More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1672 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0520  elongation factor Tu  85.43 
 
 
399 aa  711  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.611126  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1465  elongation factor Tu  85.43 
 
 
399 aa  711  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  1.11535e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0440  elongation factor Tu  85.43 
 
 
399 aa  714  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  2.85931e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1672  elongation factor Tu  100 
 
 
399 aa  808  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  9.90168e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0173  elongation factor Tu  87.47 
 
 
399 aa  729  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000168704  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1325  elongation factor Tu  87.47 
 
 
399 aa  727  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  1.00394e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0166  elongation factor Tu  88.72 
 
 
399 aa  737  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  4.96784e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0499  elongation factor Tu  85.43 
 
 
399 aa  711  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  2.40706e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0345  translation elongation factor Tu  80.65 
 
 
399 aa  655  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  8.50527e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  75.44 
 
 
395 aa  630  1e-179  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  1.52961e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1932  elongation factor Tu  75.44 
 
 
396 aa  626  1e-178  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0185  elongation factor Tu  74.94 
 
 
394 aa  625  1e-178  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  2.02802e-06  normal  0.069078 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0185  elongation factor Tu  74.94 
 
 
394 aa  626  1e-178  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  2.01579e-08  hitchhiker  0.00891044 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0197  elongation factor Tu  74.94 
 
 
394 aa  625  1e-178  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  2.14684e-06  hitchhiker  3.34083e-08 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2279  elongation factor Tu  75.44 
 
 
396 aa  626  1e-178  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2367  elongation factor Tu  75.44 
 
 
396 aa  626  1e-178  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.709055  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2017  elongation factor Tu  75.44 
 
 
396 aa  626  1e-178  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0180  elongation factor Tu  74.94 
 
 
394 aa  626  1e-178  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  4.49049e-06  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2462  elongation factor Tu  74.94 
 
 
400 aa  623  1e-177  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0594726 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2171  translation elongation factor Tu  74.44 
 
 
396 aa  618  1e-176  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal  0.373473 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2183  translation elongation factor Tu  74.44 
 
 
396 aa  618  1e-176  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.557033  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0851  elongation factor Tu  74.19 
 
 
400 aa  618  1e-176  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  7.84672e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01010  elongation factor Tu  75.38 
 
 
397 aa  620  1e-176  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.07786e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01150  elongation factor Tu  75.38 
 
 
397 aa  620  1e-176  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.58645e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2229  elongation factor Tu  74.87 
 
 
396 aa  618  1e-176  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0152937 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1910  elongation factor Tu  74.87 
 
 
396 aa  618  1e-176  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.256474 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0345  elongation factor Tu  75.63 
 
 
399 aa  619  1e-176  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  3.0513e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0229  elongation factor Tu  75.13 
 
 
394 aa  618  1e-176  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0217  elongation factor Tu  75.13 
 
 
394 aa  617  1e-176  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1059  elongation factor Tu  74.25 
 
 
396 aa  615  1e-175  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0877336  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0247  elongation factor Tu  75.44 
 
 
396 aa  616  1e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  1.51927e-06  normal  0.238121 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0192  elongation factor Tu  74.94 
 
 
394 aa  617  1e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00059163  decreased coverage  0.000414976 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0234  elongation factor Tu  75.44 
 
 
396 aa  615  1e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  4.5907e-07  normal  0.0164851 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0197  elongation factor Tu  75.13 
 
 
394 aa  616  1e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  5.53237e-06  unclonable  2.41033e-11 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2374  elongation factor Tu  74.25 
 
 
396 aa  615  1e-175  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0274  elongation factor Tu  75.19 
 
 
396 aa  615  1e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00680281  normal  0.135864 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0865  elongation factor Tu  73.68 
 
 
400 aa  615  1e-175  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  2.88327e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0261  elongation factor Tu  75.19 
 
 
396 aa  615  1e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000273962  normal  0.384792 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2842  elongation factor Tu  74.69 
 
 
396 aa  611  1e-174  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0284377  normal  0.173199 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2855  elongation factor Tu  74.69 
 
 
396 aa  611  1e-174  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.29734 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2774  elongation factor Tu  74.94 
 
 
396 aa  612  1e-174  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000183999  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2761  elongation factor Tu  74.94 
 
 
396 aa  612  1e-174  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14554  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0325  elongation factor Tu  74.94 
 
 
396 aa  612  1e-174  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0223104  normal  0.0648127 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1922  elongation factor Tu  75.19 
 
 
396 aa  613  1e-174  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  9.51262e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3461  elongation factor Tu  75.19 
 
 
396 aa  613  1e-174  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000474832  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3476  elongation factor Tu  75.19 
 
 
396 aa  613  1e-174  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  7.12008e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0346  elongation factor Tu  74.94 
 
 
396 aa  612  1e-174  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0260269  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0333  elongation factor Tu  74.94 
 
 
396 aa  612  1e-174  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  4.26715e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3806  elongation factor Tu  75.19 
 
 
396 aa  613  1e-174  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.222005  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3762  elongation factor Tu  75.19 
 
 
396 aa  613  1e-174  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  1.63409e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3748  elongation factor Tu  75.19 
 
 
396 aa  613  1e-174  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  3.73215e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0265  elongation factor Tu  74.94 
 
 
396 aa  612  1e-174  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0194583  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0252  elongation factor Tu  74.94 
 
 
396 aa  612  1e-174  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  2.68752e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3171  elongation factor Tu  75.19 
 
 
396 aa  613  1e-174  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  4.06645e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3824  elongation factor Tu  75.19 
 
 
396 aa  613  1e-174  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3186  elongation factor Tu  75.19 
 
 
396 aa  613  1e-174  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  4.68547e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0312  elongation factor Tu  75.19 
 
 
396 aa  614  1e-174  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  6.63244e-08  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0299  elongation factor Tu  75.19 
 
 
396 aa  614  1e-174  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  1.30927e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3646  elongation factor Tu  74.94 
 
 
396 aa  613  1e-174  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  1.5318e-08  hitchhiker  3.10582e-11 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3084  elongation factor Tu  75.19 
 
 
396 aa  613  1e-174  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  5.77807e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3070  elongation factor Tu  75.19 
 
 
396 aa  613  1e-174  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  3.60276e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0312  elongation factor Tu  74.94 
 
 
396 aa  612  1e-174  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  8.14669e-07  normal  0.179373 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2649  elongation factor Tu  75.19 
 
 
396 aa  613  1e-174  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  5.46153e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  73.93 
 
 
400 aa  613  1e-174  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  5.57985e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2338  elongation factor Tu  74.69 
 
 
396 aa  613  1e-174  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0567224  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3778  elongation factor Tu  75.19 
 
 
396 aa  613  1e-174  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000176887  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3794  elongation factor Tu  75.19 
 
 
396 aa  613  1e-174  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  7.50152e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3445  elongation factor Tu  74.94 
 
 
396 aa  612  1e-174  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  1.80875e-06  normal  0.0858427 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3432  elongation factor Tu  74.94 
 
 
396 aa  612  1e-174  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  2.34353e-07  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2634  elongation factor Tu  75.19 
 
 
396 aa  613  1e-174  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000354854  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2326  elongation factor Tu  74.69 
 
 
396 aa  613  1e-174  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  1.51481e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3041  elongation factor Tu  75.19 
 
 
396 aa  613  1e-174  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0080343  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08650  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  73.27 
 
 
400 aa  613  1e-174  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  9.15749e-05  hitchhiker  2.99529e-07 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3659  elongation factor Tu  74.94 
 
 
396 aa  613  1e-174  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  1.50336e-07  hitchhiker  1.30036e-06 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1906  elongation factor Tu  75.19 
 
 
396 aa  613  1e-174  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  3.03162e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3021  elongation factor Tu  75.19 
 
 
396 aa  613  1e-174  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  5.42381e-07  hitchhiker  0.00818484 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0051  elongation factor Tu  74.69 
 
 
396 aa  608  1e-173  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  2.52436e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2734  elongation factor Tu  73.75 
 
 
396 aa  609  1e-173  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.102462 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1526  translation elongation factor Tu  74.5 
 
 
400 aa  609  1e-173  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.358549  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0409  translation elongation factor Tu  74.5 
 
 
400 aa  608  1e-173  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  7.94067e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0102  elongation factor Tu  74.94 
 
 
395 aa  607  1e-173  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  1.29876e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0284  elongation factor Tu  72.61 
 
 
400 aa  608  1e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00091062  hitchhiker  0.00368673 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0270  elongation factor Tu  72.61 
 
 
400 aa  607  1e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  1.07043e-08  normal  0.0107333 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0277  elongation factor Tu  74.62 
 
 
396 aa  608  1e-173  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  1.5281e-06  unclonable  1.33625e-07 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1906  elongation factor Tu  73.93 
 
 
396 aa  608  1e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00245882  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2964  elongation factor Tu  73.87 
 
 
396 aa  610  1e-173  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.155343  normal  0.97702 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0039  elongation factor Tu  74.69 
 
 
396 aa  608  1e-173  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  1.35478e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0765  elongation factor Tu  73.13 
 
 
396 aa  610  1e-173  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0667226  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0752  elongation factor Tu  73.13 
 
 
396 aa  610  1e-173  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.993523  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0265  elongation factor Tu  74.87 
 
 
396 aa  609  1e-173  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  2.71632e-06  hitchhiker  0.00214055 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0420  elongation factor Tu  71.93 
 
 
400 aa  607  1e-173  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.58382e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2722  elongation factor Tu  73.75 
 
 
396 aa  609  1e-173  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0752612  normal  0.841998 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1892  elongation factor Tu  73.93 
 
 
396 aa  608  1e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457981  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0105  elongation factor Tu  75.19 
 
 
395 aa  604  1e-172  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3321  elongation factor Tu  74.44 
 
 
396 aa  607  1e-172  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0355  elongation factor Tu  73.93 
 
 
396 aa  604  1e-172  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.967159  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0371  elongation factor Tu  73.93 
 
 
396 aa  604  1e-172  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.299108 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1403  elongation factor Tu  71.68 
 
 
395 aa  605  1e-172  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2788  translation elongation factor Tu  72.86 
 
 
397 aa  605  1e-172  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.117991  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3669  elongation factor Tu  73 
 
 
396 aa  606  1e-172  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>