63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0001 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0001  capsular polysaccharide biosythesis protein  100 
 
 		 225 aa  462  1e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6421  PHP domain protein  39.29 
 
 		 255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.850733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0067  PHP domain protein  40.57 
 
 		 245 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.316218 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4993  phosphotransferase domain-containing protein  42.51 
 
 		 245 aa  175  6e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.997402  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4733  capsular polysaccharide biosynthesis protein  38.94 
 
 		 255 aa  160  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.693573  decreased coverage  0.0000431784 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3888  capsular polysaccharide biosynthesis protein  39.56 
 
 		 241 aa  157  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10718  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  33.82 
 
 		 246 aa  149  2e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.932868  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0435  capsular polysaccharide biosythesis protein, putative  42.16 
 
 		 247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.115718 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1367  PHP-like protein  32.83 
 
 		 258 aa  122  5e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0119686  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2079  PHP domain protein  35.23 
 
 		 223 aa  119  3e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.376107 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1496  capsular polysaccharide biosynthesis protein  29.19 
 
 		 280 aa  117  9.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1719  phosphotransferase domain-containing protein  33.16 
 
 		 261 aa  116  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0240  capsular polysaccharide biosynthesis protein  30.38 
 
 		 257 aa  112  5e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0243  capsular polysaccharide biosynthesis protein  30.71 
 
 		 257 aa  111  7.000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.321901  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4109  Protein-tyrosine-phosphatase  29.22 
 
 		 266 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000306575 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3009  phosphotransferase domain-containing protein  26.18 
 
 		 267 aa  106  4e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.559929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2654  PHP-like protein  28.08 
 
 		 236 aa  105  7e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1341  protein-tyrosine phosphatase, putative  33.67 
 
 		 253 aa  104  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1979  phosphotransferase domain-containing protein  29.74 
 
 		 282 aa  103  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1212  protein-tyrosine-phosphatase  29.82 
 
 		 241 aa  103  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0542  Protein-tyrosine-phosphatase  30.57 
 
 		 258 aa  103  2e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2234  protein-tyrosine-phosphatase  28.43 
 
 		 259 aa  102  6e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  26.87 
 
 		 256 aa  101  8e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00492024  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3384  Protein-tyrosine-phosphatase  27.55 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1034  protein-tyrosine-phosphatase  30.41 
 
 		 258 aa  99  5e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1671  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  26.01 
 
 		 268 aa  98.6  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.781877  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1505  tyrosine-protein kinase  28.57 
 
 		 585 aa  97.4  2e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2743  protein-tyrosine-phosphatase  27.84 
 
 		 255 aa  96.3  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2686  protein-tyrosine-phosphatase  27.84 
 
 		 255 aa  96.3  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2997  phosphotransferase domain-containing protein  28.87 
 
 		 270 aa  96.3  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1697  Protein-tyrosine-phosphatase  29.38 
 
 		 258 aa  94  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0647662  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3447  PHP domain protein  30.43 
 
 		 240 aa  91.7  8e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.711695  normal  0.0108575 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1972  PHP domain protein  27.35 
 
 		 253 aa  91.7  9e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1386  phosphotransferase domain-containing protein  27.64 
 
 		 245 aa  91.3  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.925309  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2136  phosphotransferase domain-containing protein  28.22 
 
 		 253 aa  90.1  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.042777  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1179  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  26 
 
 		 241 aa  89.7  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.340445  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1070  exopolysaccharide biosynthesis protein  29.8 
 
 		 243 aa  89.7  3e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.145277  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1436  capsular polysaccharide biosynthesis protein  27.32 
 
 		 256 aa  87.8  1e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0173771  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1154  capsular polysaccharide biosynthesis protein  26.01 
 
 		 256 aa  87  2e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000030649  hitchhiker  9.1637e-16 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5288  Protein-tyrosine-phosphatase  29.59 
 
 		 255 aa  84.7  9e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5450  putative tyrosine-protein phosphatase CapC  25.77 
 
 		 255 aa  84.7  9e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.242753  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0943  capsular polysaccharide synthesis enzyme CapC  30.93 
 
 		 212 aa  84.3  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5397  capsular polysaccharide biosynthesis protein  25.26 
 
 		 255 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1174  capsular polysaccharide biosynthesis protein CpsB  31 
 
 		 243 aa  84.3  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2446  PHP domain protein  25.71 
 
 		 217 aa  84.7  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0184546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0137  protein-tyrosine-phosphatase  23.39 
 
 		 254 aa  83.6  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0142  protein-tyrosine-phosphatase  23.39 
 
 		 254 aa  83.6  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1656  protein-tyrosine-phosphatase  27.55 
 
 		 228 aa  84  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1540  capsular polysaccharide biosynthesis protein  25.84 
 
 		 235 aa  82.4  0.000000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0650  exopolysaccharide biosynthesis protein  25.11 
 
 		 239 aa  81.6  0.000000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.893314  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5072  protein-tyrosine-phosphatase  26.8 
 
 		 276 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1074  PHP-like  27.32 
 
 		 242 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5555  putative tyrosine-protein phosphatase CapC  27.32 
 
 		 276 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000949855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5395  putative tyrosine-protein phosphatase CapC  26.8 
 
 		 255 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0318745  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2245  PHP domain protein  25.93 
 
 		 267 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1275  PHP-like phosphoesterase  25.25 
 
 		 238 aa  78.2  0.00000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.227473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4195  protein-tyrosine-phosphatase  25 
 
 		 260 aa  78.2  0.00000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4957  phosphotyrosine-protein phosphatase (capsular polysaccharide biosynthesis)  26.29 
 
 		 258 aa  77  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000276779  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0978  capsular polysaccharide biosynthesis protein  28.5 
 
 		 272 aa  77  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12780  capsular polysaccharide biosynthesis protein  27.4 
 
 		 208 aa  70.9  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3457  PHP domain protein  25.37 
 
 		 260 aa  70.9  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0443415  normal  0.146498 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1280  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  28.65 
 
 		 216 aa  68.9  0.00000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02476  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  25.29 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.936539  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>