106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1779 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1779  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  397  9.999999999999999e-111  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1780  hypothetical protein  55.72 
 
 		 200 aa  224  8e-58  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0463262  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2136  translation initiation factor IF-3  56.57 
 
 		 200 aa  204  8e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0339  hypothetical protein  48.76 
 
 		 199 aa  194  7e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.331374  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0361  putative transcriptional regulator  42.57 
 
 		 192 aa  144  7.0000000000000006e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1678  hypothetical protein  41.05 
 
 		 190 aa  144  8.000000000000001e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1497  hypothetical protein  41.05 
 
 		 190 aa  144  8.000000000000001e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1857  hypothetical protein  39.89 
 
 		 190 aa  142  3e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2054  selenium metabolism protein YedF  36.87 
 
 		 196 aa  124  1e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2521  hypothetical protein  30.05 
 
 		 195 aa  99.4  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.104075  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3077  SirA family protein  32.65 
 
 		 199 aa  99  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000237941 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1060  hypothetical protein  29 
 
 		 206 aa  97.8  8e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0248  SirA family protein  30.69 
 
 		 203 aa  94.7  8e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1242  SirA family protein  33.33 
 
 		 196 aa  94.7  9e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2500  hypothetical protein  32.84 
 
 		 190 aa  94.4  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1708  hypothetical protein  26.87 
 
 		 204 aa  94.4  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0132248  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1085  hypothetical protein  31.03 
 
 		 196 aa  93.2  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.60528e-18  hitchhiker  0.0000092747 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2206  hypothetical protein  32.84 
 
 		 190 aa  93.2  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3765  SirA family protein  30.57 
 
 		 193 aa  93.2  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000718423  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1487  SirA family protein  28.3 
 
 		 223 aa  93.6  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1887  SirA-like protein  32.63 
 
 		 195 aa  92.4  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1417  hypothetical protein  28.22 
 
 		 212 aa  92.4  4e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.126908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0807  selenium metabolism protein YedF  27.7 
 
 		 211 aa  91.7  6e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.45173 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11340  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  27.51 
 
 		 203 aa  91.3  9e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.544302  normal  0.497017 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0367  SirA family protein  30.21 
 
 		 199 aa  88.6  6e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1959  hypothetical protein  26.24 
 
 		 208 aa  87.8  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.51951  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0368  hypothetical protein  27.94 
 
 		 214 aa  87  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.162867 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0124  SirA-like  29.15 
 
 		 193 aa  86.7  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0144261  normal  0.614717 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2448  SirA family protein  29.35 
 
 		 196 aa  86.3  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000888888  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0303  redox protein, regulator of disulfide bond formation  26.7 
 
 		 199 aa  84  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000562968  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3402  SirA family protein  28.72 
 
 		 200 aa  84.3  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0293629 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0677  hypothetical protein  28 
 
 		 197 aa  83.6  0.000000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0251  SirA family protein  29.02 
 
 		 202 aa  84  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1688  SirA family protein  30.26 
 
 		 204 aa  83.2  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.733385  normal  0.789276 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25450  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  29.63 
 
 		 201 aa  82.8  0.000000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.337434  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2431  selenium metabolism protein YedF  29.44 
 
 		 189 aa  79.7  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00446585  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0630  selenium metabolism protein YedF  28.79 
 
 		 198 aa  79  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0025612  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4588  SirA family protein  26.5 
 
 		 197 aa  78.6  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.282378  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2159  SirA family protein  25 
 
 		 197 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000102186  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3433  SirA family protein  26.29 
 
 		 195 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000787487  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3495  SirA family protein  25.39 
 
 		 195 aa  75.1  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.70288e-33 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1894  SirA family protein  25.25 
 
 		 209 aa  70.9  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00825245  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1888  hypothetical protein  24.74 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.660532 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0576  SirA-like protein  30.91 
 
 		 119 aa  61.6  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.676233  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0573  SirA-like protein  34.34 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1581  hypothetical protein  31.07 
 
 		 117 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.38625  normal  0.052602 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0830  hypothetical protein  29.81 
 
 		 114 aa  57  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000290687 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2893  SirA family protein  31.73 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.455878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3421  hypothetical protein  28.71 
 
 		 140 aa  53.9  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00083332 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2433  SirA family protein  43.48 
 
 		 74 aa  52.4  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1439  SirA-like  37.1 
 
 		 72 aa  50.8  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145745  normal  0.024487 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1218  SirA family protein  31.82 
 
 		 77 aa  48.9  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0740  hypothetical protein  31.34 
 
 		 76 aa  46.2  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0137112  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0688  hypothetical protein  31.34 
 
 		 76 aa  46.2  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.301237  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0830  rhodanese domain protein  32.79 
 
 		 186 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00233764  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0872  hypothetical protein  31.34 
 
 		 76 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000063042 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0866  rhodanese domain-containing protein  35.19 
 
 		 186 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0778  hypothetical protein  31.34 
 
 		 75 aa  46.2  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1319  SirA family protein  42.55 
 
 		 70 aa  46.2  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.514232  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0937  rhodanese domain protein  35.19 
 
 		 186 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000726035  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2466  hypothetical protein  38.33 
 
 		 69 aa  45.4  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315359  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0674  hypothetical protein  31.34 
 
 		 76 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.384362  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1696  SirA family protein  30 
 
 		 77 aa  45.4  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4504  hypothetical protein  31.34 
 
 		 76 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117975 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  30.77 
 
 		 201 aa  45.8  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0868  hypothetical protein  32.84 
 
 		 75 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0686  hypothetical protein  31.15 
 
 		 186 aa  45.1  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.745505  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0672  hypothetical protein  31.15 
 
 		 186 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00074605  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0870  rhodanese domain protein  31.15 
 
 		 186 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000347313 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0738  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 186 aa  45.1  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0001064  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0776  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 186 aa  45.1  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2868  hypothetical protein  28.57 
 
 		 77 aa  44.3  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2346  SirA family protein  30 
 
 		 77 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.416048  decreased coverage  0.000000000487815 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0718  SirA family protein  29.03 
 
 		 76 aa  43.9  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1366  SirA family protein  37.68 
 
 		 70 aa  44.3  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0357  SirA family protein  32.84 
 
 		 124 aa  44.3  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000105762  hitchhiker  0.000384401 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0686  SirA family protein  39.13 
 
 		 194 aa  44.7  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0046  SirA family protein  24.64 
 
 		 75 aa  43.9  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0832  hypothetical protein  36.96 
 
 		 76 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4506  rhodanese domain protein  28 
 
 		 186 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000693639 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  31.48 
 
 		 189 aa  44.3  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1620  SirA family protein  31.43 
 
 		 71 aa  44.7  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.591727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1310  SirA family protein  37.68 
 
 		 70 aa  43.5  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0939  hypothetical protein  31.34 
 
 		 75 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000269274  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2082  SirA family protein  34.38 
 
 		 72 aa  43.5  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0033  hypothetical protein  27.87 
 
 		 78 aa  42.7  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000671264  normal  0.064173 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1648  hypothetical protein  29.63 
 
 		 72 aa  42.7  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.282998  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2819  SirA-like protein  30.36 
 
 		 83 aa  42.7  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2500  SirA family protein  32.61 
 
 		 213 aa  43.1  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0643  SirA family protein  42.55 
 
 		 70 aa  43.1  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0688  SirA family protein  32.65 
 
 		 75 aa  43.1  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0248  hypothetical protein  33.33 
 
 		 73 aa  43.1  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0940  hypothetical protein  31.34 
 
 		 75 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596514  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  29.63 
 
 		 189 aa  42.7  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0027  SirA family protein  33.33 
 
 		 70 aa  43.1  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.111426  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1254  hypothetical protein  29.69 
 
 		 77 aa  42.4  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0855  SirA family protein  41.3 
 
 		 70 aa  42.4  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.412959  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1860  SirA family protein  27.54 
 
 		 78 aa  42.4  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000771633  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2339  SirA family protein  27.14 
 
 		 75 aa  42  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0889916  normal  0.318145 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0821  hypothetical protein  37.14 
 
 		 79 aa  41.6  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>