80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0782 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0782  DNA ligase  100 
 
 		 275 aa  544  1e-154  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.200091  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1395  DNA ligase  55.56 
 
 		 272 aa  295  4e-79  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.168291  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0465  DNA ligase  50.9 
 
 		 275 aa  282  5.000000000000001e-75  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.51001  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1225  DNA ligase  53.33 
 
 		 302 aa  276  3e-73  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0877468  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0584  DNA ligase  46.49 
 
 		 272 aa  259  2e-68  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000250691  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1324  DNA ligase  46.89 
 
 		 269 aa  258  7e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1796  DNA ligase (ATP)  48.43 
 
 		 271 aa  256  2e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1672  DNA ligase  45.24 
 
 		 266 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0036  DNA ligase  45.39 
 
 		 312 aa  240  2e-62  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2043  DNA ligase  42.65 
 
 		 282 aa  229  5e-59  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000183031  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1665  DNA ligase  42.29 
 
 		 282 aa  228  1e-58  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1484  DNA ligase  41.61 
 
 		 282 aa  226  4e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.159526  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1841  DNA ligase  41.94 
 
 		 282 aa  225  7e-58  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.867286  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1157  DNA ligase  42.09 
 
 		 279 aa  223  3e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00148017  normal  0.132142 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0812  DNA ligase  39.37 
 
 		 306 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.35337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1235  DNA ligase  38.08 
 
 		 279 aa  211  7e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1148  DNA ligase  38.87 
 
 		 282 aa  208  8e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.269751  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2439  DNA ligase  39.68 
 
 		 309 aa  206  5e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.488176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0073  DNA ligase  38.1 
 
 		 279 aa  203  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.555561  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3695  DNA ligase  37.27 
 
 		 295 aa  202  4e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2639  DNA ligase  38.1 
 
 		 281 aa  202  4e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00943925  normal  0.0523485 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1852  DNA ligase  38.31 
 
 		 315 aa  202  5e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0107738  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1886  DNA ligase  38.46 
 
 		 315 aa  201  9e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0219866  normal  0.840695 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1838  DNA ligase  38.06 
 
 		 315 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00105408  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2511  DNA ligase  40.54 
 
 		 291 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2268  DNA ligase  35.27 
 
 		 302 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.819174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2191  DNA ligase  35.27 
 
 		 302 aa  199  3e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.163072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2401  DNA ligase  36.58 
 
 		 304 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.980486 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1748  DNA ligase  37.65 
 
 		 309 aa  198  9e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2019  DNA ligase  35.27 
 
 		 295 aa  198  9e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03421  DNA ligase  36.42 
 
 		 317 aa  197  1.0000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0077  DNA ligase  37.25 
 
 		 298 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.285949  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003526  ATP-dependent DNA ligase  35.74 
 
 		 281 aa  195  8.000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2204  DNA ligase  36.13 
 
 		 311 aa  194  9e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2369  DNA ligase  35.94 
 
 		 279 aa  191  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.815308  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2739  DNA ligase  36.11 
 
 		 283 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2416  DNA ligase  35.02 
 
 		 306 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1990  DNA ligase  38.59 
 
 		 288 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00542431 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1587  DNA ligase  36.61 
 
 		 270 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.382464  normal  0.257911 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1436  DNA ligase  36.65 
 
 		 298 aa  189  4e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.532256  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3497  DNA ligase  34.68 
 
 		 337 aa  189  5.999999999999999e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.105029 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1366  DNA ligase  36.08 
 
 		 284 aa  187  1e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.332373  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4404  DNA ligase  37.2 
 
 		 292 aa  188  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1359  DNA ligase  35.06 
 
 		 290 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2251  DNA ligase  36.55 
 
 		 375 aa  182  6e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2761  DNA ligase  36.55 
 
 		 326 aa  181  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2712  DNA ligase  34.65 
 
 		 303 aa  181  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0226859 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1995  DNA ligase  35.59 
 
 		 282 aa  159  3e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0244293  normal  0.371724 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1648  PBCV-1 DNA ligase  27.17 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.176774  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18701  ATP-dependent DNA ligase  25.37 
 
 		 412 aa  58.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0026  DNA ligase D  25.54 
 
 		 825 aa  53.9  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.282762  hitchhiker  0.00000000359668 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0998  DNA ligase D  27.93 
 
 		 861 aa  51.6  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18891  ATP-dependent DNA ligase  29.66 
 
 		 437 aa  50.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.986725  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18701  ATP-dependent DNA ligase  27.78 
 
 		 437 aa  50.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.570895  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2438  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  28.42 
 
 		 509 aa  49.7  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.126191  normal  0.0460021 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1772  ATP-dependent DNA ligase  23.13 
 
 		 437 aa  48.9  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4475  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  23.2 
 
 		 576 aa  48.9  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1170  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  30.71 
 
 		 601 aa  47.4  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.51261  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1951  DNA ligase D  24.91 
 
 		 822 aa  47.4  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00524792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1799  ATP-dependent DNA ligase  20.34 
 
 		 520 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.07397  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1846  ATP-dependent DNA ligase  20.34 
 
 		 520 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297739  normal  0.661172 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1780  ATP-dependent DNA ligase  20.34 
 
 		 520 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.161511  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0933  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  23.93 
 
 		 522 aa  45.8  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.399541  normal  0.755434 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2642  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  29.17 
 
 		 592 aa  45.8  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.750554  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2025  ATP-dependent DNA ligase  21.77 
 
 		 534 aa  44.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189008  normal  0.878138 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7782  putative ATP-dependent DNA ligase  22.77 
 
 		 351 aa  45.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.089551  normal  0.119022 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0011  ATP-dependent DNA ligase  26.23 
 
 		 864 aa  44.3  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0339968 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7176  ATP-dependent DNA ligase  28.05 
 
 		 508 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3003  ATP-dependent DNA ligase  22.1 
 
 		 882 aa  43.9  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0636525  normal  0.554248 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3330  DNA ligase D  25.75 
 
 		 896 aa  43.9  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.580871  normal  0.138663 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4321  ATP-dependent DNA ligase  23.08 
 
 		 511 aa  43.5  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1534  DNA ligase, ATP-dependent  24.03 
 
 		 432 aa  43.1  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120841  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36910  ATP-dependent DNA ligase  25 
 
 		 840 aa  43.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0564843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0294  ATP-dependent DNA ligase  27.92 
 
 		 845 aa  43.1  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3173  ATP-dependent DNA ligase  25.54 
 
 		 847 aa  43.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3303  ATP dependent DNA ligase  23.87 
 
 		 855 aa  42.7  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300283  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0939  DNA ligase D  22.95 
 
 		 847 aa  42.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0448  ATP-dependent DNA ligase  23.47 
 
 		 866 aa  42  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2247  ATP-dependent DNA ligase  23.37 
 
 		 846 aa  42  0.01  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1037  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  26.79 
 
 		 588 aa  42  0.01  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>