More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0071 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0071  molecular chaperone, heat shock protein  100 
 
 
379 aa  776    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.140971 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3209  chaperone protein DnaJ  66.93 
 
 
385 aa  526  1e-148  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.492328  normal  0.368243 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1521  chaperone protein DnaJ  62.86 
 
 
388 aa  481  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173202  normal  0.704316 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4973  chaperone protein DnaJ  62.76 
 
 
386 aa  481  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0482542  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0979  hypothetical protein  59.32 
 
 
379 aa  468  1.0000000000000001e-131  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.127432 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6905  chaperone protein DnaJ  63.05 
 
 
389 aa  449  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.725874  normal  0.252864 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1088  chaperone protein DnaJ  50.26 
 
 
394 aa  396  1e-109  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.038983  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08256  chaperone protein dnaJ  57.85 
 
 
376 aa  380  1e-104  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.482747  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0854  chaperone protein DnaJ  48.86 
 
 
395 aa  375  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000496587  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1872  chaperone protein DnaJ  48.85 
 
 
395 aa  376  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000340868  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5050  chaperone protein DnaJ  55.26 
 
 
368 aa  372  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1582  chaperone protein DnaJ  48.6 
 
 
395 aa  371  1e-101  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.633859 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1422  chaperone protein DnaJ  46.52 
 
 
400 aa  365  1e-100  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.234078  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1691  chaperone protein DnaJ  48.37 
 
 
401 aa  353  2.9999999999999997e-96  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.211452  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1487  chaperone protein DnaJ  47.03 
 
 
382 aa  352  7e-96  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.992778  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2125  chaperone protein DnaJ  45.95 
 
 
385 aa  351  1e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.128449  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0455  chaperone protein DnaJ  53.56 
 
 
373 aa  351  1e-95  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1776  chaperone protein DnaJ  52.09 
 
 
383 aa  310  2e-83  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1180  molecular chaperone, DnaJ family  46.22 
 
 
356 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.642107  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1398  co-chaperone protein DnaJ  45.38 
 
 
356 aa  306  5.0000000000000004e-82  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0366797  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1207  chaperone protein DnaJ  45.94 
 
 
359 aa  305  7e-82  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2238  chaperone protein DnaJ  43.6 
 
 
377 aa  297  2e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395624  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2765  chaperone protein DnaJ  44.7 
 
 
382 aa  296  5e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2834  chaperone protein DnaJ  43.67 
 
 
382 aa  295  9e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1172  chaperone protein DnaJ  43.67 
 
 
382 aa  295  1e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.696744  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42960  chaperone protein DnaJ  45 
 
 
375 aa  294  1e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2828  chaperone protein DnaJ  43.49 
 
 
376 aa  293  3e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000114983  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4726  chaperone protein DnaJ  44.74 
 
 
375 aa  292  9e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.761545  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3044  chaperone protein DnaJ  43.38 
 
 
374 aa  291  9e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.952099  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0014  chaperone protein DnaJ  44.85 
 
 
379 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.65684  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3623  chaperone protein DnaJ  46.05 
 
 
375 aa  291  1e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2495  chaperone protein DnaJ  43.31 
 
 
373 aa  291  1e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0561427  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4727  chaperone protein DnaJ  45 
 
 
374 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0586  chaperone DnaJ  43.86 
 
 
382 aa  291  1e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0014  chaperone protein DnaJ  44.85 
 
 
379 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0013  chaperone protein DnaJ  44.85 
 
 
379 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.29167  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0014  chaperone protein DnaJ  44.85 
 
 
379 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.503295  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0014  chaperone protein DnaJ  44.85 
 
 
379 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.85963 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00015  chaperone Hsp40, co-chaperone with DnaK  44.3 
 
 
376 aa  290  2e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.229266  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00015  hypothetical protein  44.3 
 
 
376 aa  290  2e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35027  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4592  chaperone protein DnaJ  44.74 
 
 
374 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.356534 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0015  chaperone protein DnaJ  44.3 
 
 
376 aa  290  3e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.292346  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0013  chaperone protein DnaJ  44.3 
 
 
376 aa  290  3e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3641  chaperone protein DnaJ  44.3 
 
 
376 aa  290  3e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0016  chaperone protein DnaJ  44.3 
 
 
376 aa  290  3e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0015  chaperone protein DnaJ  44.3 
 
 
376 aa  290  4e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2006  chaperone protein DnaJ  45.55 
 
 
379 aa  290  4e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2001  chaperone protein DnaJ  45.55 
 
 
379 aa  290  4e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1460  chaperone protein DnaJ  45.28 
 
 
385 aa  290  4e-77  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0018  chaperone protein DnaJ  44.3 
 
 
376 aa  290  4e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.129066  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1514  chaperone DnaJ  41.41 
 
 
375 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3093  chaperone DnaJ  43.37 
 
 
381 aa  289  6e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0535684  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1471  chaperone protein DnaJ  44.9 
 
 
381 aa  289  6e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00621305  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3582  chaperone protein DnaJ  44.04 
 
 
376 aa  289  7e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1995  chaperone protein DnaJ  41.1 
 
 
379 aa  289  7e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.396046  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3963  chaperone protein DnaJ  45.67 
 
 
374 aa  288  1e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.819079 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0706  chaperone protein DnaJ  44.74 
 
 
374 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.421383  hitchhiker  0.00995799 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1751  chaperone protein DnaJ  38.62 
 
 
376 aa  288  2e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0750  chaperone protein DnaJ  43.34 
 
 
373 aa  287  2e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.317269  normal  0.478578 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2436  chaperone protein DnaJ  43.95 
 
 
380 aa  287  2e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00797991  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0730  chaperone protein DnaJ  43.33 
 
 
386 aa  288  2e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3039  chaperone protein DnaJ  45.19 
 
 
366 aa  286  4e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000179446  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0582  chaperone protein DnaJ  43.52 
 
 
377 aa  286  5e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.162907  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3593  chaperone protein DnaJ  44.22 
 
 
379 aa  286  5.999999999999999e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00197721  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0796  chaperone protein DnaJ  44.22 
 
 
379 aa  286  5.999999999999999e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000075688  normal  0.0897707 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3465  chaperone protein DnaJ  44.22 
 
 
379 aa  285  7e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171425  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1014  chaperone protein DnaJ  43.42 
 
 
382 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3459  chaperone protein DnaJ  40.69 
 
 
370 aa  284  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5708  chaperone protein DnaJ  43.61 
 
 
371 aa  285  1.0000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0579  chaperone protein DnaJ  43.56 
 
 
382 aa  284  1.0000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0487555  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2634  chaperone protein DnaJ  41.21 
 
 
380 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00367611  normal  0.591004 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0248  chaperone protein DnaJ  42.23 
 
 
375 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.821018  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3361  chaperone protein DnaJ  43.93 
 
 
374 aa  284  2.0000000000000002e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0151638  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0543  chaperone protein DnaJ  43.56 
 
 
377 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2056  chaperone protein DnaJ  41.73 
 
 
374 aa  283  3.0000000000000004e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1082  chaperone protein DnaJ  40.47 
 
 
369 aa  283  5.000000000000001e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.248799  normal  0.102661 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12790  chaperone protein DnaJ  44.09 
 
 
375 aa  282  7.000000000000001e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000108352  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1539  molecular chaperone protein DnaJ  43.19 
 
 
372 aa  282  8.000000000000001e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0617832  normal  0.137933 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2295  chaperone protein DnaJ  41.96 
 
 
374 aa  282  8.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3408  chaperone protein DnaJ  43.34 
 
 
378 aa  282  9e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.4894  hitchhiker  0.00217472 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3079  chaperone protein DnaJ  43.08 
 
 
376 aa  281  1e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000309129  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0018  chaperone protein DnaJ  43.96 
 
 
388 aa  281  1e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.253679  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02252  chaperone protein DnaJ  46.09 
 
 
389 aa  281  1e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.139238  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62960  chaperone protein DnaJ  44.24 
 
 
377 aa  281  1e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.377489  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2325  chaperone protein DnaJ  42.41 
 
 
376 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1097  chaperone protein DnaJ  42.41 
 
 
376 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0502  chaperone protein DnaJ  42.41 
 
 
376 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0553  chaperone protein DnaJ  41.45 
 
 
372 aa  281  2e-74  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2204  chaperone protein DnaJ  42.41 
 
 
376 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3658  chaperone protein DnaJ  42.97 
 
 
378 aa  280  3e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3276  chaperone protein DnaJ  42.41 
 
 
376 aa  280  4e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4194  chaperone protein DnaJ  44.36 
 
 
380 aa  279  4e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.993015  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3309  chaperone protein DnaJ  42.41 
 
 
376 aa  280  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3320  chaperone protein DnaJ  42.41 
 
 
376 aa  279  5e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0693  chaperone protein DnaJ  42.82 
 
 
375 aa  279  5e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580174  decreased coverage  0.000845971 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3390  chaperone protein DnaJ  42.56 
 
 
375 aa  279  6e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44272  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4095  chaperone protein DnaJ  42.89 
 
 
376 aa  279  7e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1309  chaperone protein DnaJ  42.16 
 
 
376 aa  279  7e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2732  chaperone protein DnaJ  45.67 
 
 
374 aa  279  7e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000152871  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3852  chaperone protein DnaJ  42.97 
 
 
378 aa  278  8e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>