17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1708 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1708  major outer membrane protein  100 
 
 
421 aa  832  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  9.45947e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0396  major outer membrane protein  44.62 
 
 
406 aa  330  3e-89  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0397  major outer membrane protein  44.01 
 
 
406 aa  296  6e-79  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0195  major outer membrane protein  42.27 
 
 
414 aa  285  1e-75  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.672535  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1459  hydrogenase-4 component I  38.66 
 
 
402 aa  264  2e-69  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.133792  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0123  major outer membrane protein  37.64 
 
 
405 aa  217  3e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2060  outer membrane protein  35.94 
 
 
420 aa  209  5e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000846705  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1108  major outer membrane protein  33.33 
 
 
425 aa  163  7e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0434  major outer membrane protein  33.12 
 
 
425 aa  161  2e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  5.03105e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1395  major outer membrane protein  31.51 
 
 
431 aa  159  1e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.37942  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1275  major outer membrane protein  32.97 
 
 
424 aa  142  1e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  2.33206e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0466  major outer membrane protein  30.39 
 
 
440 aa  139  7e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  2.23812e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0366  outer membrane porin  25.88 
 
 
403 aa  61.6  3e-08  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  5.02534e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0019  outer membrane porin  26.59 
 
 
402 aa  50.1  8e-05  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00360128  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0135  hypothetical protein  29.51 
 
 
388 aa  47.8  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.881577  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0469  outer membrane porin  26.02 
 
 
432 aa  48.1  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  5.34788e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2207  metalloid reductase RarA  25.56 
 
 
458 aa  46.2  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>