14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0031 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0031  integral membrane protein  100 
 
 		 140 aa  280  5.000000000000001e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0727077  normal  0.0186699 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1230  VanZ family protein  32.69 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.794314  hitchhiker  0.00101511 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0437  hypothetical protein  30 
 
 		 130 aa  57.8  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1841  hypothetical protein  30.19 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.191726  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0005  VanZ family protein  32.08 
 
 		 141 aa  50.8  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1750  hypothetical protein  35.24 
 
 		 126 aa  47.4  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0175059  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1655  hypothetical protein  31.48 
 
 		 117 aa  47.4  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0089  vault protein inter-alpha-trypsin  39.39 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6628  VanZ family protein  34.58 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13931 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0123  VanZ like protein  30.68 
 
 		 165 aa  43.9  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01200  hypothetical protein  30.56 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0248889  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1376  VanZ like protein  30.61 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.429052  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0165  hypothetical protein  34.48 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0300399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1489  VanZ family protein  32.08 
 
 		 144 aa  40.8  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>