More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0023 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0023  M23/M37 family peptidase  100 
 
 
412 aa  830    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.257571  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4398  Peptidase M23  35.57 
 
 
475 aa  263  3e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0079  peptidase M23  36.12 
 
 
419 aa  262  8e-69  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.597935 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3774  Peptidase M23  34.85 
 
 
446 aa  261  1e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03530  putative peptidase  31.73 
 
 
407 aa  201  3e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1067  peptidase M23B  30.51 
 
 
417 aa  195  1e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0749  Peptidase M23  29.57 
 
 
422 aa  192  8e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3838  Peptidase M23  31.37 
 
 
429 aa  189  5e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2361  Peptidase M23  30.49 
 
 
418 aa  188  1e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.147353  normal  0.297457 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1971  Peptidase M23  31.89 
 
 
394 aa  171  2e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.324427  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0956  M24/M37 family peptidase putative  30.19 
 
 
431 aa  170  4e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.17281 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1188  Peptidase M23  46.04 
 
 
490 aa  140  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1814  Peptidase M23  26.75 
 
 
436 aa  139  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.495234  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0562  membrane-bound metallopeptidase-like  27.69 
 
 
465 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.179343  normal  0.12509 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0699  Peptidase M23  26.6 
 
 
400 aa  124  4e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240238  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0855  Peptidase M23  43.8 
 
 
503 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0522  Peptidase M23  37.29 
 
 
516 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000038172  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0808  peptidase M23B  43.17 
 
 
495 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.190534  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1281  membrane-bound metallopeptidase-like  41.61 
 
 
503 aa  103  5e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.490805  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2994  Peptidase M23  20.68 
 
 
397 aa  82  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13009e-16 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0045  peptidase M23B  22.7 
 
 
387 aa  80.9  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00126  peptidase  26.03 
 
 
382 aa  79.3  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1854  peptidase M23B  22.65 
 
 
394 aa  79  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00139977  normal  0.475417 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1289  peptidase M23B  19.9 
 
 
397 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0135605  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2804  putative exported peptidase  22.57 
 
 
381 aa  78.2  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  33.57 
 
 
375 aa  78.2  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  25.06 
 
 
376 aa  77  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1773  M23/M37 peptidase domain-containing protein  20.81 
 
 
391 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00471646  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  27.6 
 
 
372 aa  74.7  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3157  Peptidase M23  30.88 
 
 
458 aa  73.6  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0574328 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  24.36 
 
 
379 aa  72.4  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002242  membrane-bound metallopeptidase  25.61 
 
 
375 aa  72.8  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  29.03 
 
 
374 aa  72  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1218  peptidase M23  26.38 
 
 
387 aa  70.5  0.00000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.064926 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4247  peptidase M23B  21.92 
 
 
416 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.843239  normal  0.0136995 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0408  peptidase M23B  24.06 
 
 
428 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0712  peptidase M23B  30.12 
 
 
370 aa  69.7  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.483453  normal  0.143509 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1674  hypothetical protein  21.73 
 
 
388 aa  68.9  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1436  M24/M37 family peptidase  32.56 
 
 
369 aa  69.3  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0228045  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0668  peptidase M23B  32.85 
 
 
372 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288255  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0068  hypothetical protein  26.21 
 
 
456 aa  69.3  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0074  hypothetical protein  26.21 
 
 
456 aa  69.3  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2158  Peptidase M23  25.8 
 
 
382 aa  68.9  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.284453 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0609  Peptidase M23  33.59 
 
 
412 aa  68.9  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.01787e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0315  peptidase M23B  31.21 
 
 
346 aa  68.9  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.612531  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1934  peptidase M23B  25.42 
 
 
396 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000344038  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0702  Peptidase M23  32.12 
 
 
373 aa  67.4  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4142  hypothetical protein  25.19 
 
 
456 aa  66.6  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0703  Peptidase M23  32.12 
 
 
372 aa  66.6  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  30.23 
 
 
404 aa  66.6  0.0000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  32 
 
 
314 aa  65.9  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  25.25 
 
 
379 aa  65.9  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2452  peptidase M23B  30 
 
 
430 aa  65.5  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000046431  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  21.73 
 
 
379 aa  65.5  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67790  putative membrane-bound metallopeptidase  22.03 
 
 
428 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.498493  normal  0.610112 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  23.34 
 
 
374 aa  64.7  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0122  hypothetical protein  23.36 
 
 
427 aa  64.3  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0922  peptidase M23B  30.23 
 
 
383 aa  63.9  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.611629  normal  0.45806 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  30.47 
 
 
430 aa  63.9  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0798  peptidase M23B  34.88 
 
 
352 aa  63.5  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4084  hypothetical protein  23.88 
 
 
433 aa  63.2  0.000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1211  Fis family transcriptional regulator  29.1 
 
 
382 aa  63.2  0.000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  22.8 
 
 
377 aa  63.2  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4333  peptidase M23B  23.32 
 
 
362 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1379  Peptidase M23  25.97 
 
 
420 aa  62.4  0.00000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0048  M24/M37 family peptidase  22.95 
 
 
344 aa  61.6  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2393  M23 family peptidase  22.83 
 
 
412 aa  61.6  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.825234 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1921  Peptidase M23  23.83 
 
 
398 aa  62  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000118753  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  23.79 
 
 
399 aa  61.6  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  24.25 
 
 
399 aa  61.6  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0042  peptidase M23B  23.63 
 
 
377 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.701038  hitchhiker  0.00314235 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0050  peptidase M23B  23.63 
 
 
377 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000146051 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4392  M23/27 family peptidase  24.24 
 
 
411 aa  61.2  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1721  M23 peptidase domain-containing protein  25.23 
 
 
369 aa  60.8  0.00000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3287  Peptidase M23  26.95 
 
 
405 aa  60.8  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4365  hypothetical protein  23.26 
 
 
433 aa  60.8  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0042  peptidase M23B  24.32 
 
 
362 aa  60.8  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0696  M24/M37 family peptidase  32 
 
 
388 aa  60.8  0.00000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0489006  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03471  protease with a role in cell division  21.28 
 
 
419 aa  60.1  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  22.89 
 
 
402 aa  60.1  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03422  hypothetical protein  21.28 
 
 
419 aa  60.1  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0268  M23 peptidase domain protein  33.59 
 
 
417 aa  60.5  0.00000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2708  Peptidase M23  29.37 
 
 
455 aa  60.1  0.00000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5108  peptidase M23B  29.1 
 
 
438 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2410  peptidase M23B  19.32 
 
 
404 aa  59.7  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000521707  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  28.44 
 
 
377 aa  59.7  0.00000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5328  peptidase, M23/M37 family  25.76 
 
 
440 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1477  peptidase M23B  29.92 
 
 
442 aa  58.9  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.707432  normal  0.0152979 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1037  Peptidase M23  30.16 
 
 
477 aa  59.3  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.501943  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3212  peptidase M23B  25.38 
 
 
417 aa  59.7  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.321571  normal  0.507005 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3167  peptidase M23B  26.06 
 
 
366 aa  59.3  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0092  Peptidase M23  21.28 
 
 
419 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5057  M24/M37 family peptidase  25.16 
 
 
438 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0450  non-proteolytic protein, peptidase family M23  24.77 
 
 
413 aa  58.5  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0993471  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1220  peptidase, M23/M37 family  33.87 
 
 
385 aa  58.5  0.0000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000900007  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4117  hypothetical protein  21.28 
 
 
427 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0039  peptidase M23B  23.39 
 
 
377 aa  58.5  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1120  peptidase M23B  21.92 
 
 
398 aa  58.5  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4930  peptidase M23B  25.16 
 
 
438 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3825  hypothetical protein  21.28 
 
 
427 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>