185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0050 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0050  DNA-invertase from lambdoid prophage Qin  100 
 
 		 207 aa  416  1e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112897  hitchhiker  0.000566383 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2960  DNA resolvase  33.66 
 
 		 217 aa  122  4e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000168825  unclonable  0.00000591562 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04260  hypothetical protein  30.65 
 
 		 197 aa  79.3  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4253  resolvase-like protein  31.07 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4263  resolvase-like protein  31.07 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0149  resolvase  34.19 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5792  resolvase TnpR  27.36 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.923438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3423  Resolvase domain protein  28.12 
 
 		 185 aa  66.2  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1803  resolvase domain-containing protein  27.45 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3142  resolvase-like protein  31.45 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2100  Resolvase domain protein  29.05 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000956779  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1635  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  28.37 
 
 		 196 aa  62  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00540929  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2494  resolvase domain-containing protein  28.78 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1963  resolvase domain-containing protein  29.76 
 
 		 251 aa  62  0.000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0600134  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01504  predicted site-specific recombinase  28.37 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.133152  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2272  Resolvase domain protein  28.37 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.861059  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2113  resolvase domain-containing protein  28.37 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0120982  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01515  hypothetical protein  28.37 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.088804  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01345  predicted site-specific recombinase  28.37 
 
 		 196 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4663  resolvase domain-containing protein  27.94 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.94015  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01357  hypothetical protein  28.37 
 
 		 196 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  33.11 
 
 		 521 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1762  resolvase-like protein  28.02 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2374  resolvase domain-containing protein  28.02 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1594  resolvase domain-containing protein  30.43 
 
 		 189 aa  60.5  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.94865  normal  0.455677 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4228  resolvase family site-specific recombinase  30.05 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.623835  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  30.41 
 
 		 183 aa  59.3  0.00000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1099  resolvase domain-containing protein  25.74 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1754  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  27.88 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0427296  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3135  resolvase TnpR  30.11 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4379  resolvase-like protein  27.59 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4555  resolvase-like protein  27.59 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849085  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  32 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a003  site-specific recombinase/resolvase  29.63 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000421132  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  32.5 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  30.46 
 
 		 415 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4223  resolvase domain-containing protein  28.17 
 
 		 194 aa  58.2  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.150601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3231  transposon Tn2501 resolvase  29.13 
 
 		 191 aa  57  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2327  Resolvase domain  28.12 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0172  resolvase family site-specific recombinase  27.32 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3652  resolvase, N-terminal  26.53 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000770175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3410  Resolvase domain protein  29.49 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.260918 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0105  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  28.64 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0864  multiple promoter invertase  27.8 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00186706 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2896  resolvase-like protein  26.09 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.232346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  31 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  30.54 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0024  cpp27  26.09 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.586795  n/a   
 
 
-
 
NC_010715  Nther_2949  Resolvase domain  26.77 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.587528  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0687  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  29.41 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.731539  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4419  resolvase domain-containing protein  28.57 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00736052  normal  0.464308 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2084  resolvase domain-containing protein  28.57 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2173  resolvase domain-containing protein  28.57 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2427  resolvase domain-containing protein  27.67 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0929457  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  27.49 
 
 		 184 aa  53.9  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  29.29 
 
 		 185 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0155  resolvase x  30.34 
 
 		 193 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2003  transposon Tn2501 resolvase  28.57 
 
 		 222 aa  53.1  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00181715  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  30 
 
 		 185 aa  53.1  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6376  resolvase domain-containing protein  28.66 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  28.9 
 
 		 190 aa  52.8  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  27.06 
 
 		 184 aa  52.8  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0149  transposon resolvase  31.03 
 
 		 186 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015767 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0445  resolvase/integrase-like protein  27.88 
 
 		 192 aa  52.4  0.000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.65944  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3662  Resolvase domain protein  24.75 
 
 		 188 aa  52  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  30 
 
 		 185 aa  52  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  29.13 
 
 		 188 aa  52  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  30.05 
 
 		 185 aa  51.6  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  30.05 
 
 		 185 aa  51.6  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  28.64 
 
 		 188 aa  51.6  0.000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0119  transposon resolvase  30.34 
 
 		 186 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.336282 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0876  resolvase domain-containing protein  27.09 
 
 		 251 aa  51.6  0.000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0740279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2355  Resolvase domain protein  28.86 
 
 		 186 aa  51.2  0.000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  0.6636 
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0002  resolvase  26.96 
 
 		 190 aa  51.2  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141759  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1801  resolvase domain-containing protein  27.09 
 
 		 228 aa  51.2  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.118365 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4598  Resolvase domain protein  35.17 
 
 		 188 aa  50.8  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0797  resolvase domain-containing protein  27.59 
 
 		 251 aa  50.4  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000013388 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  28.57 
 
 		 188 aa  50.1  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1811  Resolvase domain protein  27.27 
 
 		 183 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0297206  hitchhiker  0.00833685 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0438  putative resolvase  26.63 
 
 		 318 aa  49.7  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2368  Resolvase domain protein  31.44 
 
 		 223 aa  48.9  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000141034  decreased coverage  0.00000000117936 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1494  resolvase-like protein  28.76 
 
 		 186 aa  48.9  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.493325 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2336  recombinase  28.12 
 
 		 532 aa  48.5  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430525  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1645  resolvase-like protein  26.73 
 
 		 213 aa  48.5  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  27.81 
 
 		 189 aa  48.5  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4794  resolvase domain-containing protein  24.88 
 
 		 193 aa  48.1  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3170  resolvase domain-containing protein  29.89 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00430122 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004307  resolvase N-terminal domain protein  28.57 
 
 		 190 aa  48.1  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.179008  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  28.86 
 
 		 199 aa  47.8  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0166  Resolvase domain protein  32.89 
 
 		 188 aa  47.4  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  26.74 
 
 		 185 aa  47.8  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0427  Resolvase domain protein  27.81 
 
 		 534 aa  47.8  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  28.19 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  27.67 
 
 		 201 aa  46.6  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0884  Resolvase domain protein  28.81 
 
 		 187 aa  47.4  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000364698  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  28.57 
 
 		 188 aa  47  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  27.84 
 
 		 184 aa  47  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  28.76 
 
 		 542 aa  46.2  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1467  resolvase-like protein  27.33 
 
 		 196 aa  46.2  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4128  Resolvase domain protein  28.16 
 
 		 231 aa  46.2  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>