More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1672 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0166  elongation factor Tu  88.72 
 
 		 399 aa  737    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000496784  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1672  elongation factor Tu  100 
 
 		 399 aa  808    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.000000990168  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0520  elongation factor Tu  85.43 
 
 		 399 aa  711    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.611126  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0440  elongation factor Tu  85.43 
 
 		 399 aa  714    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000285931  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0173  elongation factor Tu  87.47 
 
 		 399 aa  729    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000168704  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0499  elongation factor Tu  85.43 
 
 		 399 aa  711    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240706  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1325  elongation factor Tu  87.47 
 
 		 399 aa  727    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000100394  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0345  translation elongation factor Tu  80.65 
 
 		 399 aa  655    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000850527  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1465  elongation factor Tu  85.43 
 
 		 399 aa  711    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000111535  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  75.44 
 
 		 395 aa  630  1e-179  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2367  elongation factor Tu  75.44 
 
 		 396 aa  626  1e-178  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.709055  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2279  elongation factor Tu  75.44 
 
 		 396 aa  626  1e-178  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2017  elongation factor Tu  75.44 
 
 		 396 aa  626  1e-178  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0185  elongation factor Tu  74.94 
 
 		 394 aa  626  1e-178  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000201579  hitchhiker  0.00891044 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0180  elongation factor Tu  74.94 
 
 		 394 aa  626  1e-178  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000449049  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0185  elongation factor Tu  74.94 
 
 		 394 aa  625  1e-178  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000202802  normal  0.069078 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0197  elongation factor Tu  74.94 
 
 		 394 aa  625  1e-178  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000214684  hitchhiker  0.0000000334083 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1932  elongation factor Tu  75.44 
 
 		 396 aa  626  1e-178  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2462  elongation factor Tu  74.94 
 
 		 400 aa  623  1e-177  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0594726 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0217  elongation factor Tu  75.13 
 
 		 394 aa  617  1e-176  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0229  elongation factor Tu  75.13 
 
 		 394 aa  618  1e-176  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2171  translation elongation factor Tu  74.44 
 
 		 396 aa  618  1e-176  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal  0.373473 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01150  elongation factor Tu  75.38 
 
 		 397 aa  620  1e-176  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.58645e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0345  elongation factor Tu  75.63 
 
 		 399 aa  619  1e-176  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000000030513  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2183  translation elongation factor Tu  74.44 
 
 		 396 aa  618  1e-176  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.557033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0851  elongation factor Tu  74.19 
 
 		 400 aa  618  1e-176  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000784672  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01010  elongation factor Tu  75.38 
 
 		 397 aa  620  1e-176  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000907786  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1910  elongation factor Tu  74.87 
 
 		 396 aa  618  1e-176  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.256474 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2229  elongation factor Tu  74.87 
 
 		 396 aa  618  1e-176  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0152937 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0865  elongation factor Tu  73.68 
 
 		 400 aa  615  1e-175  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000288327  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0261  elongation factor Tu  75.19 
 
 		 396 aa  615  1e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000273962  normal  0.384792 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1059  elongation factor Tu  74.25 
 
 		 396 aa  615  1e-175  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0877336  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2374  elongation factor Tu  74.25 
 
 		 396 aa  615  1e-175  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0274  elongation factor Tu  75.19 
 
 		 396 aa  615  1e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00680281  normal  0.135864 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0197  elongation factor Tu  75.13 
 
 		 394 aa  616  1e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000553237  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0192  elongation factor Tu  74.94 
 
 		 394 aa  617  1e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00059163  decreased coverage  0.000414976 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0234  elongation factor Tu  75.44 
 
 		 396 aa  615  1e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000045907  normal  0.0164851 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0247  elongation factor Tu  75.44 
 
 		 396 aa  616  1e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000151927  normal  0.238121 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0312  elongation factor Tu  74.94 
 
 		 396 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000814669  normal  0.179373 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3021  elongation factor Tu  75.19 
 
 		 396 aa  613  9.999999999999999e-175  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.000000542381  hitchhiker  0.00818484 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3041  elongation factor Tu  75.19 
 
 		 396 aa  613  9.999999999999999e-175  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0080343  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3476  elongation factor Tu  75.19 
 
 		 396 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000712008  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3659  elongation factor Tu  74.94 
 
 		 396 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000150336  hitchhiker  0.00000130036 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08650  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  73.27 
 
 		 400 aa  613  9.999999999999999e-175  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000915749  hitchhiker  0.000000299529 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2634  elongation factor Tu  75.19 
 
 		 396 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000354854  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2649  elongation factor Tu  75.19 
 
 		 396 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.0000546153  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3778  elongation factor Tu  75.19 
 
 		 396 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000176887  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3794  elongation factor Tu  75.19 
 
 		 396 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000750152  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2855  elongation factor Tu  74.69 
 
 		 396 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.29734 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3762  elongation factor Tu  75.19 
 
 		 396 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.000000000163409  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3432  elongation factor Tu  74.94 
 
 		 396 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000234353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3445  elongation factor Tu  74.94 
 
 		 396 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000180875  normal  0.0858427 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3748  elongation factor Tu  75.19 
 
 		 396 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000373215  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1922  elongation factor Tu  75.19 
 
 		 396 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000951262  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3806  elongation factor Tu  75.19 
 
 		 396 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.222005  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3070  elongation factor Tu  75.19 
 
 		 396 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000360276  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3084  elongation factor Tu  75.19 
 
 		 396 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000577807  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2842  elongation factor Tu  74.69 
 
 		 396 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0284377  normal  0.173199 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3646  elongation factor Tu  74.94 
 
 		 396 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000015318  hitchhiker  0.0000000000310582 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0299  elongation factor Tu  75.19 
 
 		 396 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000130927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0312  elongation factor Tu  75.19 
 
 		 396 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000663244  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2761  elongation factor Tu  74.94 
 
 		 396 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14554  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2774  elongation factor Tu  74.94 
 
 		 396 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000183999  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  73.93 
 
 		 400 aa  613  9.999999999999999e-175  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1906  elongation factor Tu  75.19 
 
 		 396 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00000000303162  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2338  elongation factor Tu  74.69 
 
 		 396 aa  613  9.999999999999999e-175  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0567224  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0252  elongation factor Tu  74.94 
 
 		 396 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000268752  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0265  elongation factor Tu  74.94 
 
 		 396 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0194583  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3186  elongation factor Tu  75.19 
 
 		 396 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000468547  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3824  elongation factor Tu  75.19 
 
 		 396 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3171  elongation factor Tu  75.19 
 
 		 396 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000406645  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2326  elongation factor Tu  74.69 
 
 		 396 aa  613  9.999999999999999e-175  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000151481  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0333  elongation factor Tu  74.94 
 
 		 396 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000426715  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0346  elongation factor Tu  74.94 
 
 		 396 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0260269  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0325  elongation factor Tu  74.94 
 
 		 396 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0223104  normal  0.0648127 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3461  elongation factor Tu  75.19 
 
 		 396 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000474832  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0039  elongation factor Tu  74.69 
 
 		 396 aa  608  1e-173  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.00000000135478  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0102  elongation factor Tu  74.94 
 
 		 395 aa  607  1e-173  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000129876  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0270  elongation factor Tu  72.61 
 
 		 400 aa  607  1e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000107043  normal  0.0107333 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0752  elongation factor Tu  73.13 
 
 		 396 aa  610  1e-173  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.993523  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0765  elongation factor Tu  73.13 
 
 		 396 aa  610  1e-173  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0667226  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0409  translation elongation factor Tu  74.5 
 
 		 400 aa  608  1e-173  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000794067  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0284  elongation factor Tu  72.61 
 
 		 400 aa  608  1e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00091062  hitchhiker  0.00368673 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1526  translation elongation factor Tu  74.5 
 
 		 400 aa  609  1e-173  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.358549  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0265  elongation factor Tu  74.87 
 
 		 396 aa  609  1e-173  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000271632  hitchhiker  0.00214055 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0277  elongation factor Tu  74.62 
 
 		 396 aa  608  1e-173  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000015281  unclonable  0.000000133625 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1892  elongation factor Tu  73.93 
 
 		 396 aa  608  1e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457981  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1906  elongation factor Tu  73.93 
 
 		 396 aa  608  1e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00245882  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0051  elongation factor Tu  74.69 
 
 		 396 aa  608  1e-173  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000252436  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2722  elongation factor Tu  73.75 
 
 		 396 aa  609  1e-173  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0752612  normal  0.841998 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2734  elongation factor Tu  73.75 
 
 		 396 aa  609  1e-173  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102462 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0420  elongation factor Tu  71.93 
 
 		 400 aa  607  1e-173  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000158382  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2964  elongation factor Tu  73.87 
 
 		 396 aa  610  1e-173  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.155343  normal  0.97702 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0035  elongation factor Tu  73.75 
 
 		 396 aa  606  9.999999999999999e-173  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000775684  hitchhiker  0.000000000148389 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1362  elongation factor Tu  73.62 
 
 		 396 aa  606  9.999999999999999e-173  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.641297 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2326  elongation factor Tu  72.18 
 
 		 396 aa  607  9.999999999999999e-173  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000632593  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2338  elongation factor Tu  72.18 
 
 		 396 aa  607  9.999999999999999e-173  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000797106  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3186  elongation factor Tu  73 
 
 		 396 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3204  elongation factor Tu  73 
 
 		 396 aa  606  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1543  elongation factor Tu  73.5 
 
 		 396 aa  607  9.999999999999999e-173  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>