245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1122 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1122  sodium- and chloride-dependent transporter  100 
 
 
444 aa  866  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  9.4571e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1199  sodium- and chloride-dependent transporter, SNF family  60.63 
 
 
445 aa  536  1e-151  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.503617  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0958  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  60.72 
 
 
448 aa  518  1e-146  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1503  cell division membrane protein FtsW/MrdB/SpoVE  60.27 
 
 
448 aa  518  1e-146  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1013  sodium transporter, putative  59.73 
 
 
444 aa  504  1e-141  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0879  putative sodium transporter  59.28 
 
 
444 aa  501  1e-141  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0225063  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0942  sodium transporter, putative  59.95 
 
 
444 aa  504  1e-141  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1200  sodium- and chloride-dependent transporter, SNF family  60.63 
 
 
450 aa  493  1e-138  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.332542  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0960  sodium- and chloride-dependent transporter  54.52 
 
 
447 aa  483  1e-135  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.114639  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1292  sodium- and chloride-dependent transporter  56.19 
 
 
458 aa  476  1e-133  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.889918  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1505  sodium:neurotransmitter symporter family protein  55.2 
 
 
450 aa  467  1e-130  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1198  sodium- and chloride-dependent transporter, SNF family  55.76 
 
 
444 aa  457  1e-127  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.413199  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0530  sodium- and chloride-dependent transporter  55.79 
 
 
445 aa  445  1e-124  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0959  ModE family transcriptional regulator  50.45 
 
 
443 aa  434  1e-120  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.167837  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1504  sodium/neurotransmitter symporter family protein  51.13 
 
 
443 aa  427  1e-118  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0941  sodium transporter, putative  49.44 
 
 
446 aa  394  1e-108  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1012  sodium transporter, putative  49.66 
 
 
446 aa  394  1e-108  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0880  putative sodium transporter  48.76 
 
 
446 aa  390  1e-107  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0426981  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2054  sodium:neurotransmitter symporter  38.41 
 
 
452 aa  279  8e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1157  sodium:neurotransmitter symporter  40.69 
 
 
452 aa  278  2e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00156035  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1490  sodium:neurotransmitter symporter  37.13 
 
 
486 aa  275  2e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2879  sodium:neurotransmitter symporter  38.57 
 
 
470 aa  274  3e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0267989  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0402  SNF family Na(+)-dependent transporter  40.49 
 
 
468 aa  272  9e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2041  sodium:neurotransmitter symporter  36.69 
 
 
446 aa  268  1e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2216  sodium-dependent transporter  36.47 
 
 
446 aa  267  3e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.577413  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2060  sodium-dependent transporter  36.47 
 
 
446 aa  267  3e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130438  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1999  sodium-dependent transporter  36.47 
 
 
446 aa  266  4e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00179819  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2000  sodium-dependent transporter  36.24 
 
 
446 aa  266  5e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  5.56879e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2244  putative sodium-dependent transporter  36.47 
 
 
446 aa  266  5e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.78172e-27 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1622  sodium:neurotransmitter symporter  35.65 
 
 
446 aa  265  1e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.185224  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3127  putative sodium-dependent transporter  36.83 
 
 
446 aa  265  1e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0292515  normal  0.0156327 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2198  putative sodium-dependent transporter  37.05 
 
 
446 aa  265  1e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2328  putative sodium-dependent transporter  36.24 
 
 
446 aa  265  2e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  3.64471e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2246  sodium-dependent transporter, putative  36.81 
 
 
446 aa  264  2e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.010135  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2874  sodium:neurotransmitter symporter  36.7 
 
 
464 aa  262  9e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2297  Na+-dependent transporter of the SNF family protein  36.78 
 
 
461 aa  258  2e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0263  sodium:neurotransmitter symporter  37.67 
 
 
464 aa  258  2e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1682  SNF family sodium-dependent transporter  39.33 
 
 
445 aa  257  3e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1792  sodium:neurotransmitter symporter  33.26 
 
 
452 aa  257  3e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1704  sodium:neurotransmitter symporter  37.53 
 
 
450 aa  257  3e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0489471  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1525  sodium-dependent transporter  37.53 
 
 
450 aa  257  3e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  8.97057e-08  decreased coverage  0.00856693 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1035  sodium:neurotransmitter symporter  36.55 
 
 
446 aa  256  8e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1792  sodium:neurotransmitter symporter  38.7 
 
 
453 aa  256  8e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  1.97904e-08  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3502  sodium-dependent transporter  38.89 
 
 
445 aa  255  9e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1958  sodium-dependent transporter  38.89 
 
 
445 aa  255  1e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.331553  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1440  sodium:neurotransmitter symporter  38.55 
 
 
445 aa  255  1e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0226414  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1701  sodium-dependent transporter  39.11 
 
 
445 aa  254  2e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.296759  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1835  sodium-dependent transporter  39.11 
 
 
445 aa  254  2e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0963  sodium:neurotransmitter symporter  37.87 
 
 
452 aa  254  2e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1841  sodium-dependent transporter  38.44 
 
 
445 aa  254  2e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1657  SNF family sodium-dependent transporter  38.89 
 
 
445 aa  254  2e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0556  sodium:neurotransmitter symporter  35.56 
 
 
457 aa  254  3e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1923  sodium-dependent transporter  38.67 
 
 
445 aa  253  5e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2640  sodium:neurotransmitter symporter  35.52 
 
 
454 aa  253  6e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0280072  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2740  sodium-dependent transporter family protein  36.4 
 
 
457 aa  253  6e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00332714  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1105  sodium:neurotransmitter symporter  35.45 
 
 
453 aa  251  2e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.050173  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1879  sodium-dependent transporter  39.16 
 
 
447 aa  250  3e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.184026 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1700  sodium:neurotransmitter symporter  35.28 
 
 
486 aa  250  3e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0878592 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1695  sodium:neurotransmitter symporter  38.26 
 
 
447 aa  248  1e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.165275  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2621  sodium-dependent transporter family protein  35.37 
 
 
452 aa  248  2e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1293  Sodium:neurotransmitter symporter  37.53 
 
 
451 aa  243  4e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2848  sodium:neurotransmitter symporter  35.11 
 
 
461 aa  240  3e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1865  sodium-dependent transporter  36.73 
 
 
453 aa  239  5e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1949  sodium:neurotransmitter symporter  36.16 
 
 
455 aa  238  1e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.804307  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3274  sodium:neurotransmitter symporter  36.47 
 
 
455 aa  238  2e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0256364  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2266  sodium:neurotransmitter symporter  36.16 
 
 
455 aa  237  4e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2394  sodium:neurotransmitter symporter  37.3 
 
 
453 aa  236  7e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0493  sodium:neurotransmitter symporter  34.9 
 
 
446 aa  235  1e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  2.62524e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0480  sodium:neurotransmitter symporter  34.9 
 
 
446 aa  235  1e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  6.96171e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003803  putative sodium-dependent transporter  34.24 
 
 
476 aa  233  5e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1935  sodium-dependent transporter  33.41 
 
 
448 aa  232  1e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1256  sodium:neurotransmitter symporter  36.07 
 
 
443 aa  232  1e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00157351  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2101  sodium:neurotransmitter symporter  36.05 
 
 
466 aa  230  5e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0284864 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0030  sodium:neurotransmitter symporter  34.02 
 
 
449 aa  229  6e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1411  sodium:neurotransmitter symporter  37.03 
 
 
449 aa  229  7e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4148  sodium:neurotransmitter symporter  35.03 
 
 
459 aa  229  8e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500155  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1994  sodium:neurotransmitter symporter  34.29 
 
 
448 aa  224  3e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000364284  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02692  hypothetical protein  33.64 
 
 
456 aa  223  4e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2187  sodium-dependent transporter, SNF family  34.88 
 
 
450 aa  223  6e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0307557  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2371  sodium-dependent symporter family protein  33.71 
 
 
453 aa  223  7e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  1.33814e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0909  sodium-dependent transporter (SNF family)  32.88 
 
 
454 aa  220  4e-56  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.45649  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1260  sodium:neurotransmitter symporter  36.38 
 
 
475 aa  220  4e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  5.58037e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0698  sodium:neurotransmitter symporter  35.71 
 
 
448 aa  220  4e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1590  putative sodium-dependent transporter  37.95 
 
 
452 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  2.5951e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0756  Sodium:neurotransmitter symporter  34.58 
 
 
467 aa  218  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02003  sodium-dependent symporter family protein  34.61 
 
 
431 aa  218  2e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.130323  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2213  sodium:neurotransmitter symporter family protein  35.11 
 
 
449 aa  218  2e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  1.92398e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1448  sodium-dependent transporter  37.95 
 
 
451 aa  217  4e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0041724  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1311  sodium-dependent transporter  37.95 
 
 
452 aa  217  4e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00219151  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1520  putative sodium-dependent transporter  37.95 
 
 
452 aa  217  4e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.09664e-30 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2570  sodium:neurotransmitter symporter  34.3 
 
 
456 aa  217  4e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.818181  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1338  sodium-dependent transporter  37.95 
 
 
452 aa  217  4e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.328637  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3631  sodium:neurotransmitter symporter  36.7 
 
 
467 aa  216  5e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.693771 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1066  sodium-dependent transporter  33.48 
 
 
454 aa  216  5e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.094867  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1312  sodium-dependent transporter  37.95 
 
 
452 aa  216  9e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00101935  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1552  sodium-dependent transporter, putative  37.59 
 
 
451 aa  215  1e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.110657  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21340  SNF family Na+-dependent transporter  33.71 
 
 
461 aa  214  2e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00519934  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0381  sodium:neurotransmitter symporter  34.23 
 
 
465 aa  213  5e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  2.40956e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0541  sodium-dependent transporter  31.94 
 
 
458 aa  211  2e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3860  sodium-dependent tryptophan transporter  37.61 
 
 
452 aa  211  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0141824  hitchhiker  1.10845e-08 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>