More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1052 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1010  type II secretion system protein E  62.35 
 
 
598 aa  759  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1964  general secretion pathway protein E  64.95 
 
 
583 aa  793  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1039  type II secretion system protein E  62.48 
 
 
583 aa  764  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1052  general secretion pathway protein E (Type II traffic warden ATPase)(cholera toxin secretion protein EpsE)  100 
 
 
585 aa  1192  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1231  L(+)-tartrate dehydratase subunit beta (L-TTD beta)  65.23 
 
 
583 aa  805  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1387  type II secretion system protein E  57.36 
 
 
577 aa  608  1e-173  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00517077  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  42.27 
 
 
553 aa  437  1e-121  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  42.83 
 
 
871 aa  431  1e-119  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  41.73 
 
 
557 aa  416  1e-115  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1464  general secretory pathway protein E  41.89 
 
 
519 aa  412  1e-114  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  40.76 
 
 
556 aa  414  1e-114  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  41.67 
 
 
553 aa  414  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1818  general secretory pathway protein E  41.7 
 
 
519 aa  410  1e-113  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1644  general secretory pathway protein E  41.89 
 
 
519 aa  412  1e-113  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.161212  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  40.87 
 
 
557 aa  410  1e-113  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  41.97 
 
 
787 aa  410  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  41.51 
 
 
563 aa  403  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  39.9 
 
 
573 aa  399  1e-110  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  43.84 
 
 
558 aa  401  1e-110  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  43.64 
 
 
553 aa  400  1e-110  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  41.7 
 
 
559 aa  397  1e-109  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1166  type II secretion system protein E  37.84 
 
 
572 aa  397  1e-109  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4189  type II secretion system protein E  38.85 
 
 
557 aa  393  1e-108  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0426  type II secretion system protein E  39.22 
 
 
577 aa  395  1e-108  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0285266  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1042  general secretory pathway protein E  43.57 
 
 
570 aa  393  1e-108  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.90473  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  38.46 
 
 
561 aa  392  1e-108  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  43.33 
 
 
570 aa  394  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  6.26903e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  41.75 
 
 
558 aa  390  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00254  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshE (pilus type IV)  38.06 
 
 
570 aa  392  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  38.92 
 
 
558 aa  389  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2648  type II secretion system protein E  46.49 
 
 
579 aa  389  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0969268  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  36.87 
 
 
564 aa  389  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1792  type II secretion system protein E  37.43 
 
 
573 aa  386  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.608065 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0138  type II secretion system protein E  38.29 
 
 
569 aa  388  1e-106  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1585  type II secretion system protein E  36.81 
 
 
552 aa  388  1e-106  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.834386 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0408  type II secretion system protein E  38.61 
 
 
570 aa  388  1e-106  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  37.74 
 
 
553 aa  389  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  40.71 
 
 
561 aa  384  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1299  general secretory pathway protein E  48.69 
 
 
575 aa  385  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0445374 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.97 
 
 
568 aa  380  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  41.04 
 
 
520 aa  380  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29490  putative type II secretion protein  48.59 
 
 
575 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0183  type IV pilus assembly protein  39.22 
 
 
569 aa  380  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0362  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.22 
 
 
569 aa  380  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.388372 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1684  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  41.57 
 
 
577 aa  381  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0417932  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  40.86 
 
 
566 aa  379  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1783  type IV pilus biogenesis protein PilB, putative  38.68 
 
 
574 aa  376  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.989309  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1527  type II secretion system protein E  43.52 
 
 
482 aa  376  1e-103  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.155656  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0008  general secretory pathway protein E  47.56 
 
 
497 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3517  general secretion pathway protein E  47.56 
 
 
497 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.385541  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0051  general secretory pathway protein E  47.27 
 
 
499 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.582006  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  38.73 
 
 
564 aa  376  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2663  general secretion pathway protein E  47.56 
 
 
497 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0062  general secretory pathway protein E  47.01 
 
 
498 aa  375  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0008  general secretory pathway protein E  47.56 
 
 
497 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0246  type II secretion system protein E  41.3 
 
 
560 aa  376  1e-103  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00126346  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16170  type II secretion system protein E, GspE  41.58 
 
 
569 aa  375  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2785  general secretion pathway protein E  47.56 
 
 
497 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254947  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0080  general secretory pathway protein E  47.53 
 
 
499 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0221  general secretory pathway protein E  47.56 
 
 
497 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  38.46 
 
 
568 aa  376  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0008  general secretion pathway protein E  47.79 
 
 
497 aa  377  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0860  general secretion pathway protein E  42.02 
 
 
500 aa  377  1e-103  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1028  type II secretion system protein E  37.63 
 
 
568 aa  377  1e-103  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328232 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1889  general secretion pathway protein E  47.56 
 
 
497 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.902732  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3243  type II secretion system protein E  47.79 
 
 
499 aa  379  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3937  general secretory pathway protein E  47.53 
 
 
495 aa  375  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3071  general secretory pathway protein E  47.53 
 
 
515 aa  375  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  7.85682e-05 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0410  type II secretion system protein E  38.77 
 
 
565 aa  375  1e-102  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.430305  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0061  general secretory pathway protein E  47.53 
 
 
499 aa  375  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212522  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0608  general secretory pathway protein E  41.24 
 
 
520 aa  372  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.11826e-14 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  40.55 
 
 
520 aa  374  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  40.43 
 
 
561 aa  375  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0061  general secretory pathway protein E  47.01 
 
 
499 aa  373  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2118  type II secretion system protein E  38.5 
 
 
594 aa  374  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3232  type II secretion system protein E  47.14 
 
 
545 aa  373  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.17007  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4500  putative general secretion pathway protein E  47.27 
 
 
522 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.155561 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0009  Type II secretion system gspE  47.53 
 
 
499 aa  375  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2744  type II secretion system protein E  40.55 
 
 
527 aa  375  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.804654  normal  0.322952 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1451  type II secretion system protein E  40.11 
 
 
574 aa  374  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1743  type II secretion system protein E  37.91 
 
 
577 aa  374  1e-102  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1996  type II secretion system protein E  37.12 
 
 
567 aa  371  1e-101  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0756  type II secretion system protein E  35.43 
 
 
589 aa  371  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0487  type II secretion system protein E  40.5 
 
 
586 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  38.03 
 
 
555 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.59 
 
 
568 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0594  general secretory pathway protein E  41.24 
 
 
520 aa  372  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  38.1 
 
 
568 aa  372  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  39.14 
 
 
568 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2895  type II secretion system protein E  39.11 
 
 
580 aa  370  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.847539  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0326  type II secretion system protein E  38.68 
 
 
612 aa  372  1e-101  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.038954  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3528  type II secretion system protein E  42.77 
 
 
586 aa  372  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.305202  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3230  type II secretion system protein E (GspE)  47.3 
 
 
491 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0114833  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1864  type II secretion system protein E  37.8 
 
 
573 aa  371  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.468476 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  37.61 
 
 
885 aa  372  1e-101  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3393  type II secretion system protein E  46.7 
 
 
513 aa  372  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.118784  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1924  type II secretion system protein E  38.8 
 
 
576 aa  370  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3832  type II secretion system protein E  40.29 
 
 
586 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0461846  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4824  putative type II secretion system protein  46.11 
 
 
469 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0112939  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4109  MSHA biogenesis protein MshE  40.5 
 
 
586 aa  366  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>