More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1172 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1172  queuine tRNA-ribosyltransferase  100 
 
 
372 aa  773    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0093  queuine tRNA-ribosyltransferase  79.3 
 
 
376 aa  636    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0899534  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0980  queuine tRNA-ribosyltransferase  78.44 
 
 
374 aa  629  1e-179  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1432  queuine tRNA-ribosyltransferase  76.56 
 
 
388 aa  624  1e-178  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0681966  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0584  queuine tRNA-ribosyltransferase  72.04 
 
 
373 aa  586  1e-166  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0414152  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1028  queuine tRNA-ribosyltransferase  72.51 
 
 
373 aa  571  1.0000000000000001e-162  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1090  queuine tRNA-ribosyltransferase  72.24 
 
 
373 aa  568  1e-161  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.50041  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1267  queuine tRNA-ribosyltransferase  71.16 
 
 
373 aa  569  1e-161  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0779  queuine tRNA-ribosyltransferase  72.51 
 
 
373 aa  570  1e-161  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.113002  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0907  queuine tRNA-ribosyltransferase  64.15 
 
 
372 aa  518  1e-146  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1259  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.51 
 
 
379 aa  412  1e-114  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1457  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.88 
 
 
375 aa  395  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000844701  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0521  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.46 
 
 
371 aa  391  1e-108  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2619  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.73 
 
 
373 aa  388  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0579  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.19 
 
 
370 aa  385  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.350695  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0852  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.92 
 
 
370 aa  380  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.93 
 
 
372 aa  381  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1782  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.13 
 
 
372 aa  378  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114635 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2757  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.59 
 
 
386 aa  371  1e-102  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.717518 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2026  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.66 
 
 
407 aa  373  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1716  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.25 
 
 
371 aa  370  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.2965  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1694  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.95 
 
 
373 aa  370  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0565  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.33 
 
 
373 aa  370  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.005662  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1894  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.44 
 
 
355 aa  367  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.3829100000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2844  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.73 
 
 
377 aa  367  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0907  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.92 
 
 
372 aa  362  4e-99  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0632  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.65 
 
 
392 aa  362  5.0000000000000005e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1194  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.18 
 
 
367 aa  362  7.0000000000000005e-99  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00354  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.58 
 
 
375 aa  361  9e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.520405  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3203  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.58 
 
 
375 aa  361  9e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.372376  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0486  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.58 
 
 
375 aa  361  9e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0476  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.58 
 
 
375 aa  361  9e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3227  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.58 
 
 
375 aa  361  9e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000187089 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00358  hypothetical protein  47.58 
 
 
375 aa  361  9e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.575633  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0438  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.58 
 
 
375 aa  361  9e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0436  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.58 
 
 
375 aa  361  9e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0325  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.58 
 
 
375 aa  361  9e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2011  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.44 
 
 
380 aa  360  2e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.638578  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0218  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.77 
 
 
376 aa  359  5e-98  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.989201  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0530  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.33 
 
 
373 aa  358  6e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00176978  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0444  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.31 
 
 
375 aa  357  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0451  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.31 
 
 
375 aa  357  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0945287  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0464  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.31 
 
 
375 aa  357  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.992026  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0505  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.31 
 
 
375 aa  357  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2243  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.59 
 
 
375 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.982522 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2109  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.19 
 
 
379 aa  357  1.9999999999999998e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0958  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.22 
 
 
374 aa  357  1.9999999999999998e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0452051  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0445  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.04 
 
 
375 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2059  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.43 
 
 
371 aa  356  2.9999999999999997e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1717  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.43 
 
 
371 aa  356  2.9999999999999997e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.647195 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3520  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.24 
 
 
377 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1241  normal  0.323798 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1696  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.03 
 
 
379 aa  355  7.999999999999999e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1729  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.03 
 
 
379 aa  355  7.999999999999999e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37523  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2906  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.76 
 
 
387 aa  354  1e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.905549  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1061  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.49 
 
 
374 aa  355  1e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00184616 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2647  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.17 
 
 
381 aa  355  1e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000956702  hitchhiker  0.00180241 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3264  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.76 
 
 
374 aa  354  1e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000400897  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3123  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.76 
 
 
374 aa  354  1e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00561158  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3384  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.76 
 
 
374 aa  354  1e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000344335  normal  0.488605 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2394  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.7 
 
 
367 aa  353  2e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.311868  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12290  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.63 
 
 
373 aa  354  2e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356741  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0159  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.62 
 
 
382 aa  353  2e-96  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.95405  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1800  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.65 
 
 
374 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1699  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.24 
 
 
382 aa  352  4e-96  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0931  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.32 
 
 
394 aa  353  4e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2429  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.36 
 
 
367 aa  352  5e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1666  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.78 
 
 
370 aa  352  8e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.098612  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3097  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.95 
 
 
387 aa  352  8.999999999999999e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141745  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1019  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.49 
 
 
381 aa  351  1e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1413  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.24 
 
 
371 aa  349  3e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.786795  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3622  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.95 
 
 
372 aa  350  3e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00110996  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1791  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.22 
 
 
370 aa  350  3e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000378979  hitchhiker  0.00274251 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004367  tRNA-guanine transglycosylase  45.7 
 
 
382 aa  348  6e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1315  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.72 
 
 
376 aa  348  6e-95  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0710  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.12 
 
 
376 aa  348  7e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1382  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.51 
 
 
374 aa  348  7e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000246245  hitchhiker  0.0000118913 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1447  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.51 
 
 
374 aa  348  7e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000328041  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1435  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.51 
 
 
374 aa  348  7e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000652098  hitchhiker  0.000858372 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1228  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.97 
 
 
377 aa  348  8e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.293358  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1305  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.04 
 
 
371 aa  348  8e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3291  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.49 
 
 
381 aa  348  9e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2398  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.53 
 
 
368 aa  348  1e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000165402  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0270  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.97 
 
 
379 aa  347  1e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.147453  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0049  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.49 
 
 
392 aa  347  1e-94  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0707792  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_52  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.68 
 
 
392 aa  347  2e-94  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000223938  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3113  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.51 
 
 
374 aa  347  2e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0875  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.24 
 
 
375 aa  347  2e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.68635  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.74 
 
 
375 aa  347  2e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0052  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.68 
 
 
392 aa  347  3e-94  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0045  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.14 
 
 
376 aa  346  3e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.642849  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4345  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.82 
 
 
377 aa  347  3e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000330572 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2068  Queuine tRNA-ribosyltransferase  45.97 
 
 
371 aa  346  3e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2518  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.09 
 
 
380 aa  346  4e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00624233  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1703  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.91 
 
 
383 aa  346  4e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108277  normal  0.62465 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01046  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.7 
 
 
378 aa  346  4e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1406  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.01 
 
 
374 aa  345  6e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.937214  normal  0.212389 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1175  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.07 
 
 
368 aa  344  1e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0539668  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1187  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.52 
 
 
384 aa  344  1e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00200873  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1524  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.79 
 
 
383 aa  344  1e-93  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000558338  normal  0.0203734 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3134  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.68 
 
 
379 aa  344  1e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.212476  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>