More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0690 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0690  ExbDTolR family transport protein  100 
 
 
132 aa  269  1e-71  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00894494  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1522  ExbDTolR family transport protein  61.36 
 
 
130 aa  161  2e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  2.05974e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1741  ExbDTolR family transport protein  61.72 
 
 
132 aa  158  2e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.490579  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0920  putative polysaccharide deacetylase  61.72 
 
 
132 aa  153  7e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0743675  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0145  TonB system transport protein ExbD, putative  56.35 
 
 
129 aa  137  5e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  5.7869e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0105  TonB system transport protein ExbD, putative  56.35 
 
 
129 aa  137  5e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.664696  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0117  TonB system transport protein ExbD, putative  55.56 
 
 
129 aa  136  7e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  3.84782e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0518  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  54.69 
 
 
130 aa  130  6e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0198  TonB system transport protein ExbD  53.17 
 
 
128 aa  125  2e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00125254  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1400  biopolymer transport protein ExbD/TolR  48.15 
 
 
130 aa  112  2e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.377979  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4429  protein TolR  36.8 
 
 
173 aa  77.8  4e-14  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.681247 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0173  biopolymer ExbD/TolR family transporter  38.89 
 
 
136 aa  77.8  5e-14  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.311198  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2418  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.78 
 
 
144 aa  77  8e-14  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0695  protein TolR  37.8 
 
 
150 aa  75.9  2e-13  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0661  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.8 
 
 
150 aa  75.9  2e-13  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.602006  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2135  biopolymer transport, TolR  33.6 
 
 
167 aa  75.5  2e-13  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0696  protein TolR  37.8 
 
 
150 aa  75.9  2e-13  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.76246  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0391  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.21 
 
 
159 aa  75.1  3e-13  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1587  protein TolR  35.83 
 
 
138 aa  73.2  1e-12  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.437138  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1015  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.2 
 
 
150 aa  71.2  4e-12  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4210  TonB system transport protein ExbD type-1  32.5 
 
 
142 aa  71.2  4e-12  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.25 
 
 
144 aa  70.9  5e-12  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3058  biopolymer transport TolR  32.79 
 
 
152 aa  70.9  6e-12  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0312035  normal  0.159163 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2533  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.4 
 
 
144 aa  70.5  7e-12  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  4.32796e-06  normal  0.100758 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2370  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.4 
 
 
144 aa  70.5  7e-12  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  2.01992e-05  normal  0.146866 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3760  TonB system transport protein ExbD  32.52 
 
 
139 aa  70.1  9e-12  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2088  tolR protein  30.71 
 
 
145 aa  70.1  9e-12  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00030908  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1392  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.37 
 
 
142 aa  69.7  1e-11  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  2.55119e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0330  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.92 
 
 
173 aa  69.3  2e-11  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.175992  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0068  TonB system transport protein ExbD  32.52 
 
 
141 aa  69.3  2e-11  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0204  biopolymer transport protein ExbD  32.52 
 
 
141 aa  69.3  2e-11  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4003  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.17 
 
 
145 aa  68.9  2e-11  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1092  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.79 
 
 
166 aa  68.6  3e-11  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0705  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.86 
 
 
152 aa  68.6  3e-11  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.105618  normal  0.350278 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0586  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 
136 aa  68.6  3e-11  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0531481  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1049  biopolymer transport ExbD protein  34.43 
 
 
133 aa  68.2  4e-11  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1255  TonB system transport protein ExbD type-1  31.67 
 
 
169 aa  67.8  5e-11  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.51439  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0971  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.26 
 
 
137 aa  67.4  5e-11  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1525  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.37 
 
 
144 aa  67.8  5e-11  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0168753  normal  0.844163 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2120  biopolymer transport TolR  32.26 
 
 
152 aa  67.4  6e-11  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0523748  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5307  biopolymer transport protein ExbD  31.54 
 
 
142 aa  67.4  6e-11  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.153689 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5216  biopolymer transport protein ExbD  31.54 
 
 
142 aa  67.4  6e-11  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2239  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.97 
 
 
140 aa  67.4  7e-11  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2118  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.97 
 
 
142 aa  67  7e-11  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3580  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.5 
 
 
144 aa  67  7e-11  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5355  biopolymer transport protein ExbD  30.08 
 
 
142 aa  67  8e-11  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.610359  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2442  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.4 
 
 
144 aa  67  8e-11  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  6.89995e-06  normal  0.227653 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2901  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.92 
 
 
147 aa  67  8e-11  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00149833  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1242  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.67 
 
 
146 aa  67  9e-11  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0853044  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2212  biopolymer transport TolR  30.89 
 
 
140 aa  66.6  1e-10  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  9.48089e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3173  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.33 
 
 
149 aa  66.2  1e-10  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.673251  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2154  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.04 
 
 
155 aa  66.6  1e-10  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.8914  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0748  protein TolR  31.71 
 
 
155 aa  66.6  1e-10  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.031429  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0745  protein TolR  32.79 
 
 
140 aa  66.2  1e-10  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  7.86072e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2733  protein TolR  29.37 
 
 
145 aa  66.2  1e-10  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0139663  hitchhiker  1.79602e-05 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3136  protein TolR  28.91 
 
 
146 aa  66.2  1e-10  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2977  TolR protein  33.06 
 
 
144 aa  66.6  1e-10  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4541  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.17 
 
 
142 aa  66.2  1e-10  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0346  biopolymer transport protein ExbD  32.52 
 
 
141 aa  65.9  2e-10  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0726  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30 
 
 
187 aa  65.9  2e-10  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.15869  normal  0.498503 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0374  TonB system transport protein ExbD type-1  31.71 
 
 
141 aa  65.9  2e-10  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2750  tolr protein  30.4 
 
 
144 aa  66.2  2e-10  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3640  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.33 
 
 
150 aa  65.5  2e-10  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2221  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.31 
 
 
134 aa  65.9  2e-10  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.109447  normal  0.312711 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4274  TonB system transport protein ExbD type-1  34.65 
 
 
164 aa  65.9  2e-10  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0093154 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2363  protein TolR  31.67 
 
 
139 aa  65.5  3e-10  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372464 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0470  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.77 
 
 
141 aa  65.5  3e-10  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.923665 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0389  biopolymer transport protein ExbD  31.71 
 
 
141 aa  65.5  3e-10  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.627769  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0592  biopolymer transport protein ExbD  31.67 
 
 
143 aa  65.1  3e-10  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.06 
 
 
149 aa  65.1  3e-10  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5529  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.89 
 
 
140 aa  65.1  3e-10  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0267  biopolymer transport protein ExbD  31.67 
 
 
143 aa  65.1  3e-10  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.134786  normal  0.162508 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0673  biopolymer transport protein ExbD  31.67 
 
 
143 aa  65.1  3e-10  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.717059  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0281  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.67 
 
 
139 aa  64.7  4e-10  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149561  hitchhiker  0.000106063 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0166  biopolymer transport protein ExbD  30.89 
 
 
142 aa  64.7  4e-10  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0981914 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3544  biopolymer transport protein ExbD  30.95 
 
 
156 aa  64.3  5e-10  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0612  ExbD/TolR family protein  31.97 
 
 
143 aa  64.3  5e-10  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3597  TonB system transport protein ExbD  30 
 
 
139 aa  64.3  5e-10  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1076  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.15 
 
 
143 aa  63.9  6e-10  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2580  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.83 
 
 
141 aa  64.3  6e-10  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.25042  normal  0.920318 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2225  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.89 
 
 
142 aa  63.9  6e-10  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361252  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1641  protein TolR  31.15 
 
 
150 aa  63.9  6e-10  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0573  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.3 
 
 
139 aa  63.9  6e-10  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.234389  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1699  ExbD/TolR family TonB system transport protein  31.15 
 
 
150 aa  63.9  6e-10  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1740  biopolymer transport TolR  28.91 
 
 
144 aa  63.9  7e-10  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  3.88711e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3416  biopolymer transport protein ExbD  36.29 
 
 
141 aa  63.9  7e-10  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1744  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.91 
 
 
144 aa  63.9  7e-10  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  2.76409e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1605  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.8 
 
 
144 aa  63.9  7e-10  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  7.81876e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2540  protein TolR  28.91 
 
 
144 aa  63.9  7e-10  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  6.62541e-07  hitchhiker  2.51452e-06 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3538  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.27 
 
 
139 aa  63.9  7e-10  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.1299e-11  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2200  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.89 
 
 
140 aa  63.9  7e-10  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2919  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.31 
 
 
134 aa  63.9  7e-10  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0661927  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5877  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.89 
 
 
140 aa  63.9  7e-10  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3433  biopolymer transport protein ExbD  32.28 
 
 
141 aa  63.5  8e-10  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0693  TonB system transport protein ExbD  32.28 
 
 
141 aa  63.5  8e-10  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4316  biopolymer transport protein ExbD  32.28 
 
 
141 aa  63.5  8e-10  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0506  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.23 
 
 
154 aa  63.5  8e-10  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529067  hitchhiker  0.000695312 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3290  biopolymer transport protein ExbD  32.28 
 
 
141 aa  63.5  8e-10  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0690  biopolymer transport protein ExbD  32.28 
 
 
141 aa  63.5  8e-10  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02829  hypothetical protein  32.28 
 
 
141 aa  63.5  8e-10  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>