More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1060 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1060  GTP-binding protein Era  100 
 
 		 289 aa  582  1.0000000000000001e-165  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00411947  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1972  GTP-binding protein Era  57.79 
 
 		 289 aa  356  1.9999999999999998e-97  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1003  GTP-binding protein Era  57.09 
 
 		 289 aa  346  2e-94  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1223  GTP-binding protein Era  56.06 
 
 		 289 aa  340  1e-92  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.225861  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0758  GTP-binding protein Era  54.51 
 
 		 290 aa  321  9.999999999999999e-87  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.334312  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0688  GTP-binding protein Era  54.36 
 
 		 291 aa  311  9e-84  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0763  GTP-binding protein Era  53.66 
 
 		 291 aa  308  5.9999999999999995e-83  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.213549  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1338  GTP-binding protein Era  52.26 
 
 		 291 aa  296  2e-79  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.548125  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1032  GTP-binding protein Era  49.3 
 
 		 296 aa  293  3e-78  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.238  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1378  GTP-binding protein Era  48.95 
 
 		 300 aa  267  1e-70  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000347783  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  34.95 
 
 		 324 aa  175  9e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2030  GTP-binding protein Era  33.68 
 
 		 294 aa  172  7.999999999999999e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0924182  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1062  GTP-binding protein Era  34.14 
 
 		 297 aa  169  5e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3553700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  33.79 
 
 		 298 aa  168  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0646  GTP-binding protein Era  33.91 
 
 		 305 aa  167  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.601606  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2272  GTP-binding protein Era  34.02 
 
 		 296 aa  167  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4275  GTP-binding protein Era  33.81 
 
 		 303 aa  167  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0138  GTP-binding protein Era  33.8 
 
 		 300 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2479  GTP-binding protein Era  33.92 
 
 		 302 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.080148  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1118  GTP-binding protein Era  33.91 
 
 		 303 aa  167  2.9999999999999998e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1987  GTP-binding protein Era  33.1 
 
 		 296 aa  166  4e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0579  GTP-binding protein Era  35.29 
 
 		 298 aa  165  6.9999999999999995e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  33.22 
 
 		 299 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1946  GTP-binding protein Era  30.87 
 
 		 303 aa  162  6e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2085  GTPase  31.36 
 
 		 297 aa  162  9e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.965881  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1462  GTP-binding protein Era  32.53 
 
 		 293 aa  161  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2045  GTP-binding protein Era  31.34 
 
 		 308 aa  160  2e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0296  GTP-binding protein Era  31.53 
 
 		 306 aa  161  2e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1632  GTP-binding protein Era  32.53 
 
 		 299 aa  160  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392106  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  32.64 
 
 		 297 aa  160  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1445  GTP-binding protein Era  33.56 
 
 		 298 aa  159  4e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2875  GTP-binding protein Era  33.1 
 
 		 318 aa  158  8e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158281 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0507  GTP-binding protein Era  35.96 
 
 		 301 aa  158  1e-37  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  decreased coverage  0.000333853  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3074  GTP-binding protein Era  32.75 
 
 		 298 aa  158  1e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3235  GTP-binding protein Era  32.98 
 
 		 489 aa  157  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00276402  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0683  GTP-binding protein Era  34.27 
 
 		 310 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0482  GTP-binding protein Era  30.88 
 
 		 295 aa  157  2e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1450  GTP-binding protein Era  34.51 
 
 		 327 aa  157  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.176106  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl266  GTP-binding protein Era  32.53 
 
 		 301 aa  156  4e-37  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  6.59888e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1376  GTP-binding protein Era  33.56 
 
 		 298 aa  156  4e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3856  GTP-binding protein Era  30.93 
 
 		 308 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00601446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1348  GTP-binding protein Era  31.16 
 
 		 315 aa  156  5.0000000000000005e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.136623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0134  GTP-binding protein Era  32.42 
 
 		 299 aa  155  5.0000000000000005e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2740  GTP-binding protein Era  31.13 
 
 		 305 aa  155  7e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1412  GTP-binding protein Era  33.56 
 
 		 300 aa  155  7e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000752923  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0999  GTP-binding protein Era  35.21 
 
 		 313 aa  155  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17106  normal  0.215056 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0597  GTP-binding protein Era  28.91 
 
 		 348 aa  155  9e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00117321 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2457  GTP-binding protein Era  32.29 
 
 		 306 aa  154  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1981  GTP-binding protein Era  33.22 
 
 		 298 aa  154  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0864  GTP-binding protein Era  31.71 
 
 		 296 aa  155  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0183856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1008  GTP-binding protein Era  31.71 
 
 		 296 aa  155  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.028746 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1141  GTP-binding protein Era  32.04 
 
 		 296 aa  154  1e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.891303 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3053  GTP-binding protein Era  33.45 
 
 		 301 aa  155  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.23462  normal  0.0104922 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1134  GTP-binding protein Era  31.14 
 
 		 299 aa  154  2e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.968945  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1152  GTP-binding protein Era  35.21 
 
 		 313 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3802  GTP-binding protein Era  33.1 
 
 		 301 aa  154  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1067  GTP-binding protein Era  35.37 
 
 		 297 aa  154  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2974  GTP-binding protein Era  32.76 
 
 		 298 aa  154  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0899132  hitchhiker  0.00507105 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3668  GTP-binding protein Era  33.1 
 
 		 302 aa  153  2.9999999999999998e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1405  GTP-binding protein Era  31.83 
 
 		 303 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00334874  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12970  GTP-binding protein Era  32.87 
 
 		 301 aa  153  4e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.327957  normal  0.141984 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2311  GTP-binding protein Era  30.56 
 
 		 309 aa  152  5e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.254696  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1403  GTP-binding protein Era  30.41 
 
 		 321 aa  152  5e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0033  GTP-binding protein Era  29.79 
 
 		 305 aa  152  5.9999999999999996e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3148  GTP-binding protein Era  33.33 
 
 		 300 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0159525  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2421  GTP-binding protein Era  33.22 
 
 		 302 aa  152  8e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1247  GTP-binding protein Era  31.6 
 
 		 300 aa  152  8e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.734456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0990  GTP-binding protein Era  33.33 
 
 		 310 aa  152  8e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0313697 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12510  GTP-binding protein Era  30.8 
 
 		 294 aa  152  8e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1116  GTP-binding protein Era  30.18 
 
 		 303 aa  152  8.999999999999999e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02460  GTP-binding protein Era  32.75 
 
 		 301 aa  151  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1102  GTP-binding protein Era  32.75 
 
 		 301 aa  151  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0130588  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1111  GTP-binding protein Era  32.75 
 
 		 301 aa  151  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1659  GTP-binding protein Era  30.8 
 
 		 299 aa  151  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02424  hypothetical protein  32.75 
 
 		 301 aa  151  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1625  GTP-binding protein Era  30.8 
 
 		 299 aa  151  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2852  GTP-binding protein Era  32.75 
 
 		 301 aa  151  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0251331  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1806  GTP-binding protein Era  31.97 
 
 		 297 aa  151  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0584484  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0951  GTP-binding protein Era  34.04 
 
 		 305 aa  151  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2931  GTP-binding protein Era  32.75 
 
 		 301 aa  151  1e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.163008  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2127  GTP-binding protein Era  33.33 
 
 		 296 aa  151  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148937  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2719  GTP-binding protein Era  32.75 
 
 		 301 aa  151  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0551516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02997  GTP-binding protein Era  32.54 
 
 		 314 aa  151  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.249422  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1685  GTP-binding protein Era  29.82 
 
 		 295 aa  151  1e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2721  GTP-binding protein Era  32.75 
 
 		 301 aa  151  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0735  GTP-binding protein Era  33.45 
 
 		 314 aa  150  2e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.222854  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1205  GTP-binding protein Era  33.1 
 
 		 301 aa  150  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.745594  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1653  small GTP-binding protein Era  29.1 
 
 		 310 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2909  GTP-binding protein Era  31.42 
 
 		 308 aa  150  2e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000618187  normal  0.386752 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3070  GTP-binding protein Era  32.76 
 
 		 301 aa  150  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.129104  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1190  GTP-binding protein Era  32.41 
 
 		 303 aa  150  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.442285  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1069  GTP-binding protein Era  32.76 
 
 		 301 aa  150  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1137  GTP-binding protein Era  32.41 
 
 		 303 aa  150  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0472293  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2742  GTP-binding protein Era  32.75 
 
 		 301 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0288239  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  31.67 
 
 		 301 aa  150  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2823  GTP-binding protein Era  32.75 
 
 		 301 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2958  GTP-binding protein Era  32.75 
 
 		 301 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.435183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3612  GTP-binding protein Era  32.41 
 
 		 303 aa  150  3e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.387158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3787  GTP-binding protein Era  30.63 
 
 		 468 aa  150  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.0434052 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0780  GTPase  31.38 
 
 		 303 aa  150  3e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00998411  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>