35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1736 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1736  putative Galanin  100 
 
 
315 aa  630  1e-180  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.432742  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1735  hypothetical protein  36 
 
 
330 aa  157  3e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.6897  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0636  hypothetical protein  32.72 
 
 
373 aa  114  3e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1737  hypothetical protein  32.82 
 
 
346 aa  110  4.0000000000000004e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0635  hydrogenase expression/formation protein  27.94 
 
 
367 aa  110  4.0000000000000004e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21011  Galanin  26.33 
 
 
329 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.647337 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2125  hypothetical protein  27.33 
 
 
318 aa  84.7  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1703  hypothetical protein  26.79 
 
 
296 aa  84.3  0.000000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.314163  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2285  putative galanin  29.41 
 
 
321 aa  83.6  0.000000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2814  hypothetical protein  25.82 
 
 
360 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1570  hypothetical protein  25.82 
 
 
364 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.315068  normal  0.277616 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2556  hypothetical protein  26.23 
 
 
360 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.209543  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1542  hypothetical protein  25.41 
 
 
364 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1519  hypothetical protein  25.83 
 
 
338 aa  64.7  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.323363  normal  0.955579 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4262  hypothetical protein  28.57 
 
 
337 aa  63.9  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0093  hypothetical protein  28.57 
 
 
337 aa  63.9  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0090  hypothetical protein  22.63 
 
 
337 aa  63.9  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0088  hypothetical protein  28.57 
 
 
337 aa  63.9  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0091  hypothetical protein  23.16 
 
 
337 aa  63.2  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0087  hypothetical protein  23.16 
 
 
337 aa  63.2  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0092  hypothetical protein  27.73 
 
 
337 aa  62.8  0.000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1883  hypothetical protein  26.29 
 
 
523 aa  58.9  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4055  hypothetical protein  22.82 
 
 
340 aa  57.4  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4245  hypothetical protein  22.75 
 
 
345 aa  56.2  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0158  hypothetical protein  20.74 
 
 
336 aa  55.5  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0874  hypothetical protein  26.6 
 
 
324 aa  55.1  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.256496  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4661  hypothetical protein  22.16 
 
 
345 aa  54.3  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0138  hypothetical protein  24.12 
 
 
336 aa  53.9  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2740  hypothetical protein  22.86 
 
 
337 aa  53.1  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000125522  hitchhiker  0.000527325 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3561  hypothetical protein  21.08 
 
 
338 aa  52  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3651  hypothetical protein  21.91 
 
 
336 aa  51.2  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4379  hypothetical protein  22.75 
 
 
345 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4206  hypothetical protein  22.46 
 
 
345 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3556  hypothetical protein  25 
 
 
332 aa  50.4  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.56461  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1927  hypothetical protein  24.83 
 
 
323 aa  50.1  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.815512  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>