More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1446 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0984  type I secretion system ATPase  64.23 
 
 
700 aa  933    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0815075  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1446  leukotoxin translocation ATP-binding protein LktB  100 
 
 
699 aa  1408    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0404979  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3076  Type I secretion system ATPase, HlyB  44.24 
 
 
720 aa  629  1e-179  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5423  toxin secretion ABC transporter (ATP-binding and membrane protein)  45.73 
 
 
705 aa  615  1e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.192107 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0292  cyclolysin-type secretion composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  44.73 
 
 
725 aa  615  9.999999999999999e-175  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0404575 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5003  type I secretion system ATPase  45.71 
 
 
728 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19193  normal  0.91049 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5157  type I secretion system ATPase  45.74 
 
 
728 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.819615 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6772  type I secretion system ATPase  44.96 
 
 
712 aa  609  1e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1970  type I secretion system ATPase  44.88 
 
 
731 aa  607  9.999999999999999e-173  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.231744  normal  0.591198 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2998  type I secretion system ATPase  43.88 
 
 
753 aa  603  1.0000000000000001e-171  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1499  type I secretion system ATPase  43.94 
 
 
720 aa  603  1.0000000000000001e-171  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0019  type I secretion system ATPase family protein  44.7 
 
 
706 aa  598  1e-170  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1566  toxin secretion ABC transporter ATP-binding protein  43.65 
 
 
720 aa  601  1e-170  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.206767  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2693  type I secretion system ATPase  41.49 
 
 
724 aa  599  1e-170  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2369  type I secretion system ATPase  43.68 
 
 
743 aa  600  1e-170  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2316  type I secretion system ATPase  41.49 
 
 
724 aa  599  1e-170  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2576  type I secretion system ATPase  43.43 
 
 
750 aa  601  1e-170  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00352017 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4927  toxin secretion ABC transporter protein  42.8 
 
 
731 aa  592  1e-168  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4165  type I secretion system ATPase  42.4 
 
 
726 aa  585  1.0000000000000001e-165  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143199  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3696  type I secretion system ATPase  42.63 
 
 
720 aa  582  1e-164  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.202443 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6494  type I secretion system ATPase  42.59 
 
 
721 aa  578  1e-164  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3820  type I secretion system ATPase  40.48 
 
 
741 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0301354  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1958  type I secretion system ATPase  40.48 
 
 
739 aa  570  1e-161  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0570  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.9 
 
 
717 aa  565  1.0000000000000001e-159  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1020  Type I secretion system ATPase, HlyB  41.52 
 
 
739 aa  559  1e-158  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0884  type I secretion system ATPase  42.14 
 
 
726 aa  557  1e-157  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1455  cyclic nucleotide-binding protein  46.58 
 
 
892 aa  558  1e-157  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4225  Type I secretion system ATPase, HlyB  42.41 
 
 
865 aa  554  1e-156  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3578  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  43.78 
 
 
1024 aa  528  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1188  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  43.19 
 
 
1003 aa  523  1e-147  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229753  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  39.94 
 
 
1000 aa  525  1e-147  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2002  type I secretion system ATPase  37.84 
 
 
712 aa  521  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1889  type I secretion system ATPase  37.7 
 
 
712 aa  519  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0545  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  44.6 
 
 
1008 aa  518  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.782135  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0528  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  44.6 
 
 
1008 aa  518  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2258  type I secretion system ATPase  37.84 
 
 
712 aa  518  1.0000000000000001e-145  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  39.86 
 
 
1019 aa  514  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2857  cyclic nucleotide-binding protein  38.63 
 
 
1038 aa  509  1e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.590453  hitchhiker  0.00593059 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1837  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  41.86 
 
 
1001 aa  509  1e-143  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.548602  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3264  cyclic nucleotide-binding protein  38.76 
 
 
1038 aa  511  1e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1352  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  40.21 
 
 
999 aa  509  1e-143  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.897617  normal  0.235 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0217  Type I secretion system ATPase, HlyB  41.64 
 
 
971 aa  506  9.999999999999999e-143  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.349074  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1224  ATPase  38.39 
 
 
980 aa  503  1e-141  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25476  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06455  RTX toxin transporter  39.91 
 
 
714 aa  504  1e-141  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21011  ATPase  38.78 
 
 
930 aa  504  1e-141  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.625289 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2527  Type I secretion system ATPase, HlyB  41.05 
 
 
976 aa  499  1e-140  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1056  putative toxin secretion transporter  38.88 
 
 
719 aa  493  9.999999999999999e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6407  ABC transporter related  36.45 
 
 
714 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1659  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  38.76 
 
 
1013 aa  492  9.999999999999999e-139  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000123584  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6211  ABC transporter related  36.6 
 
 
714 aa  491  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332953  normal  0.16806 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0635  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  39.68 
 
 
1016 aa  491  1e-137  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000920365  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1843  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  38.97 
 
 
1012 aa  485  1e-135  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00224426  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00861  ABC transporter, multi drug efflux family protein  36.61 
 
 
975 aa  480  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.02392 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2547  ABC transporter related  37.02 
 
 
740 aa  473  1e-132  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293981  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0410  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  40.26 
 
 
908 aa  474  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1891  toxin ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.81 
 
 
715 aa  474  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2004  type I secretion system ATPase  38.66 
 
 
715 aa  473  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0225  bacteriocin-processing peptidase  38.03 
 
 
908 aa  469  1.0000000000000001e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01291  hypothetical protein  37.58 
 
 
986 aa  471  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.838373 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2680  cyclic nucleotide-binding protein  38.78 
 
 
906 aa  466  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3424  cyclic nucleotide-binding protein  38.93 
 
 
906 aa  467  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06452  ABC-type RTX toxin transporter ATPase and permease components  43.73 
 
 
523 aa  466  9.999999999999999e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14311  hypothetical protein  40.03 
 
 
968 aa  466  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3048  ABC transporter related  36.17 
 
 
740 aa  465  1e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0117  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  36.3 
 
 
1006 aa  460  9.999999999999999e-129  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.152098  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1097  bacteriocin-processing peptidase  36.49 
 
 
1042 aa  456  1e-127  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.610594  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2722  ABC transporter related  42.03 
 
 
730 aa  455  1.0000000000000001e-126  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0728  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  36.81 
 
 
1013 aa  449  1e-125  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.637206  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4383  bacteriocin-processing peptidase  38.35 
 
 
1011 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.443877  normal  0.0633498 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1182  ATPase  38.32 
 
 
982 aa  447  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  34.05 
 
 
1040 aa  426  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3863  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  36.73 
 
 
736 aa  418  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.779093  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  34.42 
 
 
1018 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  35.03 
 
 
1018 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3834  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  35.09 
 
 
1018 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.823997 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3852  ABC export transporter, fused inner membrane and ATPase subunits  36.54 
 
 
724 aa  415  1e-114  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.382058  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4070  ABC transporter related  36.54 
 
 
724 aa  411  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00000105324  normal  0.180346 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0425  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease, putative  36.73 
 
 
721 aa  387  1e-106  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1051  ABC transporter related  30.91 
 
 
744 aa  387  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0535  ABC transporter, transmembrane region  31.48 
 
 
744 aa  381  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.622763 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1440  ABC transporter related  33.77 
 
 
770 aa  382  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.338764  normal  0.147226 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2431  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  34.6 
 
 
759 aa  377  1e-103  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00637775  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2883  ABC transporter related  32.07 
 
 
741 aa  376  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0605721 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3567  ABC transporter related  33.61 
 
 
767 aa  375  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1898  ABC transporter related  34.21 
 
 
742 aa  367  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.15263  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1869  ABC transporter related  35.04 
 
 
726 aa  357  5e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1473  secretion system protein B  32.71 
 
 
718 aa  356  5.999999999999999e-97  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1510  secretion system protein B  32.56 
 
 
718 aa  356  6.999999999999999e-97  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.77 
 
 
586 aa  351  3e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2265  ABC-type bacteriocin transporter  32.03 
 
 
727 aa  350  7e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  37.59 
 
 
586 aa  348  2e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0327  ABC-type bacteriocin transporter  32.86 
 
 
734 aa  348  2e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  36.93 
 
 
586 aa  348  2e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.59 
 
 
586 aa  348  2e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  36.6 
 
 
597 aa  348  2e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.48 
 
 
586 aa  348  3e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  37.41 
 
 
586 aa  347  4e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  34.26 
 
 
727 aa  347  4e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  37.41 
 
 
586 aa  347  4e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  37.25 
 
 
586 aa  347  5e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>