160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0842 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0842  peptidyl-arginine deiminase family protein  100 
 
 
322 aa  660  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00603168  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1172  peptidyl-arginine deiminase family protein  64.09 
 
 
325 aa  424  1e-118  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0973  peptidyl-arginine deiminase family protein  63.16 
 
 
325 aa  410  1e-113  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1027  peptidyl-arginine deiminase family protein  62.54 
 
 
325 aa  405  1e-112  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0897  peptidyl-arginine deiminase family protein  61.3 
 
 
325 aa  404  1e-111  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.138379  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0531  peptidyl-arginine deiminase  58.07 
 
 
323 aa  388  1e-107  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.709217  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0085  peptidyl-arginine deiminase family protein  55.62 
 
 
348 aa  382  1e-105  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.360574  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0659  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  52.65 
 
 
322 aa  372  1e-102  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1581  Agmatine deiminase  46.52 
 
 
330 aa  301  1e-80  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.715324  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0378  peptidyl-arginine deiminase  43.03 
 
 
331 aa  290  3e-77  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.521894  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1746  Agmatine deiminase  44.58 
 
 
342 aa  283  3e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2471  peptidyl-arginine deiminase  44.14 
 
 
343 aa  276  3e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1018  hypothetical protein  40.55 
 
 
341 aa  275  9e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1581  peptidyl-arginine deiminase  38.74 
 
 
355 aa  273  2e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1197  Agmatine deiminase  40.67 
 
 
356 aa  273  3e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.614919  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0711  peptidyl-arginine deiminase  41.98 
 
 
351 aa  272  5e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0737  peptidyl-arginine deiminase  39.81 
 
 
341 aa  271  1e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00770089  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1447  agmatine deiminase  42.28 
 
 
342 aa  268  9e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.994739  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1028  peptidylarginine deiminase-related protein  38.18 
 
 
344 aa  266  2e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.442505  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2597  Agmatine deiminase  41.34 
 
 
340 aa  267  2e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0204527  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1362  Agmatine deiminase  38.41 
 
 
344 aa  257  2e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1254  peptidyl-arginine deiminase  40.24 
 
 
386 aa  255  6e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.145775  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2402  hypothetical protein  36.11 
 
 
376 aa  247  2e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00162245  decreased coverage  0.000927611 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1601  hypothetical protein  38.72 
 
 
363 aa  245  9e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1861  hypothetical protein  37.76 
 
 
367 aa  243  4e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.114437  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1544  agmatine deiminase  38.11 
 
 
363 aa  239  4e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0144  hypothetical protein  36.22 
 
 
341 aa  237  2e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1750  peptidyl-arginine deiminase  37.65 
 
 
350 aa  237  2e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.355031  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0984  Agmatine deiminase  39.33 
 
 
345 aa  229  6e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1013  Agmatine deiminase  39.33 
 
 
345 aa  229  6e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2447  peptidyl-arginine deiminase  36.7 
 
 
357 aa  228  2e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1604  Agmatine deiminase  35.65 
 
 
348 aa  219  5e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2176  peptidyl-arginine deiminase  34.45 
 
 
343 aa  219  6e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1834  Agmatine deiminase  34.45 
 
 
343 aa  219  6e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.519602  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1596  Agmatine deiminase  36.89 
 
 
339 aa  217  2e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  2.39655e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0071  Agmatine deiminase  34.57 
 
 
348 aa  216  4e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.73105  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1642  Agmatine deiminase  35.24 
 
 
345 aa  213  2e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.638362 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0706  Agmatine deiminase  34.04 
 
 
347 aa  212  8e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00887  peptidyl-arginine deiminase  34.59 
 
 
328 aa  210  3e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0609278  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0694  Agmatine deiminase  34.34 
 
 
349 aa  209  4e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2742  agmatine deiminase  34.83 
 
 
348 aa  209  5e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.337578  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1823  agmatine deiminase  33.63 
 
 
348 aa  207  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0612  peptidyl-arginine deiminase  34.94 
 
 
640 aa  206  3e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.778419 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0117  Agmatine deiminase  33.14 
 
 
351 aa  206  3e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2455  Agmatine deiminase  32.82 
 
 
334 aa  206  5e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.164164 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3413  agmatine deiminase  35.19 
 
 
346 aa  205  6e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.866063  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0827  peptidyl-arginyl deiminase  33.64 
 
 
347 aa  204  1e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2858  agmatine deiminase  33.23 
 
 
334 aa  204  2e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.420489  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1511  Agmatine deiminase  33.13 
 
 
342 aa  202  4e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.940428  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0810  Agmatine deiminase  32.93 
 
 
353 aa  201  1e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.360404 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00673  peptidyl-arginine deiminase  33.33 
 
 
354 aa  201  2e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.027225  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2630  Agmatine deiminase  33.94 
 
 
352 aa  200  4e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1901  peptidyl-arginine deiminase  33.64 
 
 
352 aa  198  9e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.459054  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1727  Agmatine deiminase  34.14 
 
 
347 aa  197  3e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1028  Agmatine deiminase  31.82 
 
 
349 aa  196  6e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.262442  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1443  peptidyl-arginine deiminase  34.35 
 
 
365 aa  195  8e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0971798 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1512  hypothetical protein  32.63 
 
 
350 aa  194  1e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.26981  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1030  peptidyl-arginine deiminase  33.13 
 
 
327 aa  191  1e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.497197  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1715  Agmatine deiminase  32.13 
 
 
349 aa  189  4e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.712045  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0034  peptidyl-arginine deiminase  33.13 
 
 
343 aa  189  7e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.714281  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0034  peptidyl-arginine deiminase  33.13 
 
 
631 aa  189  7e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137362  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0940  hypothetical protein  33.03 
 
 
346 aa  187  1e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1939  peptidyl-arginine deiminase  31.01 
 
 
365 aa  185  1e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.860811  normal  0.826102 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0078  peptidyl-arginine deiminase  33.33 
 
 
624 aa  181  1e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3937  Agmatine deiminase  31.72 
 
 
349 aa  181  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0591935  normal  0.116304 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3964  peptidyl-arginine deiminase  29.23 
 
 
350 aa  180  3e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.582867  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1873  GGDEF  31.63 
 
 
339 aa  177  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0147389  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3153  peptidyl-arginine deiminase  31.35 
 
 
330 aa  177  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2038  peptidyl-arginine deiminase  30 
 
 
639 aa  175  7e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1203  agmatine deiminase  29.28 
 
 
332 aa  175  9e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111825  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0652  agmatine deiminase  30.35 
 
 
364 aa  175  9e-43  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2586  Agmatine deiminase  29.85 
 
 
358 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.729677  normal  0.275773 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0005  hypothetical protein  30.67 
 
 
346 aa  168  1e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0005  hypothetical protein  30.06 
 
 
347 aa  167  2e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2804  agmatine deiminase  29.63 
 
 
346 aa  167  3e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.341254 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1489  agmatine deiminase  29.48 
 
 
369 aa  167  3e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.138528  hitchhiker  0.00047454 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4932  agmatine deiminase  28.29 
 
 
368 aa  164  2e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.803102  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4942  agmatine deiminase  28.45 
 
 
368 aa  164  2e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.470202  hitchhiker  6.8337e-07 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4697  agmatine deiminase  30.09 
 
 
336 aa  163  4e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.399563  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2760  agmatine deiminase  29.65 
 
 
370 aa  162  8e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.679274  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3465  agmatine deiminase  29.74 
 
 
370 aa  161  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0369  peptidyl-arginine deiminase  25.6 
 
 
339 aa  161  1e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5393  hypothetical protein  27.71 
 
 
368 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1234  agmatine deiminase  29.36 
 
 
370 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.792008  hitchhiker  1.82454e-09 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0659  agmatine deiminase  29.74 
 
 
370 aa  160  4e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.598319 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3130  agmatine deiminase  29.74 
 
 
370 aa  160  4e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3288  agmatine deiminase  29.74 
 
 
370 aa  159  5e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4219  Agmatine deiminase  29.36 
 
 
340 aa  159  7e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.292037 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3139  agmatine deiminase  29.74 
 
 
370 aa  159  9e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0136309  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0887  agmatine deiminase  29.15 
 
 
370 aa  158  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0153  agmatine deiminase  28.94 
 
 
367 aa  158  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0168  agmatine deiminase  28.9 
 
 
367 aa  157  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52163  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3282  agmatine deiminase  29.15 
 
 
370 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1615  agmatine deiminase  29.36 
 
 
370 aa  156  4e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0337  agmatine deiminase  27.38 
 
 
368 aa  156  4e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0383  agmatine deiminase  26.78 
 
 
368 aa  155  6e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0266  agmatine deiminase  26.44 
 
 
368 aa  153  3e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0169338 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2962  agmatine deiminase  28.74 
 
 
374 aa  154  3e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0291  agmatine deiminase  26.72 
 
 
368 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2521  agmatine deiminase  28.57 
 
 
375 aa  152  6e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.415458 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>