23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1235 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1235  cytochrome c553  100 
 
 
105 aa  208  2e-53  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1602  cytochrome c553  69.88 
 
 
155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.330816  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1416  cytochrome c553  58.1 
 
 
104 aa  121  3e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1418  cytochrome c553  62.75 
 
 
104 aa  121  3e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.785663  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0474  cytochrome c family protein  52.38 
 
 
101 aa  100  6e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1170  cytochrome c553  53.77 
 
 
100 aa  100  6e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1289  cytochrome c553  53.77 
 
 
100 aa  100  6e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0575  cytochrome c553  52.83 
 
 
100 aa  99.8  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.673779  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0241  cytochrome c-553 (cytochrome c553) (low-potential cytochromec)  46.67 
 
 
100 aa  94  7e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0084  glutamate racemase 2  48.57 
 
 
100 aa  91.7  3e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0000295238  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2134  cytochrome c family protein  31.48 
 
 
103 aa  56.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1817  cytochrome c class I  38.68 
 
 
98 aa  55.8  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2138  cytochrome c family protein  31.48 
 
 
104 aa  54.7  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.203882 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2244  cytochrome c class I  31.48 
 
 
104 aa  54.7  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2714  cytochrome c, class I  35.24 
 
 
101 aa  47.4  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.30061  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1343  cytochrome c, class I  32.95 
 
 
103 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.022471  normal  0.750332 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0751  cytochrome c, class I  32.74 
 
 
112 aa  44.7  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000617346  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1032  cytochrome c family protein  29.46 
 
 
105 aa  44.3  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3416  cytochrome c family protein  29.46 
 
 
105 aa  44.3  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1085  cytochrome c class I  29.46 
 
 
105 aa  44.3  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.032196  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1833  cytochrome c554  33.03 
 
 
107 aa  42  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3126  cytochrome c class I  33.03 
 
 
109 aa  42  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0549907 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1570  cytochrome c, class I  33.71 
 
 
102 aa  42  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0285899  normal  0.683196 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>