More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0949 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE1263  general glycosylation pathway protein  58.7 
 
 		 590 aa  681    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1138  general glycosylation pathway protein  59.03 
 
 		 590 aa  682    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.550891  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0447  FO synthase subunit 2 (7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase subunit 2)  61.59 
 
 		 593 aa  744    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1202  putative epimerase/dehydratase WbiI  60.74 
 
 		 593 aa  747    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1258  UDP-GlcNAc C4,6 dehydratase  58.78 
 
 		 587 aa  676    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.62797  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0949  general glycosylation pathway protein  100 
 
 		 597 aa  1217    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.266256  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1354  putative epimerase/dehydratase WbiI  62.56 
 
 		 595 aa  768    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0760  general glycosylation pathway protein  67.36 
 
 		 341 aa  465  1e-129  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.574123  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1769  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.34 
 
 		 577 aa  433  1e-120  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2334  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.76 
 
 		 614 aa  373  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000027  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1633  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.45 
 
 		 647 aa  367  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2582  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.18 
 
 		 647 aa  367  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1702  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.53 
 
 		 680 aa  367  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4411  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.65 
 
 		 644 aa  363  3e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4432  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.91 
 
 		 626 aa  363  4e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.908556  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3268  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.51 
 
 		 629 aa  362  1e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.5 
 
 		 617 aa  360  4e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1871  putative epimerase/dehydratase polysaccharide-related biosynthesis protein  35.84 
 
 		 614 aa  360  4e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3994  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.71 
 
 		 612 aa  354  2.9999999999999997e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.460388 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0902  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.49 
 
 		 625 aa  353  5.9999999999999994e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3984  polysaccharide biosynthesis protein CapD  34.84 
 
 		 627 aa  353  7e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.430813 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4081  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.26 
 
 		 612 aa  350  3e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0857  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.05 
 
 		 627 aa  349  6e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0408  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.05 
 
 		 627 aa  349  7e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0887  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.05 
 
 		 627 aa  349  7e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2504  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.04 
 
 		 628 aa  349  8e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.288119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3780  putative epimerase/dehydratase polysaccharide- related biosynthesis protein  34.99 
 
 		 625 aa  349  8e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00473075  normal  0.357479 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0776  polysaccharide biosynthesis protein CapD  34.52 
 
 		 627 aa  347  4e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.905737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5070  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.61 
 
 		 612 aa  345  1e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1976  polysaccharide synthase family protein  35.78 
 
 		 637 aa  345  1e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113139  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3150  polysaccharide biosynthesis protein  35.78 
 
 		 637 aa  345  1e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0937  polysaccharide synthase family protein  35.78 
 
 		 637 aa  345  1e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.217913  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2767  polysaccharide synthase family protein  35.78 
 
 		 637 aa  345  1e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.149651  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3090  capsular polysaccharide biosynthesis protein  35.78 
 
 		 637 aa  345  1e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1838  polysaccharide synthase family protein  35.78 
 
 		 637 aa  345  1e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3360  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.07 
 
 		 642 aa  345  1e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3127  capsular polysaccharide biosynthesis protein  35.78 
 
 		 637 aa  345  1e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1009  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.6 
 
 		 635 aa  345  2e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000685319  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2289  polysaccharide biosynthesis protein CapD  34.94 
 
 		 629 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.195008  normal  0.481233 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0128  hypothetical protein  35.54 
 
 		 635 aa  343  2.9999999999999997e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4505  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.44 
 
 		 610 aa  343  5e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000203589  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1483  capsular polysaccharide biosynthesis  34.62 
 
 		 656 aa  342  1e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5395  caspsular polysaccharide biosynthesis protein  35.94 
 
 		 603 aa  341  2e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.638255  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2611  polysaccharide biosynthesis protein CapD  34.77 
 
 		 653 aa  342  2e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.116735  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1536  polysaccharide biosynthesis protein  34.75 
 
 		 647 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2645  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.57 
 
 		 649 aa  339  7e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2650  polysaccharide biosynthesis protein CapD  34.44 
 
 		 607 aa  339  7e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2497  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.67 
 
 		 613 aa  339  8e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.495773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0765  polysaccharide biosynthesis protein CapD  34.75 
 
 		 630 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.932307  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5448  caspsular polysaccharide biosynthesis protein  36.13 
 
 		 604 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3090  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.55 
 
 		 652 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3033  polysaccharide biosynthesis protein, putative epimerase/dehydratase  35.71 
 
 		 644 aa  337  3.9999999999999995e-91  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1338  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.86 
 
 		 646 aa  337  3.9999999999999995e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0399433 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0903  polysaccharide biosynthesis protein  33.99 
 
 		 615 aa  334  2e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.999651  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2876  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.92 
 
 		 646 aa  333  4e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1680  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.52 
 
 		 642 aa  333  4e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.981888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0301  polysaccharide biosynthesis protein CapD  33.82 
 
 		 623 aa  333  6e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3456  nucleotide sugar epimerase/dehydratase  37.97 
 
 		 635 aa  330  3e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.360155  normal  0.018 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1486  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.16 
 
 		 646 aa  330  5.0000000000000004e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0306155  normal  0.36533 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0371  polysaccharide biosynthesis protein CapD  33.71 
 
 		 604 aa  330  5.0000000000000004e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0360  lipopolysaccharide biosynthesis protein (WbpM)-like  37.15 
 
 		 649 aa  329  1.0000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0813  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.54 
 
 		 659 aa  328  2.0000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.32823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4002  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.09 
 
 		 615 aa  327  5e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2635  polysaccharide biosynthesis protein CapD  32.92 
 
 		 682 aa  326  7e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0594  polysaccharide biosynthesis protein  36.62 
 
 		 646 aa  325  1e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1997  polysaccharide biosynthesis protein CapD  34.14 
 
 		 650 aa  325  2e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.521686 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2527  polysaccharide biosynthesis protein CapD  33.17 
 
 		 646 aa  325  2e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0910  capsular polysaccharide biosynthesis protein  37.01 
 
 		 614 aa  323  4e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.143929  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0802  polysaccharide biosynthesis protein CapD  32.64 
 
 		 676 aa  323  4e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1513  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.1 
 
 		 638 aa  323  5e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0299792  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1805  polysaccharide biosynthesis protein CapD  34.48 
 
 		 688 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.287116  normal  0.196663 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1278  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.31 
 
 		 637 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000704719 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0328  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.86 
 
 		 613 aa  321  1.9999999999999998e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0440695  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2679  polysaccharide biosynthesis protein CapD  32.91 
 
 		 647 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.999244  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10733  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapD  34.77 
 
 		 653 aa  320  3.9999999999999996e-86  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1360  polysaccharide biosynthesis protein CapD  34.8 
 
 		 643 aa  320  3.9999999999999996e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3385  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.64 
 
 		 651 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3171  polysaccharide biosynthesis protein  37.43 
 
 		 646 aa  320  5e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4167  polysaccharide biosynthesis protein CapD  34.36 
 
 		 648 aa  320  5e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2244  polysaccharide biosynthesis protein  36.68 
 
 		 644 aa  319  7e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.36548  normal  0.0653141 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4862  polysaccharide biosynthesis protein CapD  32.47 
 
 		 600 aa  319  9e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.428479  normal  0.102171 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0609  polysaccharide biosynthesis protein  33.61 
 
 		 642 aa  318  2e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3656  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.73 
 
 		 652 aa  318  2e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.219229  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3403  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.96 
 
 		 609 aa  318  2e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.397319  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4766  polysaccharide biosynthesis protein CapD  34.62 
 
 		 643 aa  318  2e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0559289  normal  0.121979 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3936  polysaccharide biosynthesis protein CapD  32.97 
 
 		 670 aa  317  4e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.218283 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0573  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.69 
 
 		 633 aa  316  9.999999999999999e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1986  nucleotide sugar epimerase/dehydratase WbpM  32.69 
 
 		 670 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0612  polysaccharide biosynthesis protein CapD  34.84 
 
 		 650 aa  315  1.9999999999999998e-84  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.301721 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1842  polysaccharide biosynthesis protein CapD type  32.33 
 
 		 684 aa  314  2.9999999999999996e-84  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1379  polysaccharide biosynthesis protein CapD  32.28 
 
 		 675 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.136886  hitchhiker  0.000537083 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0995  hypothetical protein  34.54 
 
 		 621 aa  313  4.999999999999999e-84  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1272  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.79 
 
 		 656 aa  313  6.999999999999999e-84  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3273  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.01 
 
 		 628 aa  313  7.999999999999999e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3389  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.32 
 
 		 630 aa  312  1e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3494  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.06 
 
 		 627 aa  312  1e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000299529  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001764  nucleoside-diphosphate sugar epimerase/dehydratase  37.69 
 
 		 662 aa  311  2e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000353165  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1414  polysaccharide biosynthesis protein CapD  32.52 
 
 		 669 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.987327  normal  0.0491926 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2638  mannosyl-transferase  35.43 
 
 		 621 aa  310  2.9999999999999997e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30080  Polysaccharide biosynthesis protein  35.58 
 
 		 765 aa  311  2.9999999999999997e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.819591  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>