55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0061 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0061  glycosyltransferase  100 
 
 		 411 aa  848    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.715924  normal  0.0312794 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3712  hypothetical protein  31.37 
 
 		 404 aa  205  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0151792  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0666  hypothetical protein  29.45 
 
 		 399 aa  186  5e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.202618  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30010  hypothetical protein  22.95 
 
 		 416 aa  101  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.255646  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3346  glycosyltransferase-like protein  24.23 
 
 		 420 aa  81.6  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  24.29 
 
 		 406 aa  75.5  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1495  hypothetical protein  24.23 
 
 		 413 aa  72.8  0.000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0293  glycosyl transferase, group 1  21.3 
 
 		 406 aa  67  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.551542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1973  glycosyl transferase, group 1  21.89 
 
 		 416 aa  67  0.0000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0289  glycosyl transferase, group 1  21.91 
 
 		 405 aa  62.4  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1931  hypothetical protein  22.06 
 
 		 412 aa  60.5  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.210708  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2305  glycosyl transferase, group 1  22.44 
 
 		 402 aa  59.3  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  19.15 
 
 		 411 aa  59.7  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4489  glycosyl transferase group 1  22.1 
 
 		 417 aa  55.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0168  glycosyl transferase, group 1  25.69 
 
 		 398 aa  55.8  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00242491  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0670  glycosyl transferase, group 1  20.68 
 
 		 405 aa  55.5  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0461  glycosyl transferase group 1  24.93 
 
 		 407 aa  53.9  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0166  glycosyl transferase group 1  27.03 
 
 		 398 aa  53.5  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00791172  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3354  glycosyl transferase group 1  21.52 
 
 		 409 aa  53.5  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3605  glycosyl transferase, group 1  22.41 
 
 		 405 aa  53.1  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1788 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1502  glycosyl transferase, group 1  21.43 
 
 		 420 aa  52.4  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0598  glycosyl transferase group 1  24.9 
 
 		 385 aa  52.4  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1098  glycosyl transferase, group 1  28.06 
 
 		 399 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000174452 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0393  glycosyl transferase group 1  22.1 
 
 		 403 aa  50.4  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.190389  normal  0.881453 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4294  glycosyl transferase group 1  21.34 
 
 		 405 aa  50.4  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.458687 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0334  glycosyl transferase group 1  20.42 
 
 		 411 aa  49.7  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.145244 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2119  glycosyl transferase, group 1  21.88 
 
 		 405 aa  49.3  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111121  normal  0.0181031 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0616  glycosyltransferase, group 1  21.03 
 
 		 414 aa  49.7  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0767  glycosyl transferase group 1  21.03 
 
 		 414 aa  49.7  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3940  glycosyl transferase group 1  21 
 
 		 402 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0581  glycosyl transferase, group 1  18.36 
 
 		 405 aa  49.7  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3328  glycosyl transferase, group 1  21.24 
 
 		 412 aa  48.9  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1761  glycosyl transferase group 1  21.9 
 
 		 390 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1526  glycosyl transferase, group 1  23.2 
 
 		 397 aa  48.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00489758  normal  0.775583 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1534  glycosyl transferase group 1  19.74 
 
 		 407 aa  48.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.994246 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0762  glycosyl transferase group 1  21.69 
 
 		 418 aa  47.4  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3248  glycosyl transferase group 1  21.26 
 
 		 418 aa  47.4  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0634  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.33 
 
 		 398 aa  47  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.888697  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3504  glycosyl transferase group 1  22.9 
 
 		 400 aa  47  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0009700000000003e-28 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0585  glycosyl transferase group 1  25.77 
 
 		 415 aa  47  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  23.48 
 
 		 424 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4821  glycosyl transferase, group 1  20.54 
 
 		 401 aa  46.2  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.726751  normal  0.695392 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0152  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.44 
 
 		 403 aa  45.8  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  23.33 
 
 		 419 aa  45.1  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0028  LPS glycosyltransferase  22.73 
 
 		 373 aa  45.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000218534  hitchhiker  0.00835571 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00694  hypothetical protein  20.27 
 
 		 312 aa  45.1  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  23.7 
 
 		 394 aa  44.7  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00701  glycosyl transferase  18.53 
 
 		 407 aa  44.3  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5559  glycosyl transferase, group 1 family protein  20.85 
 
 		 409 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.51032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  24.46 
 
 		 416 aa  44.3  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0446  glycosyl transferase, group 1  21.73 
 
 		 409 aa  43.9  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.779144 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0624  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.31 
 
 		 383 aa  43.5  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0250  glycosyl transferase, group 1  22.95 
 
 		 378 aa  43.5  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3439  glycosyl transferase group 1  22.22 
 
 		 400 aa  43.5  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.359579  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1186  glycosyl transferase, group 1  23.59 
 
 		 427 aa  42.7  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>