More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0070 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0070  molecular chaperone, heat shock protein  100 
 
 		 179 aa  363  1e-99  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.120308 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1520  GrpE protein  55.69 
 
 		 206 aa  204  8e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0812159  normal  0.974035 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4974  GrpE protein  50 
 
 		 211 aa  189  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0161859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3208  GrpE protein  52.3 
 
 		 204 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.718226  normal  0.302083 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6904  GrpE protein  54.05 
 
 		 185 aa  175  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150675  normal  0.298497 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08251  GrpE protein (Hsp-70 cofactor)  59.56 
 
 		 191 aa  173  9.999999999999999e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.643992  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5051  GrpE protein  50.28 
 
 		 192 aa  172  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.845613  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0454  GrpE protein  51.41 
 
 		 186 aa  163  1.0000000000000001e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0978  hypothetical protein  46.43 
 
 		 205 aa  144  6e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.115351 
 
 
-
 
NC_002950  PG1775  grpE protein  41.71 
 
 		 194 aa  141  6e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2126  GrpE protein  37.97 
 
 		 200 aa  122  4e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.743495  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  37.22 
 
 		 213 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  38.78 
 
 		 192 aa  112  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0002  GrpE protein  41.72 
 
 		 206 aa  109  2.0000000000000002e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.531723  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0584  GrpE protein  39.77 
 
 		 225 aa  108  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1973  GrpE protein  30.15 
 
 		 223 aa  108  5e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.268651  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0944  hypothetical protein  37.09 
 
 		 201 aa  107  9.000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.104305  normal  0.177983 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2695  GrpE protein  38.24 
 
 		 202 aa  107  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.620591 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  38.51 
 
 		 226 aa  106  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  38.06 
 
 		 243 aa  105  3e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  38.29 
 
 		 231 aa  104  7e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0101  GrpE protein  36.55 
 
 		 186 aa  103  1e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.552759  normal  0.112338 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1149  heat shock protein GrpE  37.43 
 
 		 210 aa  102  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67207  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  37.06 
 
 		 195 aa  103  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0016  heat shock protein GrpE  31.38 
 
 		 239 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0705  GrpE protein  35.67 
 
 		 190 aa  102  2e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0594473  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1206  GrpE protein  37.97 
 
 		 180 aa  102  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.390676  hitchhiker  0.00686163 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0095  GrpE protein  39.19 
 
 		 282 aa  102  3e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4694  GrpE protein  33.33 
 
 		 246 aa  100  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3222  GrpE protein  36.42 
 
 		 204 aa  100  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000198101  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00151  heat shock protein GrpE  32.22 
 
 		 239 aa  99.8  2e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  decreased coverage  0.00526535  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  37.68 
 
 		 198 aa  99  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3330  heat shock protein GrpE  42.18 
 
 		 209 aa  99.4  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000166428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2072  heat shock protein GrpE  38.97 
 
 		 207 aa  98.6  4e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00161  heat shock protein GrpE  33.77 
 
 		 247 aa  98.6  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0174287 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0377  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 		 248 aa  98.2  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0427  GrpE protein  32.6 
 
 		 191 aa  98.6  5e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0102412 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1799  GrpE protein  39.46 
 
 		 197 aa  98.2  6e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.298805  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2350  GrpE protein  36.54 
 
 		 185 aa  97.8  7e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.190024 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4391  GrpE protein  38.26 
 
 		 204 aa  97.1  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.322098  normal  0.302959 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0821  heat shock protein GrpE  34.55 
 
 		 192 aa  97.1  1e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.085613  normal  0.503339 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1673  heat shock protein GrpE  32.18 
 
 		 208 aa  96.7  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0666687  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1639  heat shock protein GrpE  32.18 
 
 		 208 aa  96.7  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.980219  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1423  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)-like  32.89 
 
 		 215 aa  96.7  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3071  GrpE protein  36.59 
 
 		 238 aa  96.3  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.215635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1087  GrpE protein  32.89 
 
 		 207 aa  96.3  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0763252  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  34.06 
 
 		 190 aa  96.7  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  35.57 
 
 		 213 aa  95.5  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1062  GrpE protein  35.15 
 
 		 169 aa  95.5  4e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0506342  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1313  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 		 191 aa  95.1  5e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4166  heat shock protein GrpE  33.15 
 
 		 188 aa  94.7  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177219  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1209  GrpE protein  35.81 
 
 		 187 aa  94.7  7e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.177941  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  32.4 
 
 		 188 aa  94.4  8e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000114529  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4434  heat shock protein GrpE  32.4 
 
 		 188 aa  94.4  8e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2992  heat shock protein GrpE  35.91 
 
 		 200 aa  94.4  8e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000163848  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  34.44 
 
 		 194 aa  93.6  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  34.9 
 
 		 208 aa  93.6  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1614  GrpE protein  39.84 
 
 		 175 aa  94  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.245406  normal  0.537343 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1599  heat shock protein GrpE  36.49 
 
 		 171 aa  93.6  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.388628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0869  GrpE protein  34.62 
 
 		 186 aa  93.6  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.555049  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0506  GrpE protein  32.22 
 
 		 261 aa  93.6  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1749  heat shock protein GrpE  33.56 
 
 		 242 aa  94  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.935809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1310  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  34.29 
 
 		 198 aa  93.6  1e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000765244  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0491  GrpE protein  32.22 
 
 		 261 aa  93.6  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2902  heat shock protein GrpE  35.6 
 
 		 206 aa  93.6  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000775754  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00151  heat shock protein GrpE  32.02 
 
 		 239 aa  93.6  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1488  GrpE protein  32.14 
 
 		 198 aa  93.6  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  34.69 
 
 		 207 aa  93.2  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2805  heat shock protein GrpE  35.08 
 
 		 203 aa  92.8  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000498857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0162  heat shock protein GrpE  35.37 
 
 		 204 aa  92.8  2e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1182  molecular chaperone  34.27 
 
 		 187 aa  93.2  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00339423  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  31.84 
 
 		 188 aa  92  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  31.84 
 
 		 188 aa  92  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  31.84 
 
 		 188 aa  92  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  31.84 
 
 		 188 aa  92  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  31.84 
 
 		 188 aa  92  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00151  heat shock protein GrpE  31.13 
 
 		 239 aa  92.4  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  33.71 
 
 		 188 aa  92.8  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1873  GrpE protein  35 
 
 		 207 aa  92.4  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000365995  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0627  co-chaperone protein GrpE  39.1 
 
 		 247 aa  91.7  5e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0327836  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2572  heat shock protein GrpE  35.94 
 
 		 201 aa  91.7  5e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957049  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2791  heat shock protein GrpE  35.6 
 
 		 201 aa  91.7  5e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103997  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  32.6 
 
 		 181 aa  91.3  6e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1997  GrpE protein  35.43 
 
 		 208 aa  91.3  7e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244965  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1400  co-chaperone protein GrpE  35.2 
 
 		 187 aa  90.9  9e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3479  heat shock protein GrpE  39.74 
 
 		 209 aa  90.5  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000435816  normal  0.0401789 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0077  GrpE protein  39.74 
 
 		 172 aa  90.1  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0763151  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3243  GrpE protein  31.05 
 
 		 181 aa  90.5  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.10231  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00660  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  36.3 
 
 		 248 aa  90.1  1e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.204562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2732  heat shock protein GrpE  34.55 
 
 		 203 aa  90.5  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000369534  normal  0.883865 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3575  heat shock protein GrpE  33.71 
 
 		 186 aa  90.5  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4181  GrpE protein  33.33 
 
 		 286 aa  89.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.321411 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  34.08 
 
 		 208 aa  90.1  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_24940  chloroplast GrpE-like protein  36.23 
 
 		 274 aa  89.7  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.167019  normal  0.369132 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  31.25 
 
 		 192 aa  89  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000207397  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0016  GrpE protein  31.39 
 
 		 174 aa  89.4  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0339785  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00201  heat shock protein GrpE  31.65 
 
 		 237 aa  89.4  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  32.4 
 
 		 189 aa  89.4  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0032  heat shock protein GrpE  35.51 
 
 		 200 aa  89  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3965  GrpE protein  35.81 
 
 		 192 aa  89  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.54707 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>