More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0688 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0688  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  100 
 
 
130 aa  261  2e-69  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00189916  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1739  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  52.31 
 
 
129 aa  142  2e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.577687  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0918  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  51.54 
 
 
129 aa  138  3e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0350639  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1524  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  51.54 
 
 
129 aa  137  5e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000172904  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0196  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  50.39 
 
 
130 aa  135  1e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00211971  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0516  ATP synthase F1, epsilon subunit  53.85 
 
 
131 aa  135  2e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0115  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  52.03 
 
 
129 aa  120  7e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0001138  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0103  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  51.22 
 
 
129 aa  118  2e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0143  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  51.22 
 
 
129 aa  118  2e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  4.40039e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1402  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.74 
 
 
130 aa  96.3  1e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.537501  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1227  H+-transporting two-sector ATPase, delta/epsilon subunit  37.25 
 
 
134 aa  72  2e-12  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2800  ATP synthase F1, epsilon subunit  38.32 
 
 
133 aa  69.7  1e-11  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.694074  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4735  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44.71 
 
 
86 aa  67.8  5e-11  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00461948 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4869  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.9 
 
 
133 aa  67.4  7e-11  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4195  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.77 
 
 
137 aa  67  8e-11  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4074  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.77 
 
 
137 aa  67  8e-11  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.69427  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4254  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.77 
 
 
137 aa  67  8e-11  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4089  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.77 
 
 
139 aa  67  9e-11  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4145  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.77 
 
 
139 aa  67  9e-11  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0539  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.84 
 
 
140 aa  67  9e-11  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000746068  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4190  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.2 
 
 
139 aa  66.6  1e-10  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03559  hypothetical protein  31.2 
 
 
139 aa  66.2  1e-10  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.772502  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4246  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.2 
 
 
139 aa  66.2  1e-10  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.014203  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03615  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.2 
 
 
139 aa  66.2  1e-10  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.901981  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3947  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.2 
 
 
139 aa  66.2  1e-10  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4236  ATP synthase F1, epsilon subunit  31.2 
 
 
139 aa  66.2  1e-10  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4099  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.2 
 
 
139 aa  66.2  1e-10  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.420004 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4263  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.2 
 
 
139 aa  66.2  1e-10  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.634105  normal  0.317947 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4133  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.05 
 
 
139 aa  66.2  1e-10  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.490759  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5167  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.2 
 
 
139 aa  66.2  1e-10  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0939649 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0063  ATP synthase F1, epsilon subunit  34.34 
 
 
140 aa  65.5  2e-10  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4461  ATP synthase F1, epsilon subunit  33.61 
 
 
139 aa  65.9  2e-10  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  8.84862e-08 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3345  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.36 
 
 
138 aa  64.7  4e-10  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00950448  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3186  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.25 
 
 
138 aa  64.3  6e-10  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0578931  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0217  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.95 
 
 
134 aa  63.9  7e-10  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.812773  normal  0.0791125 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0337  H+-transporting two-sector ATPase, epsilon subunit  40 
 
 
80 aa  63.9  7e-10  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0565  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.67 
 
 
140 aa  63.9  8e-10  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0014162  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3493  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.46 
 
 
138 aa  63.5  8e-10  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000220298  normal  0.513803 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0009  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.09 
 
 
139 aa  63.9  8e-10  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.31863  normal  0.0360831 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_504  ATP synthase F1, epsilon subunit  41.67 
 
 
140 aa  63.5  8e-10  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000115824  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6913  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.24 
 
 
133 aa  63.5  9e-10  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3955  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.51 
 
 
142 aa  63.2  1e-09  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0052877  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4548  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.41 
 
 
139 aa  63.2  1e-09  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0140  ATP synthase F1, epsilon subunit  33.64 
 
 
140 aa  62.8  1e-09  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7072  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  37.04 
 
 
83 aa  63.2  1e-09  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.689202  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3026  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.27 
 
 
141 aa  62.4  2e-09  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0062  ATP synthase F1, epsilon subunit  36.92 
 
 
140 aa  62  2e-09  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4258  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  27.64 
 
 
139 aa  62.4  2e-09  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0344  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.58 
 
 
133 aa  61.6  3e-09  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0213495 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04082  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.04 
 
 
137 aa  61.6  3e-09  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3764  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  39.74 
 
 
80 aa  61.6  3e-09  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0198  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.12 
 
 
138 aa  61.6  3e-09  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21390  F0F1-type ATP synthase, epsilon subunit  41.67 
 
 
87 aa  61.6  3e-09  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3511  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.46 
 
 
138 aa  61.6  3e-09  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000312684 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2326  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.46 
 
 
138 aa  61.6  4e-09  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.701275  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3149  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.62 
 
 
132 aa  61.6  4e-09  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4164  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.77 
 
 
133 aa  61.6  4e-09  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  1.97005e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4294  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.56 
 
 
137 aa  61.2  5e-09  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.474087  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4195  ATP synthase F1, epsilon subunit  28.57 
 
 
140 aa  61.2  5e-09  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2023  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.23 
 
 
138 aa  60.8  5e-09  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.471651 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0041  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.27 
 
 
141 aa  60.8  5e-09  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.952205  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3893  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.46 
 
 
141 aa  60.5  8e-09  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159746  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0874  ATP synthase F1, epsilon subunit  33.65 
 
 
135 aa  60.1  9e-09  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2756  ATP synthase F1, epsilon subunit  40.51 
 
 
148 aa  60.1  9e-09  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2429  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  27.91 
 
 
141 aa  60.5  9e-09  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0464757  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4790  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.51 
 
 
132 aa  60.1  9e-09  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0256  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.76 
 
 
138 aa  60.1  9e-09  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.344579  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4603  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.01 
 
 
139 aa  59.7  1e-08  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.359837  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1682  ATP synthase F1, epsilon subunit  33.73 
 
 
137 aa  59.7  1e-08  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.87905  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0810  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.33 
 
 
139 aa  60.1  1e-08  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.116067  normal  0.642417 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4469  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.01 
 
 
139 aa  59.7  1e-08  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0365154  normal  0.135413 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12040  ATP synthase, F1 epsilon subunit  37.89 
 
 
133 aa  59.7  1e-08  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3073  H+-transporting two-sector ATPase, delta/epsilon subunit  29.37 
 
 
140 aa  60.1  1e-08  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0328  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.76 
 
 
138 aa  59.7  1e-08  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.531135 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0984  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.77 
 
 
139 aa  59.7  1e-08  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0109346  normal  0.392067 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0373  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.59 
 
 
138 aa  59.3  1e-08  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3525  ATP synthase F1, epsilon subunit  30.61 
 
 
125 aa  59.3  1e-08  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.012932 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0027  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  27.68 
 
 
138 aa  58.9  2e-08  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.155859  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4239  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.77 
 
 
142 aa  58.9  2e-08  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.785039  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2381  ATP synthase F1, epsilon subunit  37.35 
 
 
137 aa  59.3  2e-08  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2868  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.69 
 
 
140 aa  58.9  2e-08  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3130  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.65 
 
 
138 aa  58.9  2e-08  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2832  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.18 
 
 
134 aa  59.3  2e-08  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0984  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.18 
 
 
134 aa  59.3  2e-08  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.111243  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0511  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.74 
 
 
139 aa  59.3  2e-08  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.808616 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1463  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.78 
 
 
133 aa  59.3  2e-08  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.277241 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3492  ATP synthase F1, epsilon subunit  26.77 
 
 
152 aa  58.9  2e-08  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0175018  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2743  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.5 
 
 
141 aa  58.5  3e-08  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0084  ATP synthase F1, epsilon subunit  40.48 
 
 
139 aa  58.2  3e-08  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.78895  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0105  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.59 
 
 
138 aa  58.5  3e-08  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0907989  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1465  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.78 
 
 
133 aa  58.5  3e-08  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.708115  normal  0.0599102 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0421  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.59 
 
 
138 aa  58.5  3e-08  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1742  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.78 
 
 
133 aa  58.5  3e-08  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.18853  normal  0.13478 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1264  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.74 
 
 
139 aa  58.2  3e-08  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3994  ATP synthase F1, epsilon subunit  33.33 
 
 
140 aa  58.2  4e-08  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.305683  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4874  ATP synthase F1, epsilon subunit  26.77 
 
 
152 aa  58.2  4e-08  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3316  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.36 
 
 
137 aa  58.2  4e-08  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0532539  normal  0.0655418 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0174  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.52 
 
 
142 aa  57.8  5e-08  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3729  ATP synthase F1, epsilon subunit  28 
 
 
139 aa  57.8  5e-08  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4016  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.06 
 
 
142 aa  57.8  5e-08  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.821379  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>