More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1344 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008787  CJJ81176_1173  transcription termination factor Rho  84.81 
 
 		 432 aa  758    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.114801  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1292  transcription termination factor Rho  84.58 
 
 		 432 aa  756    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.345721  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1344  transcription termination factor Rho  100 
 
 		 431 aa  870    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.0000288127  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0274  transcription termination factor Rho  84.35 
 
 		 446 aa  752    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000543073  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0443  transcription termination factor Rho  78.79 
 
 		 447 aa  715    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0265285  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0572  transcription termination factor Rho  84.58 
 
 		 432 aa  756    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.124184  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0605  transcription termination factor Rho  83.88 
 
 		 447 aa  758    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000783157  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1421  transcription termination factor Rho  86.25 
 
 		 444 aa  771    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0471  transcription termination factor Rho  83.88 
 
 		 434 aa  745    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1553  transcription termination factor Rho  70.99 
 
 		 447 aa  634  1e-180  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000288549  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3229  transcription termination factor Rho  60.19 
 
 		 415 aa  515  1.0000000000000001e-145  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000000548676  normal  0.0477745 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2651  transcription termination factor Rho  60.29 
 
 		 415 aa  508  1e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000111099  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3808  transcription termination factor Rho  59.56 
 
 		 415 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3713  transcription termination factor Rho  59.56 
 
 		 415 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000184202  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3474  transcription termination factor Rho  59.38 
 
 		 429 aa  506  9.999999999999999e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1711  transcription termination factor Rho  59.27 
 
 		 437 aa  505  9.999999999999999e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000145962  normal  0.971448 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0137  transcription termination factor Rho  58.7 
 
 		 421 aa  507  9.999999999999999e-143  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000246562  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3108  transcription termination factor Rho  58.82 
 
 		 415 aa  501  1e-141  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2064  transcription termination factor Rho  58.65 
 
 		 421 aa  501  1e-141  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.244754  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0856  transcription termination factor Rho  58.65 
 
 		 421 aa  502  1e-141  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.447055  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3932  transcription termination factor Rho  58.65 
 
 		 421 aa  503  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.713144  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4391  transcription termination factor Rho  58.17 
 
 		 421 aa  501  1e-140  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0470  transcription termination factor Rho  58.5 
 
 		 414 aa  498  1e-140  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000467448  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4258  transcription termination factor Rho  58.65 
 
 		 421 aa  500  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.884099 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0100  transcription termination factor Rho  56.97 
 
 		 421 aa  501  1e-140  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.581004  normal  0.035165 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2695  transcription termination factor Rho  58.01 
 
 		 415 aa  500  1e-140  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000315458  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0376  transcription termination factor Rho  58.58 
 
 		 415 aa  498  1e-140  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000395561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4065  transcription termination factor Rho  59.07 
 
 		 415 aa  499  1e-140  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000187673  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0108  transcription termination factor Rho  57.21 
 
 		 421 aa  500  1e-140  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.411018  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3206  transcription termination factor Rho  58.41 
 
 		 421 aa  499  1e-140  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1025  transcription termination factor Rho  59.56 
 
 		 415 aa  498  1e-140  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0252595  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0056  transcription termination factor Rho  59.36 
 
 		 418 aa  495  1e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.624347  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0163  transcription termination factor Rho  56.73 
 
 		 421 aa  496  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.386148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2592  transcription termination factor Rho  58.39 
 
 		 418 aa  496  1e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00987626  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2341  transcription termination factor Rho  57.56 
 
 		 419 aa  497  1e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.735775  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3619  transcription termination factor Rho  58.55 
 
 		 418 aa  497  1e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1984  transcription termination factor Rho  58.41 
 
 		 418 aa  498  1e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0393  transcription termination factor Rho  56.25 
 
 		 421 aa  495  1e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1260  transcription termination factor Rho  57.45 
 
 		 422 aa  497  1e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0292  transcription termination factor Rho  56.73 
 
 		 421 aa  497  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0428  transcription termination factor Rho  56.25 
 
 		 421 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1308  transcription termination factor Rho  58.25 
 
 		 420 aa  496  1e-139  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0367  transcription termination factor Rho  57.42 
 
 		 418 aa  496  1e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151601 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1503  transcription termination factor Rho  56.97 
 
 		 548 aa  493  9.999999999999999e-139  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000037905  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2469  transcription termination factor Rho  56.45 
 
 		 419 aa  494  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0677  transcription termination factor Rho  56.55 
 
 		 415 aa  492  9.999999999999999e-139  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000284119  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2998  transcription termination factor Rho  58.74 
 
 		 419 aa  494  9.999999999999999e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0194587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0298  transcription termination factor Rho  55.77 
 
 		 421 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4288  transcription termination factor Rho  57.45 
 
 		 428 aa  488  1e-137  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0673197 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00570  transcription termination factor Rho  56.93 
 
 		 421 aa  488  1e-137  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.576624  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0807  transcription termination factor Rho  56.79 
 
 		 418 aa  490  1e-137  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1126  transcription termination factor Rho  56.52 
 
 		 420 aa  488  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.722702  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0391  transcription termination factor Rho  56.29 
 
 		 429 aa  489  1e-137  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000575661  normal  0.0124015 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1563  transcription termination factor Rho  57.21 
 
 		 506 aa  489  1e-137  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.657404 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2248  transcription termination factor Rho  56.52 
 
 		 420 aa  488  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.336797  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1365  transcription termination factor Rho  56.52 
 
 		 420 aa  488  1e-137  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0123945  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0638  transcription termination factor Rho  58.01 
 
 		 420 aa  489  1e-137  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2375  transcription termination factor Rho  56.52 
 
 		 420 aa  488  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1740  transcription termination factor Rho  56.52 
 
 		 420 aa  488  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.318458  normal  0.139414 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4906  transcription termination factor Rho  56.76 
 
 		 420 aa  488  1e-137  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.957069 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2210  transcription termination factor Rho  56.52 
 
 		 420 aa  488  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.171913  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0658  transcription termination factor Rho  56.79 
 
 		 418 aa  490  1e-137  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1855  transcription termination factor Rho  56.52 
 
 		 420 aa  488  1e-137  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.593752  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1824  transcription termination factor Rho  56.59 
 
 		 422 aa  488  1e-137  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0768704 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2290  transcription termination factor Rho  56.93 
 
 		 419 aa  489  1e-137  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000767102  normal  0.288713 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1377  transcription termination factor Rho  57.24 
 
 		 436 aa  490  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0362049  normal  0.0185592 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0009  transcription termination factor Rho  57.45 
 
 		 421 aa  490  1e-137  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.000000017892  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0042  transcription termination factor Rho  56.52 
 
 		 420 aa  488  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.133554  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2970  transcription termination factor Rho  57.53 
 
 		 436 aa  491  1e-137  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1767  transcription termination factor Rho  56.52 
 
 		 420 aa  488  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.548344  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1842  transcription termination factor Rho  57.21 
 
 		 447 aa  488  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.205012  normal  0.660399 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1001  transcription termination factor Rho  57.48 
 
 		 436 aa  489  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03661  transcription termination factor Rho  56.28 
 
 		 419 aa  486  1e-136  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000324277  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1824  transcription termination factor Rho  56.28 
 
 		 422 aa  486  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.025276  normal  0.0977479 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4034  transcription termination factor Rho  56.69 
 
 		 419 aa  484  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.462931  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4305  transcription termination factor Rho  56.52 
 
 		 419 aa  487  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0157  transcription termination factor Rho  56.28 
 
 		 419 aa  485  1e-136  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03610  hypothetical protein  56.28 
 
 		 419 aa  486  1e-136  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000108874  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5130  transcription termination factor Rho  56.52 
 
 		 420 aa  488  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0923516  normal  0.603331 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1756  transcription termination factor Rho  57.35 
 
 		 429 aa  487  1e-136  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.147978  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2085  transcription termination factor Rho  56.69 
 
 		 419 aa  487  1e-136  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2217  transcription termination factor Rho  56.52 
 
 		 420 aa  487  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0809447  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1853  transcription termination factor Rho  56.52 
 
 		 420 aa  488  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.110087 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2363  transcription termination factor Rho  56.28 
 
 		 422 aa  486  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016195  normal  0.176581 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4197  transcription termination factor Rho  56.52 
 
 		 419 aa  487  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0949  transcription termination factor Rho  56.52 
 
 		 420 aa  487  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.545356 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6250  transcription termination factor Rho  56.52 
 
 		 420 aa  488  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.156064  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0204  transcription termination factor Rho  56.52 
 
 		 419 aa  486  1e-136  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1282  transcription termination factor Rho  56.27 
 
 		 430 aa  485  1e-136  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0183251  normal  0.109355 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4223  transcription termination factor Rho  56.28 
 
 		 433 aa  486  1e-136  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0343455  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1678  transcription termination factor Rho  57.45 
 
 		 447 aa  487  1e-136  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0702428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0160  transcription termination factor Rho  56.52 
 
 		 419 aa  485  1e-136  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.227506 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4128  transcription termination factor Rho  56.52 
 
 		 419 aa  487  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4246  transcription termination factor Rho  56.52 
 
 		 419 aa  487  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1444  transcription termination factor Rho  56.52 
 
 		 420 aa  487  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.440911  normal  0.105069 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4143  transcription termination factor Rho  56.52 
 
 		 419 aa  487  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1829  transcription termination factor Rho  56.52 
 
 		 420 aa  488  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156095  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0393  transcription termination factor Rho  57.11 
 
 		 429 aa  486  1e-136  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.023811  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0002  transcription termination factor Rho  58.02 
 
 		 434 aa  486  1e-136  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00303251  normal  0.950818 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0180  transcription termination factor Rho  56.69 
 
 		 419 aa  484  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>