141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1369 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1369  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  100 
 
 		 282 aa  570  1e-161  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0369  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  59.27 
 
 		 283 aa  338  5.9999999999999996e-92  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.10851  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1783  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  56.93 
 
 		 286 aa  333  2e-90  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.529991  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2132  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  54.74 
 
 		 286 aa  322  5e-87  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1928  tRNA synthetase class II (G H P and S)  49.28 
 
 		 284 aa  292  4e-78  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0074  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  46.91 
 
 		 282 aa  246  3e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0999  histidine--tRNA ligase  26.85 
 
 		 380 aa  87.4  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.357666  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1734  histidyl-tRNA synthetase  23.95 
 
 		 410 aa  75.5  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0415  histidyl-tRNA synthetase  23.3 
 
 		 410 aa  73.9  0.000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.11603  hitchhiker  0.00165896 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0749  histidyl-tRNA synthetase 2  25.93 
 
 		 389 aa  72.4  0.000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2348  histidyl-tRNA synthetase  23.9 
 
 		 377 aa  71.6  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.901013  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3452  histidyl-tRNA synthetase  22.19 
 
 		 409 aa  68.6  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.192864 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0030  histidyl-tRNA synthetase  27.8 
 
 		 418 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.289573  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0659  histidyl-tRNA synthetase  29.55 
 
 		 431 aa  67.4  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2198  histidyl-tRNA synthetase  24.35 
 
 		 409 aa  66.2  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1381  histidyl-tRNA synthetase  22.82 
 
 		 414 aa  66.2  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158923  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1585  histidyl-tRNA synthetase  23.28 
 
 		 410 aa  66.2  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1068  histidyl-tRNA synthetase  27.46 
 
 		 414 aa  65.9  0.0000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2263  histidyl-tRNA synthetase  23.89 
 
 		 435 aa  65.1  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1848  histidyl-tRNA synthetase  24.77 
 
 		 425 aa  64.7  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  25.33 
 
 		 419 aa  63.2  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  26.96 
 
 		 421 aa  62.4  0.000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0744  histidyl-tRNA synthetase  26.17 
 
 		 419 aa  62  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100604  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1272  histidyl-tRNA synthetase  24.35 
 
 		 408 aa  62  0.00000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0694221  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1677  histidyl-tRNA synthetase  23.36 
 
 		 423 aa  61.2  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038851 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0745  histidyl-tRNA synthetase  27.92 
 
 		 408 aa  60.8  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1621  histidyl-tRNA synthetase  22.46 
 
 		 421 aa  61.2  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0856  histidyl-tRNA synthetase  26.04 
 
 		 408 aa  59.3  0.00000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0748  histidyl-tRNA synthetase  23.31 
 
 		 415 aa  59.7  0.00000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2787  histidine--tRNA ligase  24.54 
 
 		 418 aa  59.3  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0061  histidyl-tRNA synthetase  24.75 
 
 		 426 aa  59.3  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.352385  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  23.28 
 
 		 424 aa  59.3  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06821  histidyl-tRNA synthetase  24.41 
 
 		 423 aa  58.9  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.254744  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1255  histidyl-tRNA synthetase  24.14 
 
 		 426 aa  58.5  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.505298  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0786  histidyl-tRNA synthetase  26.75 
 
 		 408 aa  58.2  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00313764  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1453  histidyl-tRNA synthetase  24 
 
 		 421 aa  57.8  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0552  histidyl-tRNA synthetase  23.2 
 
 		 417 aa  57.8  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1247  histidyl-tRNA synthetase  26.58 
 
 		 408 aa  57.4  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0392037  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0295  histidyl-tRNA synthetase  23.36 
 
 		 430 aa  57.4  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000190773  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5012  histidyl-tRNA synthetase  28.47 
 
 		 430 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1950  histidyl-tRNA synthetase  24.57 
 
 		 426 aa  56.2  0.0000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2359  histidine--tRNA ligase  21.97 
 
 		 401 aa  55.8  0.0000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2002  Histidine--tRNA ligase  26.73 
 
 		 409 aa  55.8  0.0000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1786  histidyl-tRNA synthetase  22.78 
 
 		 430 aa  55.1  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736899 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0188  histidyl-tRNA synthetase  23.02 
 
 		 445 aa  55.5  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.207705  decreased coverage  0.00812888 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1055  histidyl-tRNA synthetase  26.37 
 
 		 418 aa  55.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf392  histidyl-tRNA synthetase  23.78 
 
 		 417 aa  55.5  0.000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.438879  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0615  tRNA synthetase, class II (G, H, P and S)  24.5 
 
 		 370 aa  54.7  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.542186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02180  histidyl-tRNA synthetase  24.52 
 
 		 418 aa  54.7  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000127032  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1184  histidyl-tRNA synthetase  22.11 
 
 		 429 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1211  histidyl-tRNA synthetase  22.11 
 
 		 429 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  23.38 
 
 		 423 aa  54.3  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1136  histidyl-tRNA synthetase  24.06 
 
 		 414 aa  54.7  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.850642  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  22.4 
 
 		 429 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1794  histidyl-tRNA synthetase  25.34 
 
 		 418 aa  53.9  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0933  histidyl-tRNA synthetase  21.49 
 
 		 470 aa  53.5  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.638014  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  21.77 
 
 		 421 aa  53.5  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0894  histidyl-tRNA synthetase  26.57 
 
 		 409 aa  53.1  0.000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0307852  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0924  histidyl-tRNA synthetase  25 
 
 		 418 aa  52.4  0.000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2267  histidyl-tRNA synthetase  23.44 
 
 		 430 aa  52.4  0.000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.921097  normal  0.960691 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0658  histidyl-tRNA synthetase  22.01 
 
 		 419 aa  52  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2108  histidyl-tRNA synthetase  23.55 
 
 		 426 aa  51.2  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1770  histidine--tRNA ligase  22.97 
 
 		 387 aa  50.8  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0828194  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0765  histidine--tRNA ligase  21.79 
 
 		 412 aa  51.2  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1830  histidyl-tRNA synthetase  25 
 
 		 433 aa  50.8  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0925  histidyl-tRNA synthetase  23.15 
 
 		 410 aa  50.8  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1726  histidyl-tRNA synthetase  25.75 
 
 		 420 aa  51.2  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1288  histidyl-tRNA synthetase  26.79 
 
 		 402 aa  50.4  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.373559  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1653  histidyl-tRNA synthetase  27.13 
 
 		 420 aa  50.8  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.52822  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1688  histidyl-tRNA synthetase  26.45 
 
 		 420 aa  50.8  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0106909  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1721  histidyl-tRNA synthetase  26.45 
 
 		 420 aa  50.8  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000299078  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0862  histidyl-tRNA synthetase  25.17 
 
 		 418 aa  50.8  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.393397  hitchhiker  0.0052458 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0393  histidyl-tRNA synthetase  22.67 
 
 		 429 aa  50.4  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0220  histidyl-tRNA synthetase  24.11 
 
 		 430 aa  49.7  0.00005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0944  histidyl-tRNA synthetase  23.93 
 
 		 426 aa  49.7  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1130  histidyl-tRNA synthetase  22.71 
 
 		 403 aa  49.3  0.00006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0629126  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0528  histidyl-tRNA synthetase  26.85 
 
 		 421 aa  49.7  0.00006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3119  histidyl-tRNA synthetase  25 
 
 		 423 aa  49.3  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109936  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3158  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  22.65 
 
 		 394 aa  49.7  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2077  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  26.05 
 
 		 383 aa  49.3  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0324  histidyl-tRNA synthetase  23.13 
 
 		 414 aa  48.5  0.0001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.272027  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0713  histidyl-tRNA synthetase  24.4 
 
 		 423 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00404453  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4486  histidyl-tRNA synthetase  24.4 
 
 		 423 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.451544  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4298  histidyl-tRNA synthetase  24.4 
 
 		 423 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.408041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4136  histidyl-tRNA synthetase  24.4 
 
 		 423 aa  48.1  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4146  histidyl-tRNA synthetase  24.4 
 
 		 423 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483726  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0902  histidyl-tRNA synthetase, class IIA  20.54 
 
 		 423 aa  47.4  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.717157  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4483  histidyl-tRNA synthetase  24.4 
 
 		 423 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6071e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4633  histidyl-tRNA synthetase  24.4 
 
 		 423 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4414  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2311  histidyl-tRNA synthetase  25 
 
 		 421 aa  47.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.202906  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0781  histidyl-tRNA synthetase  22.08 
 
 		 413 aa  47.8  0.0002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0009  histidyl-tRNA synthetase  24.03 
 
 		 430 aa  47.8  0.0002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.138679  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4523  histidyl-tRNA synthetase  24.4 
 
 		 423 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845471  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1310  histidyl-tRNA synthetase  27.34 
 
 		 433 aa  47.8  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4536  histidyl-tRNA synthetase  24.4 
 
 		 423 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000118978  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4250  histidyl-tRNA synthetase  24.4 
 
 		 423 aa  47.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000611517  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1261  histidyl-tRNA synthetase  24.09 
 
 		 410 aa  47.8  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.848478  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0846  histidyl-tRNA synthetase, putative  21.15 
 
 		 412 aa  47  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000126725  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0969  histidyl-tRNA synthetase  24.44 
 
 		 411 aa  47  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0491418  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3125  histidyl-tRNA synthetase  19.46 
 
 		 426 aa  47  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0624144  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>