53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0018 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0018  polysaccharide biosynthesis protein; permease component  100 
 
 		 506 aa  1014    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0804  hypothetical protein  45.33 
 
 		 493 aa  386  1e-106  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.288732 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1772  polysaccharide biosynthesis protein  41.47 
 
 		 496 aa  359  8e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3964  polysaccharide biosynthesis protein  39.25 
 
 		 500 aa  353  2.9999999999999997e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.865833 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5446  polysaccharide biosynthesis protein  42.6 
 
 		 511 aa  342  7e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.556135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3842  polysaccharide biosynthesis protein  37.75 
 
 		 499 aa  330  3e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.289536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0417  polysaccharide biosynthesis protein  38.59 
 
 		 512 aa  288  2e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03555  polysaccharide biosynthesis protein  39.09 
 
 		 461 aa  275  2.0000000000000002e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1062  multi anti extrusion protein MatE  38.71 
 
 		 464 aa  273  4.0000000000000004e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2128  polysaccharide biosynthesis protein  37.86 
 
 		 472 aa  262  1e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00415238  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0489  polysaccharide biosynthesis-related protein  31.77 
 
 		 493 aa  225  1e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0605  polysaccharide biosynthesis protein  31.58 
 
 		 474 aa  197  3e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000992142  hitchhiker  0.0000000137366 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0202  polysaccharide biosynthesis protein  30.06 
 
 		 538 aa  187  4e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0440  polysaccharide biosynthesis protein  28.81 
 
 		 501 aa  180  4e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.830934  normal  0.330866 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0469  polysaccharide biosynthesis protein  28.43 
 
 		 511 aa  160  7e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0406  polysaccharide biosynthesis protein  29.22 
 
 		 497 aa  155  2e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.260793 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0403  polysaccharide biosynthesis protein  27.99 
 
 		 504 aa  146  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.963909  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0438  polysaccharide biosynthesis protein  27.88 
 
 		 504 aa  140  6e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0336  polysaccharide biosynthesis protein  27.03 
 
 		 504 aa  139  1e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1745  polysaccharide biosynthesis protein  25.53 
 
 		 507 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.183747 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0621  polysaccharide biosynthesis protein  28.69 
 
 		 475 aa  85.5  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.914686  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0772  polysaccharide biosynthesis protein  24.42 
 
 		 488 aa  83.6  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330011  normal  0.358074 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1963  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  19.07 
 
 		 518 aa  66.6  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.876605  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3254  polysaccharide biosynthesis protein  21.85 
 
 		 482 aa  63.2  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0243  polysaccharide biosynthesis protein  24.46 
 
 		 472 aa  63.2  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117195 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1307  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 483 aa  63.2  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0941  polysaccharide biosynthesis protein  22.98 
 
 		 483 aa  62.8  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0582  polysaccharide biosynthesis protein  22 
 
 		 479 aa  62  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1240  polysaccharide biosynthesis protein  22.52 
 
 		 493 aa  62  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.554345  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1301  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 483 aa  61.6  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2481  polysaccharide biosynthesis protein  28.93 
 
 		 477 aa  60.8  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206749  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1525  polysaccharide biosynthesis protein  26.99 
 
 		 475 aa  60.5  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3014  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  22.13 
 
 		 422 aa  59.3  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1812  polysaccharide biosynthesis protein  22.78 
 
 		 482 aa  58.2  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2435  polysaccharide biosynthesis protein  22.91 
 
 		 481 aa  57.8  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0306  polysaccharide biosynthesis protein  26.29 
 
 		 467 aa  54.7  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  19.96 
 
 		 488 aa  55.1  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02224  hypothetical protein  22.88 
 
 		 473 aa  54.7  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2862  polysaccharide biosynthesis protein  27.92 
 
 		 500 aa  53.5  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003537  putative lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.78 
 
 		 476 aa  52.8  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1714  polysaccharide biosynthesis protein  27.38 
 
 		 483 aa  52  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0396788  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0823  polysaccharide biosynthesis protein  22.68 
 
 		 465 aa  48.9  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.110638  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0093  polysaccharide biosynthesis protein  22.81 
 
 		 496 aa  48.9  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1959  polysaccharide biosynthesis protein  25.35 
 
 		 451 aa  48.5  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4764  polysaccharide biosynthesis protein  21.63 
 
 		 476 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.313317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2124  hypothetical protein  23.35 
 
 		 461 aa  48.1  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.553505 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  25.45 
 
 		 449 aa  47.8  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3259  polysaccharide biosynthesis protein  24.12 
 
 		 418 aa  46.6  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0722  hypothetical protein  21.65 
 
 		 430 aa  46.6  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.443233  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1384  polysaccharide biosynthesis protein  24.31 
 
 		 440 aa  44.7  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3073  polysaccharide biosynthesis protein  22.79 
 
 		 491 aa  44.7  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1623  polysaccharide biosynthesis protein  21.69 
 
 		 489 aa  44.3  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1044  polysaccharide biosynthesis protein  23.89 
 
 		 440 aa  43.5  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.041441  hitchhiker  0.00655602 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>