More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0824 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0824  recombination factor protein RarA  100 
 
 		 392 aa  801    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00630594  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1825  recombination factor protein RarA  62.92 
 
 		 394 aa  528  1e-149  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1776  recombination factor protein RarA  62.31 
 
 		 397 aa  522  1e-147  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0191  recombination factor protein RarA  61.73 
 
 		 393 aa  495  1e-139  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0229  recombination factor protein RarA  61.99 
 
 		 393 aa  496  1e-139  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0208  recombination factor protein RarA  61.73 
 
 		 393 aa  495  1e-139  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1569  recombination factor protein RarA  59.49 
 
 		 396 aa  488  1e-137  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0066  AAA ATPase central domain protein  57.65 
 
 		 396 aa  486  1e-136  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0211  recombination factor protein RarA  52.33 
 
 		 393 aa  410  1e-113  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0141  ATPase central domain-containing protein  40.1 
 
 		 416 aa  294  2e-78  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1199  AAA ATPase central domain protein  40.38 
 
 		 428 aa  288  9e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0815  AAA ATPase central domain protein  43.22 
 
 		 395 aa  286  4e-76  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1125  AAA ATPase central domain protein  40.66 
 
 		 408 aa  282  7.000000000000001e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00180693  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2509  recombination factor protein RarA  39.52 
 
 		 435 aa  280  3e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0107971  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2328  recombination factor protein RarA  38.07 
 
 		 432 aa  278  1e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.279354  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1323  recombination factor protein RarA  40.05 
 
 		 411 aa  277  2e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0587994  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0184  AAA ATPase central domain protein  40.52 
 
 		 426 aa  276  3e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.858304 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1853  recombination factor protein RarA  38.75 
 
 		 430 aa  276  3e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0732  recombination factor protein RarA  39.76 
 
 		 457 aa  275  8e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2405  recombination factor protein RarA  41.3 
 
 		 420 aa  275  8e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1498  AAA ATPase central domain protein  40.38 
 
 		 435 aa  275  1.0000000000000001e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05640  putative ATPase, AAA family protein  42.64 
 
 		 425 aa  274  2.0000000000000002e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.721032  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0452  AAA ATPase central domain protein  38.41 
 
 		 443 aa  274  2.0000000000000002e-72  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1618  recombination factor protein RarA  40.62 
 
 		 445 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0463  recombination factor protein RarA  37.44 
 
 		 440 aa  273  3e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000023762  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2447  recombination factor protein RarA  37.98 
 
 		 434 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1885  recombination factor protein RarA  39.47 
 
 		 447 aa  273  5.000000000000001e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0414  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  38.5 
 
 		 599 aa  273  5.000000000000001e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174137  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1770  recombination factor protein RarA  37.98 
 
 		 434 aa  271  1e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220644 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0429  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  38.5 
 
 		 599 aa  271  1e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000753896  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0420  AAA ATPase central domain protein  37.32 
 
 		 423 aa  268  1e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  37.5 
 
 		 441 aa  268  1e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2242  recombination factor protein RarA  37.59 
 
 		 448 aa  268  1e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00131552  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2031  AAA ATPase central domain protein  39.05 
 
 		 447 aa  267  2e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.039319  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0832  recombination factor protein RarA  40.44 
 
 		 454 aa  267  2e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1061  recombination factor protein RarA  38.39 
 
 		 441 aa  267  2.9999999999999995e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.327503  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1656  recombination factor protein RarA  38.5 
 
 		 441 aa  266  4e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000573735  hitchhiker  0.00861976 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07770  Recombination protein MgsA  37.86 
 
 		 446 aa  266  4e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.138045 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1440  recombination factor protein RarA  37.8 
 
 		 426 aa  266  4e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0144  recombination factor protein RarA  41.6 
 
 		 378 aa  265  1e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0257  recombination factor protein RarA  39.3 
 
 		 439 aa  264  2e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000097809  normal  0.0366003 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12030  recombination factor protein RarA  37.88 
 
 		 450 aa  264  2e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0953  recombination factor protein RarA  39.18 
 
 		 446 aa  264  2e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2558  AAA ATPase central domain protein  37.53 
 
 		 446 aa  263  3e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0410  recombination factor protein RarA  42.08 
 
 		 425 aa  263  3e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.108672  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0016  recombination factor protein RarA  40.78 
 
 		 441 aa  263  4e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.901386  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12760  recombination factor protein RarA  39.13 
 
 		 465 aa  263  4e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.294411  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0626  recombination factor protein RarA  37.98 
 
 		 453 aa  263  4.999999999999999e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432966  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0617  recombination factor protein RarA  38.86 
 
 		 432 aa  263  4.999999999999999e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907625  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1704  recombination factor protein RarA  36.21 
 
 		 435 aa  262  8e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1974  AAA ATPase central domain protein  35.48 
 
 		 456 aa  261  1e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.381905  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2067  recombination factor protein RarA  36.3 
 
 		 440 aa  261  2e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.792002  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0094  recombination factor protein RarA  38.19 
 
 		 429 aa  261  2e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0502  recombination factor protein RarA  38.15 
 
 		 444 aa  261  2e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0383176  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0103  recombination factor protein RarA  37.71 
 
 		 429 aa  260  3e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0537  AAA ATPase central domain protein  37.32 
 
 		 432 aa  260  3e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3583  recombination factor protein RarA  37.8 
 
 		 437 aa  260  3e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000174356  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0165  AAA ATPase central domain protein  39.02 
 
 		 419 aa  259  7e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0836  recombination factor protein RarA  37.86 
 
 		 449 aa  258  1e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1785  recombination factor protein RarA  38.15 
 
 		 447 aa  257  2e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.295244  hitchhiker  0.00333986 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0154  recombination factor protein RarA  38.83 
 
 		 410 aa  257  2e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16380  Recombination protein MgsA  36.58 
 
 		 461 aa  258  2e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.8867  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0792  AAA ATPase central domain protein  38.07 
 
 		 431 aa  257  3e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00871  recombination factor protein RarA  36.56 
 
 		 455 aa  256  3e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0752794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2041  recombination factor protein RarA  36.67 
 
 		 435 aa  256  7e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3766  recombination factor protein RarA  35.25 
 
 		 446 aa  255  9e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1564  recombination factor protein RarA  36.52 
 
 		 404 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.228018 
 
 
-
 
NC_002950  PG1103  recombination factor protein RarA  38.72 
 
 		 434 aa  254  2.0000000000000002e-66  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05070  Recombination protein MgsA  37.06 
 
 		 435 aa  253  5.000000000000001e-66  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.395442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1040  recombination factor protein RarA  41.14 
 
 		 429 aa  252  7e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.405947  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2010  AAA ATPase central domain protein  36.85 
 
 		 484 aa  252  9.000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.105628  normal  0.523628 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1936  recombination factor protein RarA  39.72 
 
 		 432 aa  251  1e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.160058  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0027  AAA ATPase central domain protein  37.76 
 
 		 459 aa  251  1e-65  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.797145 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5733  AAA ATPase central domain protein  38.54 
 
 		 423 aa  251  2e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.855875  normal  0.0926038 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0323  AAA ATPase central domain protein  37.05 
 
 		 458 aa  250  3e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2635  recombination factor protein RarA  34.39 
 
 		 429 aa  249  4e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0339  recombination factor protein RarA  36.04 
 
 		 408 aa  249  6e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.317143 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3309  AAA ATPase central domain protein  34.89 
 
 		 494 aa  247  3e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000347883  normal  0.0560035 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1168  recombination factor protein RarA  34.52 
 
 		 407 aa  246  6e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2590  recombination factor protein RarA  39.4 
 
 		 422 aa  245  9e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000937072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2132  AAA ATPase central domain protein  36.67 
 
 		 463 aa  245  9e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000588224  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3035  recombination factor protein RarA  36.75 
 
 		 456 aa  244  9.999999999999999e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.25425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1333  recombination factor protein RarA  35.51 
 
 		 500 aa  243  5e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.272452  normal  0.489107 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1401  recombination factor protein RarA  34.51 
 
 		 411 aa  242  6e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2050  AAA ATPase central domain-containing protein  36.17 
 
 		 436 aa  241  1e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3111  recombination factor protein RarA  35.95 
 
 		 428 aa  241  1e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.016045  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2364  recombination factor protein RarA  33.33 
 
 		 445 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.602751  normal  0.774501 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0717  recombination factor protein RarA  36.43 
 
 		 428 aa  241  2e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000773245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4246  recombination factor protein RarA  36.19 
 
 		 428 aa  241  2e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255424  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2325  recombination factor protein RarA  33.33 
 
 		 445 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.90539  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2372  recombination factor protein RarA  33.33 
 
 		 445 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0041  recombination factor protein RarA  36.83 
 
 		 459 aa  241  2e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.481618  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4142  recombination factor protein RarA  36.43 
 
 		 428 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000391384  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3401  AAA ATPase central domain protein  33.03 
 
 		 463 aa  240  2.9999999999999997e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.230972 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0080  recombination factor protein RarA  39.16 
 
 		 429 aa  240  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0826  recombination factor protein RarA  36.87 
 
 		 462 aa  239  4e-62  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4482  recombination factor protein RarA  36.19 
 
 		 428 aa  239  4e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.274389  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4519  recombination factor protein RarA  36.19 
 
 		 428 aa  240  4e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.002942  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4131  recombination factor protein RarA  36.19 
 
 		 428 aa  239  5e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013957  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2081  recombination factor protein RarA  36.39 
 
 		 441 aa  239  5e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>