 		 245 aa  53.5  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>