128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0063 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0063  a-glycosyltransferase  100 
 
 
361 aa  744    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.15897  normal  0.0344748 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3711  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 
371 aa  169  7e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.102739  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2859  glycosyl transferase group 1  28.65 
 
 
368 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2650  glycosyl transferase, group 1  28.21 
 
 
357 aa  147  3e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3989  glycosyl transferase, group 1  28.77 
 
 
361 aa  145  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0667  glycosyl transferase, group 1  28.14 
 
 
360 aa  144  3e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0003  glycosyl transferase, group 1  29.61 
 
 
354 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0618  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.3 
 
 
366 aa  136  5e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2728  glycosyl transferase, group 1  28.45 
 
 
372 aa  132  7.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30020  Glycosyl transferase, group 1 family protein  30.15 
 
 
361 aa  130  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.349292  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2338  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
359 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1274  glycosyl transferase, group 1  27 
 
 
359 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.204906  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0629  glycosyl transferase, group 1  27.03 
 
 
356 aa  127  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.325985 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4264  glycosyl transferase, group 1  31.62 
 
 
364 aa  123  6e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5371  glycosyl transferase, group 1  27.16 
 
 
352 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.624756  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2590  glycosyltransferase  28.92 
 
 
331 aa  119  6e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0360925  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0277  glycosyl transferase group 1  30.25 
 
 
354 aa  118  9.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2522  glycosyltransferase  27.27 
 
 
339 aa  117  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1347  glycosyl transferase group 1  30.63 
 
 
367 aa  117  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.963322 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3800  putative glycosyl transferase  27.58 
 
 
355 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.383536 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1477  glycosyl transferase  23.6 
 
 
333 aa  104  3e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0984787  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0384  glycosyl transferase  28.69 
 
 
384 aa  101  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3645  glycosyl transferase group 1  35.51 
 
 
386 aa  72.8  0.000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000243926 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2166  glycosyl transferase group 1  29.28 
 
 
828 aa  71.2  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3647  glycosyl transferase group 1  35.4 
 
 
384 aa  62.8  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79128  hitchhiker  0.000752114 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0686  hypothetical protein  34.19 
 
 
371 aa  62  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  24.18 
 
 
2401 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1786  glycosyl transferase, putative  30.91 
 
 
1147 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0129098 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1367  glycosyltransferase-like protein  23.08 
 
 
1608 aa  58.5  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0176996  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3797  hypothetical protein  37.8 
 
 
1444 aa  57  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0291  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
740 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0775  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
740 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1100  glycosyl transferase group 1  30.89 
 
 
924 aa  55.8  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  26.85 
 
 
388 aa  55.8  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3333  glycosyltransferase-like protein  23.87 
 
 
1121 aa  55.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.970504 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  30.95 
 
 
372 aa  55.5  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1281  glycosyl transferase group 1  38.24 
 
 
1292 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0318394  normal  0.169433 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5389  glycosyl transferase group 1  30.23 
 
 
1265 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.604421  normal  0.386182 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5722  glycosyl transferase group 1  30.23 
 
 
1271 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.702468  hitchhiker  0.00500958 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0155  hypothetical protein  22.36 
 
 
928 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0142  hypothetical protein  23.08 
 
 
928 aa  53.9  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  34.12 
 
 
346 aa  54.3  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  32 
 
 
1476 aa  53.5  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1373  glycosyl transferase group 1  32.47 
 
 
1303 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.13365  hitchhiker  0.0000853282 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2606  glycosyl transferase group 1  33.78 
 
 
398 aa  51.6  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0766  glycosyl transferase, group 1  34.62 
 
 
339 aa  51.2  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  24.27 
 
 
401 aa  50.8  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2341  glycosyl transferase group 1  23.81 
 
 
345 aa  50.1  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.220594 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  36.99 
 
 
424 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4496  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 
374 aa  50.1  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4271  glycosyl transferase group 1  34.94 
 
 
422 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4331  glycosyl transferase group 1  36.14 
 
 
422 aa  49.7  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0666241 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  23.53 
 
 
386 aa  48.9  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3935  glycosyltransferase  37.5 
 
 
366 aa  49.3  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1367  glycosyl transferase group 1  28.75 
 
 
1301 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.833598  normal  0.936092 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  38.16 
 
 
411 aa  48.9  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2470  glycosyl transferase, group 1  21.99 
 
 
345 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  35 
 
 
381 aa  48.5  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  24.39 
 
 
390 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0359  glycosyl transferase group 1  37.31 
 
 
410 aa  48.9  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  35.53 
 
 
414 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  24.39 
 
 
390 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4069  glycosyltransferase-like protein  22.22 
 
 
398 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.269356  normal  0.131551 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0211  glycosyl transferase group 1  28.07 
 
 
393 aa  47.8  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0831973 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0766  glycosyl transferase group 1  35.82 
 
 
420 aa  47.8  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.676437  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  28.09 
 
 
426 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0615  glycosyl transferase, group 1  35.82 
 
 
420 aa  47.8  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0722468  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0670  glycosyl transferase, group 1  35 
 
 
371 aa  47.4  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2394  glycosyl transferase, group 1  28.12 
 
 
395 aa  47.4  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1513  group 1 glycosyl transferase  32.94 
 
 
349 aa  47.4  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.42388  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2735  glycosyl transferase group 1  31.71 
 
 
1220 aa  47.4  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0504  glycosyl transferase group 1  39.29 
 
 
391 aa  47.4  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  36.62 
 
 
395 aa  46.6  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1062  glycosyl transferase group 1  24.79 
 
 
400 aa  46.6  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  27.87 
 
 
409 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2433  glycosyl transferase, group 1  30.23 
 
 
417 aa  46.6  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  29.82 
 
 
387 aa  46.2  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  29.75 
 
 
378 aa  46.2  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0743  glycosyltransferase  28.89 
 
 
330 aa  45.8  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248584  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0135  glycosyl transferase group 1  28.26 
 
 
404 aa  45.8  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.224672  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  32.5 
 
 
406 aa  45.8  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1866  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  36 
 
 
396 aa  45.8  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  25.88 
 
 
1177 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  26.46 
 
 
403 aa  45.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1192  glycosyl transferase, group 1  30.59 
 
 
410 aa  45.1  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0991  glycosyl transferase group 1  22.34 
 
 
346 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00704021  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_22554  mannosyltransferase  27.23 
 
 
419 aa  44.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2715  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
421 aa  45.1  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.770455 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  22.87 
 
 
3172 aa  44.3  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3180  glycosyl transferase, group 1  30.43 
 
 
409 aa  44.3  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.780891  normal  0.107104 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5582  glycosyl transferase group 1  33.77 
 
 
1239 aa  44.3  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  28.75 
 
 
385 aa  44.3  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21730  glycogen synthase  26.21 
 
 
404 aa  44.3  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0777  glycosyl transferase, group 1  26.45 
 
 
384 aa  44.7  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.135676  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0477  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.99 
 
 
349 aa  44.7  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.319799  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.22 
 
 
381 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  25.88 
 
 
1177 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2865  glycosyl transferase group 1  24.34 
 
 
347 aa  44.7  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  23.17 
 
 
416 aa  44.3  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  32.74 
 
 
371 aa  43.9  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>