More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0014 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0821  DNA mismatch repair protein MutL  49.84 
 
 		 630 aa  660    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000117941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3811  DNA mismatch repair protein MutL  52.04 
 
 		 629 aa  691    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0014  DNA mismatch repair protein  100 
 
 		 610 aa  1263    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0481  DNA mismatch repair protein MutL  51.89 
 
 		 623 aa  657    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.324517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5569  DNA mismatch repair protein MutL  47.23 
 
 		 685 aa  632  1e-180  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.590077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1174  hypothetical protein  49.52 
 
 		 628 aa  625  1e-178  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0643431 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0963  DNA mismatch repair protein MutL  46.66 
 
 		 608 aa  599  1e-170  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07070  putative DNA mismatch repair protein  48.71 
 
 		 617 aa  591  1e-167  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.748012  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0211  DNA mismatch repair protein MutL  43.27 
 
 		 644 aa  555  1e-157  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2145  DNA mismatch repair protein MutL  44.14 
 
 		 612 aa  509  1e-143  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000372508  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0145  DNA mismatch repair protein  40.18 
 
 		 644 aa  488  1e-136  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2701  DNA mismatch repair protein MutL  40.35 
 
 		 626 aa  487  1e-136  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00383046  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0172  DNA mismatch repair protein MutL  40.95 
 
 		 624 aa  483  1e-135  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0267  DNA mismatch repair protein MutL  38.68 
 
 		 622 aa  472  1e-132  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000997696 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1981  DNA mismatch repair protein  38.41 
 
 		 626 aa  473  1e-132  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.201794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0302  DNA mismatch repair protein MutL  38.45 
 
 		 624 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000565974  hitchhiker  0.00985332 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2328  DNA mismatch repair protein MutL  39.24 
 
 		 629 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0412  DNA mismatch repair protein MutL  39.13 
 
 		 618 aa  454  1.0000000000000001e-126  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2128  DNA mismatch repair protein  34.26 
 
 		 639 aa  350  5e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000120986  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2053  DNA mismatch repair protein  33.17 
 
 		 622 aa  344  2.9999999999999997e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00117239  hitchhiker  0.0000000712721 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  33.33 
 
 		 628 aa  340  4e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1884  DNA mismatch repair protein  32.77 
 
 		 640 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1612  DNA mismatch repair protein  33.66 
 
 		 614 aa  336  7.999999999999999e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.235254  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2769  DNA mismatch repair protein  31.72 
 
 		 652 aa  331  2e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286219  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0157  DNA mismatch repair protein MutL  33.55 
 
 		 559 aa  329  8e-89  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3219  DNA mismatch repair protein MutL  31.54 
 
 		 647 aa  328  2.0000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.428383  normal  0.251683 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2908  DNA mismatch repair protein  31.83 
 
 		 655 aa  327  3e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2563  DNA mismatch repair protein  31.6 
 
 		 636 aa  326  7e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0149  DNA mismatch repair protein MutL  32.57 
 
 		 605 aa  326  8.000000000000001e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  31.55 
 
 		 606 aa  325  1e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3054  DNA mismatch repair protein  33.12 
 
 		 643 aa  325  1e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0230443  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1144  DNA mismatch repair protein MutL  31.66 
 
 		 616 aa  324  2e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.513301  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1384  DNA mismatch repair protein MutL  32.15 
 
 		 613 aa  324  2e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.664684 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1172  DNA mismatch repair protein  32.29 
 
 		 674 aa  323  8e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2430  DNA mismatch repair protein  31.59 
 
 		 635 aa  322  9.000000000000001e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1936  DNA mismatch repair protein MutL  33.44 
 
 		 612 aa  322  9.999999999999999e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000687656 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3539  DNA mismatch repair protein  32.26 
 
 		 644 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2836  DNA mismatch repair protein  31.65 
 
 		 647 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1770  DNA mismatch repair protein  31.76 
 
 		 602 aa  320  6e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00259733  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2634  DNA mismatch repair protein  32.39 
 
 		 641 aa  320  6e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00330895  unclonable  0.0000000000120627 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1517  DNA mismatch repair protein MutL  30.87 
 
 		 598 aa  320  6e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.249931 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1703  DNA mismatch repair protein MutL  32.48 
 
 		 603 aa  320  7e-86  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4044  DNA mismatch repair protein MutL  31.65 
 
 		 628 aa  319  1e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816003  normal  0.310643 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1494  DNA mismatch repair protein MutL  31.18 
 
 		 692 aa  318  3e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1924  DNA mismatch repair protein MutL  34.21 
 
 		 560 aa  317  4e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1114  DNA mismatch repair protein MutL  32.43 
 
 		 620 aa  316  7e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000422632  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2098  DNA mismatch repair protein  33.13 
 
 		 659 aa  315  9.999999999999999e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1487  DNA mismatch repair protein MutL  31.24 
 
 		 622 aa  316  9.999999999999999e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.101291  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1823  DNA mismatch repair protein MutL  32.28 
 
 		 628 aa  315  9.999999999999999e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000270616  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  31.32 
 
 		 623 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  32.64 
 
 		 632 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2962  DNA mismatch repair protein  30.61 
 
 		 608 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000126227  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2946  DNA mismatch repair protein  30.79 
 
 		 629 aa  313  5.999999999999999e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0072  DNA mismatch repair protein  33.54 
 
 		 647 aa  313  6.999999999999999e-84  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11660  DNA mismatch repair protein MutL  30.53 
 
 		 644 aa  312  1e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2420  DNA mismatch repair protein  30.4 
 
 		 649 aa  311  2e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323655  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0668  DNA mismatch repair protein MutL  30.21 
 
 		 620 aa  311  2e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.422126  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0570  DNA mismatch repair protein  31.75 
 
 		 648 aa  311  2e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.963062 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2999  DNA mismatch repair protein MutL  31.32 
 
 		 631 aa  311  2e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5675  DNA mismatch repair protein  31.49 
 
 		 633 aa  311  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65350  DNA mismatch repair protein  31.49 
 
 		 633 aa  311  2e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  31.22 
 
 		 629 aa  311  2e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0554  DNA mismatch repair protein MutL  31.02 
 
 		 565 aa  311  2.9999999999999997e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1203  DNA mismatch repair protein  31.83 
 
 		 619 aa  311  2.9999999999999997e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.288753  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1499  DNA mismatch repair protein MutL  32.07 
 
 		 589 aa  311  2.9999999999999997e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  31.94 
 
 		 633 aa  310  4e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4944  DNA mismatch repair protein MutL  31.65 
 
 		 645 aa  310  5e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0521  DNA mismatch repair protein  31.6 
 
 		 635 aa  310  5e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525121  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2088  DNA mismatch repair protein  32.79 
 
 		 601 aa  310  5e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.02775 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4687  DNA mismatch repair protein  31.33 
 
 		 633 aa  310  5e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0571  DNA mismatch repair protein MutL  30.32 
 
 		 636 aa  310  5e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.707368  hitchhiker  0.00000000963067 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  31.3 
 
 		 632 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1951  DNA mismatch repair protein  33.06 
 
 		 585 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.448925  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  31.88 
 
 		 602 aa  308  2.0000000000000002e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1696  DNA mismatch repair protein MutL  30.04 
 
 		 665 aa  308  3e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.930861  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4548  DNA mismatch repair protein MutL  31.94 
 
 		 605 aa  306  6e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  31.55 
 
 		 611 aa  306  8.000000000000001e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0218  DNA mismatch repair protein  30.72 
 
 		 623 aa  306  1.0000000000000001e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0787206  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0198  DNA mismatch repair protein  30.72 
 
 		 623 aa  306  1.0000000000000001e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1084  DNA mismatch repair protein MutL  32.17 
 
 		 630 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.967595  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07520  DNA mismatch repair protein  31.23 
 
 		 641 aa  304  3.0000000000000004e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3466  DNA mismatch repair protein MutL  30.48 
 
 		 622 aa  304  3.0000000000000004e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52693  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4032  DNA mismatch repair protein  31.66 
 
 		 597 aa  303  6.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.733731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3209  DNA mismatch repair protein MutL  30.78 
 
 		 660 aa  303  7.000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3164  DNA mismatch repair protein MutL  32.11 
 
 		 615 aa  303  8.000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1389  DNA mismatch repair protein  31.49 
 
 		 599 aa  303  8.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41073  normal  0.777612 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0800  DNA mismatch repair protein MutL  32.42 
 
 		 586 aa  302  1e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  30.47 
 
 		 630 aa  302  1e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1157  DNA mismatch repair protein MutL  31.06 
 
 		 644 aa  302  1e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1466  DNA mismatch repair protein MutL  31.15 
 
 		 635 aa  302  1e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.643627  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2081  DNA mismatch repair protein  32.48 
 
 		 621 aa  301  2e-80  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2096  DNA mismatch repair protein  33.07 
 
 		 630 aa  301  2e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3049  DNA mismatch repair protein  30.88 
 
 		 626 aa  301  2e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0977  DNA mismatch repair ATPase  31.74 
 
 		 584 aa  301  2e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0710055  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1078  DNA mismatch repair protein MutL  33.39 
 
 		 572 aa  300  4e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0441  DNA mismatch repair protein  31.72 
 
 		 620 aa  300  5e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2002  DNA mismatch repair protein  32.54 
 
 		 619 aa  300  7e-80  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2548  DNA mismatch repair protein  31.16 
 
 		 603 aa  298  2e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.17269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1217  DNA mismatch repair protein  30.79 
 
 		 612 aa  298  2e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.469734  normal  0.0661873 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4855  DNA mismatch repair protein  31.27 
 
 		 595 aa  298  2e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>