More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0062 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0062  methyltransferase  100 
 
 
299 aa  619  1e-176  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.48034  normal  0.0312794 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2220  Methyltransferase type 11  36.05 
 
 
314 aa  82.8  0.000000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  31.65 
 
 
253 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3772  methyltransferase type 11  29.32 
 
 
254 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.32 
 
 
254 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1891  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.83 
 
 
255 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249773  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1550  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
254 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.326399 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1518  methyltransferase type 11  29.32 
 
 
254 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349113  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  28.67 
 
 
215 aa  63.2  0.000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0864  methyltransferase type 11  38.78 
 
 
235 aa  63.2  0.000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.81939  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2634  methyltransferase type 11  28.83 
 
 
204 aa  62.8  0.000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162625  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1751  Methyltransferase type 11  30.25 
 
 
204 aa  62.4  0.000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190561  hitchhiker  0.00369788 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2188  Methyltransferase type 11  31.4 
 
 
266 aa  62.4  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0336811  normal  0.321372 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2595  methyltransferase type 11  30.25 
 
 
204 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133869  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2709  methyltransferase type 11  30.25 
 
 
204 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.690891  normal  0.954825 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3215  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  32.68 
 
 
320 aa  61.6  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.409549  normal  0.479491 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.54 
 
 
280 aa  60.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  29.73 
 
 
268 aa  60.5  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2478  Methyltransferase type 11  39.13 
 
 
269 aa  60.5  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4427  methyltransferase type 11  29.69 
 
 
273 aa  60.1  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  29.25 
 
 
268 aa  60.1  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  33.66 
 
 
284 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1440  methyltransferase type 11  30.16 
 
 
248 aa  59.7  0.00000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2252  methyltransferase type 11  33.7 
 
 
266 aa  59.7  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1394  methyltransferase type 11  30.16 
 
 
248 aa  59.3  0.00000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2320  methyltransferase type 11  27.21 
 
 
205 aa  59.3  0.00000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107701  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5294  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
259 aa  59.3  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.570437 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0899  methyltransferase  33.66 
 
 
328 aa  58.9  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2273  methyltransferase type 11  32.17 
 
 
204 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.972016  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40586  predicted protein  28.36 
 
 
342 aa  58.2  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4086  methyltransferase type 11  30.3 
 
 
249 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315577  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2345  methyltransferase type 11  32.46 
 
 
204 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2463  methyltransferase type 11  31.58 
 
 
204 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.899692  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1988  methyltransferase  25.33 
 
 
204 aa  57.4  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0957  methyltransferase type 11  31.63 
 
 
290 aa  57  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  28 
 
 
257 aa  56.6  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  31.86 
 
 
283 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5219  Methyltransferase type 11  28.87 
 
 
259 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0306756 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2336  methyltransferase type 11  32.99 
 
 
250 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.223131 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.47 
 
 
259 aa  56.2  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2102  hypothetical protein  26.09 
 
 
269 aa  56.2  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2090  methyltransferase type 11  26.95 
 
 
341 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  26.16 
 
 
258 aa  56.2  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1840  methyltransferase type 11  26.24 
 
 
328 aa  56.2  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1859  methyltransferase type 11  26.24 
 
 
328 aa  56.2  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.48002  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3463  type 11 methyltransferase  32.77 
 
 
280 aa  56.2  0.0000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4752  methyltransferase type 11  28.87 
 
 
259 aa  56.2  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.302185  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1906  methyltransferase type 11  26.24 
 
 
328 aa  56.2  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1815  methyltransferase type 11  30.07 
 
 
275 aa  55.8  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0910  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.29 
 
 
247 aa  55.8  0.0000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3440  Methyltransferase type 11  29 
 
 
256 aa  55.8  0.0000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3884  methyltransferase type 11  34.62 
 
 
293 aa  55.8  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658922  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2470  methyltransferase type 11  32.99 
 
 
250 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.28485  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1102  methyltransferase type 11  31.4 
 
 
249 aa  55.5  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4269  methyltransferase type 11  26.24 
 
 
332 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589079  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13054  hypothetical protein  25.43 
 
 
327 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.100828 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1074  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.32 
 
 
251 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1227  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.32 
 
 
251 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2431  methyltransferase type 11  30.93 
 
 
250 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.508094 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1858  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.43 
 
 
245 aa  55.1  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1815  methyltransferase type 11  30.93 
 
 
250 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0328  Methyltransferase type 11  30.97 
 
 
283 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2181  methyltransferase type 11  23.4 
 
 
250 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0100856 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2427  methyltransferase type 11  30.93 
 
 
250 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.992518  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2034  methyltransferase  28.57 
 
 
202 aa  55.1  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00341547  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2495  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.31 
 
 
238 aa  54.7  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1116  putative methyltransferase  34.65 
 
 
293 aa  53.9  0.000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  32.99 
 
 
265 aa  53.9  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3576  Methyltransferase type 11  26.62 
 
 
457 aa  54.3  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2752  Methyltransferase type 12  26.85 
 
 
225 aa  53.9  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  25.55 
 
 
255 aa  53.9  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0910  methyltransferase type 11  27.05 
 
 
226 aa  53.9  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.105368  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2423  methyltransferase type 11  35 
 
 
254 aa  53.5  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0780053 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2808  methyltransferase type 11  28.46 
 
 
275 aa  53.5  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0623  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  30.93 
 
 
254 aa  53.1  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2422  Methyltransferase type 11  37.18 
 
 
232 aa  53.1  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0498  methyltransferase type 11  29.25 
 
 
235 aa  53.1  0.000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  32.04 
 
 
237 aa  53.1  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3425  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  26.57 
 
 
258 aa  53.1  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129288 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3790  methyltransferase type 11  29.29 
 
 
196 aa  53.1  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.347192  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0774  Methyltransferase type 11  30.93 
 
 
254 aa  53.1  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5754  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.93 
 
 
250 aa  53.1  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0692  Methyltransferase type 12  34.23 
 
 
400 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4335  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.18 
 
 
254 aa  52.8  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1958  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.93 
 
 
232 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.937117  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1742  Methyltransferase type 11  32.14 
 
 
247 aa  52.8  0.000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.455146  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2862  methyltransferase type 11  29.7 
 
 
207 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1223  Methyltransferase type 12  33.06 
 
 
219 aa  52.4  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.902999  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2935  Methyltransferase type 11  26.62 
 
 
320 aa  52.4  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  25.17 
 
 
251 aa  52.8  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61862  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3270  Methyltransferase type 11  26.62 
 
 
324 aa  52.4  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.455173  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.9 
 
 
238 aa  52.4  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3711  Methyltransferase type 11  36.05 
 
 
208 aa  52.8  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.157205  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0720  Methyltransferase type 12  35.14 
 
 
400 aa  52.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0561538  normal  0.0810858 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  26.71 
 
 
312 aa  52.4  0.000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1419  Methyltransferase type 11  24.79 
 
 
256 aa  52.4  0.000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2815  Methyltransferase type 12  23.81 
 
 
232 aa  51.6  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1430  Methyltransferase type 11  27.66 
 
 
205 aa  52  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.406205  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23770  putative biotin synthesis protein  41.94 
 
 
187 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0761957 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1845  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.47 
 
 
234 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00431464  normal  0.756459 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>