More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1562 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1562  transformation system protein  100 
 
 
187 aa  370  1e-102  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.586126  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1559  N-terminal methylation domain-containing protein  48.48 
 
 
186 aa  129  2.0000000000000002e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.989333  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1565  N-terminal methylation domain-containing protein  52.54 
 
 
191 aa  114  6e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0100  N-terminal methylation domain-containing protein  43.03 
 
 
170 aa  104  7e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000252609  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1109  hypothetical protein  66.67 
 
 
153 aa  101  5e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.925948  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1599  N-terminal methylation domain-containing protein  68.83 
 
 
152 aa  97.1  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1110  N-terminal methylation domain-containing protein  49.02 
 
 
156 aa  85.9  3e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.383546  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1532  transformation system protein  54.17 
 
 
171 aa  83.2  0.000000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0367  transformation system protein  52.78 
 
 
169 aa  82.8  0.000000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1342  transformation system protein  51.39 
 
 
171 aa  82.8  0.000000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0115  N-terminal methylation domain-containing protein  61.02 
 
 
135 aa  77.8  0.00000000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1477  hypothetical protein  35.71 
 
 
163 aa  75.9  0.0000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.740331  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1478  hypothetical protein  35.71 
 
 
163 aa  75.9  0.0000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.930132  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1385  N- methylation  65.38 
 
 
133 aa  71.6  0.000000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1532  putative transformation system protein CtsG  41.25 
 
 
190 aa  68.9  0.00000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1598  lipoprotein ABC transporter permease  66.67 
 
 
143 aa  66.2  0.0000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0864  N-terminal methylation domain-containing protein  40 
 
 
136 aa  62.4  0.000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0320  N- methylation  53.7 
 
 
141 aa  59.7  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0359  hypothetical protein  46.97 
 
 
541 aa  60.1  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0177476  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0028  putative transformation system protein  44.07 
 
 
162 aa  58.9  0.00000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00183971  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0677  lipoprotein ABC transporter permease  51.85 
 
 
137 aa  58.2  0.00000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.319442  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3341  methylation  37.21 
 
 
205 aa  57.4  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000885834  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3745  methylation site containing protein  45.57 
 
 
201 aa  57  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0403042  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3762  methylation site containing protein  52.63 
 
 
202 aa  55.8  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000262752  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0395  methylation site containing protein  43.04 
 
 
211 aa  55.8  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0635812  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0511  MSHA pilin protein MshB  37.21 
 
 
205 aa  55.5  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000086206  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0960  hypothetical protein  36.76 
 
 
186 aa  55.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0490  MSHA pilin protein MshB  37.21 
 
 
205 aa  55.5  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000965015  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0933  hypothetical protein  36.76 
 
 
186 aa  55.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.65 
 
 
158 aa  55.1  0.0000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0514  MSHA pilin protein MshB  37.21 
 
 
205 aa  55.5  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00061527  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3829  MSHA pilin protein MshB  37.21 
 
 
205 aa  55.5  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000175672  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2038  fimbrial protein pilin  42.25 
 
 
129 aa  55.1  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2391  general secretion pathway protein G  47.17 
 
 
144 aa  54.7  0.0000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000271033 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0754  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  63.16 
 
 
195 aa  54.7  0.0000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.430859  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4106  MSHA pilin protein MshB  46.05 
 
 
205 aa  54.3  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0472  methylation site containing protein  50.88 
 
 
205 aa  53.9  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000795599  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3657  methylation site containing protein  50.88 
 
 
205 aa  54.3  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000205665  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0566  MSHA pilin protein MshB  39 
 
 
205 aa  53.5  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.571105  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0550  methylation site containing protein  49.12 
 
 
218 aa  53.1  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000424061  normal  0.764365 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  57.5 
 
 
165 aa  53.5  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0868  transformation system protein  47.92 
 
 
67 aa  53.5  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.371392  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4355  general secretion pathway protein G  43.4 
 
 
144 aa  52.8  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0345  general secretion pathway protein H  34.67 
 
 
176 aa  52.8  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177644  normal  0.0749297 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0253  general secretion pathway protein G  47.17 
 
 
150 aa  52.8  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1201  Tfp pilus assembly protein PilE-like  36.17 
 
 
189 aa  52.8  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1097  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  30.93 
 
 
151 aa  52.8  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.282151  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0837  N- methylation  78.57 
 
 
232 aa  52.8  0.000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.288173  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.73 
 
 
157 aa  52  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3480  methylation site containing protein  49.12 
 
 
205 aa  52.4  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000493749  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1480  transformation system protein  47.54 
 
 
82 aa  52.4  0.000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.754405  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4411  methylation site containing protein  46.55 
 
 
219 aa  52.4  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000316241  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0231  general secretion pathway protein G  47.06 
 
 
149 aa  52  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0866  N-terminal methylation domain-containing protein  39.66 
 
 
210 aa  52  0.000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.870147  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1488  hypothetical protein  46.3 
 
 
158 aa  52  0.000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.109192  normal  0.403243 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1199  hypothetical protein  37.14 
 
 
221 aa  51.2  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.789092  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3100  hypothetical protein  65.71 
 
 
136 aa  51.2  0.000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4588  general secretion pathway protein G  38.1 
 
 
143 aa  50.8  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3584  fimbrial protein PilA  37.88 
 
 
176 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194411  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0765  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.54 
 
 
170 aa  50.4  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000473938  hitchhiker  1.49827e-16 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0956  general secretion pathway protein G  38.98 
 
 
145 aa  50.8  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.194745  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2522  pilin  37.88 
 
 
176 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2913  hypothetical protein  44.44 
 
 
182 aa  50.8  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1007  general secretion pathway protein G  38.98 
 
 
145 aa  50.8  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0552  MSHA pilin protein MshA  30.88 
 
 
159 aa  50.8  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00386307  normal  0.526597 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3266  general secretion pathway protein G  38.98 
 
 
145 aa  50.8  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000062887  hitchhiker  0.00000000000000294917 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0324  hypothetical protein  48.94 
 
 
167 aa  50.8  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00212965  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3616  general secretion pathway protein G  41.51 
 
 
144 aa  50.4  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  36.17 
 
 
167 aa  50.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0816  type IV pilus biogenesis protein  40.98 
 
 
133 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0530  hypothetical protein  44.44 
 
 
192 aa  50.4  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4731  general secretion pathway protein G  39.62 
 
 
144 aa  50.1  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0599807  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0366  N-terminal methylation  62.5 
 
 
132 aa  50.1  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2151  membrane protein  46.3 
 
 
186 aa  50.1  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.899411  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0048  pilin polypeptide PilA-like  46.15 
 
 
144 aa  50.1  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.335089  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3384  general secretion pathway protein G  40.38 
 
 
154 aa  50.1  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0460  MSHA pilin protein MshB  47.37 
 
 
201 aa  50.4  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.671  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0100  general secretion pathway protein G  38.81 
 
 
144 aa  50.1  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0760  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  65.71 
 
 
156 aa  49.7  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.014468  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0448  hypothetical protein  44.44 
 
 
191 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2857  general secretion pathway protein G  37.74 
 
 
157 aa  49.3  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2532  general secretion pathway protein G  40.38 
 
 
156 aa  49.3  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211317  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0169  general secretion pathway protein G  41.51 
 
 
144 aa  49.3  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1421  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  34.34 
 
 
172 aa  49.3  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0006  general secretion pathway protein G  39.62 
 
 
144 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0815216 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3221  general secretion pathway protein G  35.59 
 
 
163 aa  49.7  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0926  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  32.1 
 
 
171 aa  49.3  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000619994  hitchhiker  8.71814e-18 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3363  methylation  55.56 
 
 
139 aa  49.3  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57133  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3564  general secretion pathway protein G  41.51 
 
 
144 aa  49.7  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1081  general secretion pathway protein G  35 
 
 
146 aa  49.3  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0154  general secretion pathway protein G  41.51 
 
 
144 aa  49.3  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0392  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.1 
 
 
175 aa  49.3  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000336485  hitchhiker  0.0000000727713 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0147  general secretion pathway protein G  41.51 
 
 
144 aa  49.7  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1548  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  52.5 
 
 
167 aa  49.3  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  hitchhiker  0.00000000000000294624 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0216  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  51.16 
 
 
163 aa  48.9  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0379234 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0124  general secretion pathway protein G  37.88 
 
 
144 aa  48.9  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0159  general secretion pathway protein G  41.51 
 
 
144 aa  49.3  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0154  general secretion pathway protein G  41.51 
 
 
144 aa  49.3  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0108  general secretion pathway protein G  39.62 
 
 
144 aa  48.9  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0340  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  52.5 
 
 
165 aa  48.9  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>