More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1056 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1056  type II and III secretion system protein  100 
 
 
541 aa  1090  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.0036675  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1968  type II and III secretion system protein  52.8 
 
 
506 aa  542  1e-153  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.150823  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1007  type II and III secretion system protein  51.54 
 
 
512 aa  544  1e-153  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1227  PP family ATPase  52.87 
 
 
508 aa  531  1e-149  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1036  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  47.36 
 
 
506 aa  439  1e-122  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1647  general secretory pathway protein D  43.34 
 
 
470 aa  411  1e-113  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.948115  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1821  general secretory pathway protein D  43.94 
 
 
470 aa  411  1e-113  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.533467  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1467  general secretory pathway protein D  43.74 
 
 
470 aa  410  1e-113  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0390  putative type II protein secretion system D protein CtsD  43.16 
 
 
463 aa  385  1e-105  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1384  type II and III secretion system protein  33.7 
 
 
563 aa  273  5e-72  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.157655  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0753  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  28.91 
 
 
572 aa  151  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.22971  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0484  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  30.71 
 
 
559 aa  148  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0505  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  30.71 
 
 
559 aa  148  3e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0466  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  30.46 
 
 
561 aa  147  5e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.142109  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3835  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  30.71 
 
 
559 aa  146  8e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.139484  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0508  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  30.71 
 
 
559 aa  146  8e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2820  MSHA biogenesis protein MshL  28.97 
 
 
559 aa  145  1e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3486  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  30.21 
 
 
561 aa  145  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.552648  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3663  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  30.21 
 
 
561 aa  145  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4112  MSHA biogenesis protein MshL  30.67 
 
 
560 aa  145  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3332  type II and III secretion system protein  27.1 
 
 
614 aa  144  4e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.449777  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0469  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin D (MSHD)  25.19 
 
 
546 aa  143  7e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00341212  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0560  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  30.27 
 
 
558 aa  143  1e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0389  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  28.88 
 
 
563 aa  139  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0544  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  30.26 
 
 
567 aa  138  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4417  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  29.16 
 
 
562 aa  138  3e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3768  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  26.85 
 
 
556 aa  135  1e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002368  MSHA biogenesis protein MshL  25.09 
 
 
530 aa  135  2e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0893  type II and III secretion system secretin  27.26 
 
 
585 aa  135  2e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0385  type II and III secretion system protein  24.9 
 
 
537 aa  135  2e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.16862  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03698  hypothetical protein  25.14 
 
 
544 aa  134  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3096  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  24.53 
 
 
577 aa  133  7e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0454  MSHA biogenesis protein MshL  28.89 
 
 
561 aa  132  2e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00251  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshL (pilus type IV)  26.84 
 
 
569 aa  132  2e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0764  general secretion pathway protein D  26.8 
 
 
554 aa  130  4e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  5.64128e-05  normal  0.152478 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0329  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  23.52 
 
 
538 aa  130  8e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.683129  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0639  type II and III secretion system protein  24.35 
 
 
569 aa  128  3e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3751  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  25.35 
 
 
556 aa  125  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0170  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  23.14 
 
 
550 aa  124  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0887  type II and III secretion system protein  22.1 
 
 
625 aa  124  4e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0606978  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3347  type II and III secretion system protein  25.6 
 
 
549 aa  124  5e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.292077  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1135  MSHA biogenesis protein MshL  23.87 
 
 
543 aa  120  7e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00664047  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0076  type II and III secretion system protein  24.39 
 
 
539 aa  119  2e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4576  MSHA biogenesis protein MshL  26.9 
 
 
609 aa  114  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3259  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  21.76 
 
 
830 aa  113  1e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0701174 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0109  type II and III secretion system protein  27.03 
 
 
547 aa  112  2e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.379094  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2173  general secretion pathway protein D  34.72 
 
 
745 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1343  Type II secretory pathway component PulD-like  24.55 
 
 
546 aa  103  9e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.255385  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1309  general secretion pathway protein D  32.87 
 
 
819 aa  101  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0418049  normal  0.0430257 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18620  type II and III secretion system protein  31.96 
 
 
602 aa  97.8  5e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0928  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  22.85 
 
 
574 aa  97.4  5e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0351042  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0993  type IV pilus (Tfp) assembly protein PilQ  31.66 
 
 
698 aa  95.5  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0962  type IV pilus (Tfp) assembly protein PilQ  31.66 
 
 
698 aa  95.9  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0549  putative Type II secretory pathway component PulD  28.1 
 
 
581 aa  94.7  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0542  type II and III secretion system protein  29.72 
 
 
702 aa  95.1  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2457  type II and III secretion system protein  34.08 
 
 
723 aa  94.7  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.345302  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4150  general secretion pathway protein D  29.41 
 
 
829 aa  94.4  5e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0456168  hitchhiker  1.62446e-05 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2971  fimbrial type-4 assembly signal peptide protein  30.79 
 
 
714 aa  94  6e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0761  general secretion pathway protein D  30.73 
 
 
833 aa  92.8  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  3.06489e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1814  type IV pilus secretin PilQ  26.15 
 
 
944 aa  93.2  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0329  type IV pilus secretin PilQ  31.35 
 
 
987 aa  92  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00519282  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2902  type IV pilus secretin PilQ  33.63 
 
 
721 aa  91.7  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.123013 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0339  type IV pilus secretin PilQ  33.87 
 
 
682 aa  92  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.201727  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3249  type IV pilus secretin PilQ  33.63 
 
 
721 aa  91.7  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0578  type II and III secretion system protein  34.07 
 
 
527 aa  91.7  3e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000285943 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3707  type IV pilus secretin PilQ  34.22 
 
 
683 aa  90.5  6e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  2.59618e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3369  type IV pilus biogenesis protein PilQ  33.33 
 
 
685 aa  90.5  7e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000110691  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3895  type IV pilus secretin PilQ  34.04 
 
 
684 aa  90.5  7e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  3.7843e-06  normal  0.221034 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3699  type IV pilus secretin PilQ  34.04 
 
 
684 aa  90.1  8e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0929214  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0246  type IV pilus secretin PilQ  34.04 
 
 
684 aa  90.5  8e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0240868  normal  0.818233 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1791  general secretion pathway protein D  27.06 
 
 
784 aa  90.1  9e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2665  type IV pilus secretin PilQ  34.22 
 
 
926 aa  90.1  9e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000377004 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0285  type IV pilus biogenesis protein PilQ  34.04 
 
 
684 aa  90.1  9e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3131  type II and III secretion system secretin  34.25 
 
 
706 aa  90.1  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1041  general secretion pathway protein D  30.59 
 
 
799 aa  90.1  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0180927  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0678  general secretion pathway protein D  30.81 
 
 
720 aa  89.7  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00783707  decreased coverage  0.00018208 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0162  type IV pilus secretin PilQ  33.33 
 
 
689 aa  89  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0409  type II and III secretion system protein  30.37 
 
 
692 aa  89  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714943  normal  0.127719 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0078  general secretion pathway protein D  30.09 
 
 
660 aa  89.4  2e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0785  type II and III secretion system protein  25.25 
 
 
717 aa  89.4  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.113168  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4085  type IV pilus secretin PilQ  33.69 
 
 
683 aa  88.2  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  3.49051e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4004  type IV pilus secretin PilQ  33.69 
 
 
683 aa  88.2  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0761872  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0830  type IV pilus secretin PilQ  26.55 
 
 
704 aa  88.6  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.629158  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4445  type II and III secretion system protein  26.58 
 
 
457 aa  88.6  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4114  type IV pilus secretin PilQ  33.69 
 
 
683 aa  88.6  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  5.74817e-05  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02838  GspD, hypothetical type II secretion protein  24.56 
 
 
686 aa  88.6  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  6.64316e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4203  type IV pilus secretin PilQ  33.69 
 
 
683 aa  88.2  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0392005  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02788  hypothetical protein  24.56 
 
 
686 aa  88.6  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  6.55056e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3138  general secretion pathway protein D  24.56 
 
 
686 aa  88.6  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3427  general secretion pathway protein D  24.56 
 
 
686 aa  88.6  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0612  type II and III secretion system protein  32.86 
 
 
668 aa  87.8  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0385351  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3247  general secretion pathway protein GspD  24.81 
 
 
686 aa  88.2  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0260  type II and III secretion system protein  33.69 
 
 
683 aa  88.2  4e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0149994  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3307  general secretion pathway protein D  27.53 
 
 
763 aa  87.8  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.335208  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4591  general secretion pathway protein D  23.44 
 
 
697 aa  87.8  5e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0407  type II and III secretion system protein:NolW-like:NolW-like  28.97 
 
 
718 aa  87  7e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5128  type IV pilus biogenesis protein PilQ  28.97 
 
 
718 aa  87  8e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.981082  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1550  type IV pilus secretin PilQ  33.16 
 
 
946 aa  87  8e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0646  general secretion pathway protein D  27.4 
 
 
781 aa  86.7  9e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0255398  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0386  type IV pilus secretin PilQ  30.21 
 
 
422 aa  86.3  1e-15  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.591623  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>