40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0684 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0684  F0F1 ATP synthase subunit delta  100 
 
 
176 aa  343  8.999999999999999e-94  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.948388  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0512  ATP synthase F1, delta subunit  46.02 
 
 
176 aa  150  5.9999999999999996e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0914  F0F1 ATP synthase subunit delta  43.75 
 
 
176 aa  144  5e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00240789  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1735  F0F1 ATP synthase subunit delta  40.34 
 
 
176 aa  133  9.999999999999999e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1528  F0F1 ATP synthase subunit delta  43.18 
 
 
176 aa  125  3e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0797496  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0192  F0F1 ATP synthase subunit delta  39.2 
 
 
173 aa  111  5e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.745397  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0111  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.05 
 
 
173 aa  110  8.000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.262179  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0099  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.63 
 
 
173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0139  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.63 
 
 
173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1406  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.9 
 
 
177 aa  107  9.000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.233831  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0194  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.17 
 
 
177 aa  48.9  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2328  ATP synthase F1, delta subunit  26.39 
 
 
178 aa  48.1  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000241371  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3461  ATP synthase F1, delta subunit  27.69 
 
 
179 aa  47.4  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.330748  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2590  ATP synthase F1, delta subunit  19.71 
 
 
178 aa  46.6  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.570122  normal  0.0802262 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2937  ATP synthase delta chain  28.29 
 
 
186 aa  46.2  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.213023  normal  0.0695694 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2872  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.65 
 
 
179 aa  46.6  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3190  F0F1 ATP synthase subunit delta  25 
 
 
178 aa  45.4  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0305  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.37 
 
 
180 aa  45.1  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00790297 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0300  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.37 
 
 
180 aa  45.1  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.205261  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3030  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.9 
 
 
179 aa  44.7  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1518  ATP synthase F1, delta subunit  31.25 
 
 
175 aa  44.3  0.0009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000129191 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0103  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.22 
 
 
179 aa  42.4  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163792  normal  0.702124 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0094  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.22 
 
 
179 aa  42.4  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.244879  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0182  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.37 
 
 
179 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.98764  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3529  F0F1 ATP synthase subunit delta  20.56 
 
 
177 aa  42  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244392 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3012  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.97 
 
 
179 aa  42  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.250614  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3320  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.89 
 
 
178 aa  42  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0028725  normal  0.130024 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4045  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.97 
 
 
179 aa  42  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3971  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.97 
 
 
179 aa  42  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1590  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.97 
 
 
179 aa  42  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0134138  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3311  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.97 
 
 
179 aa  42  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0205663  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3409  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.17 
 
 
180 aa  42.4  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0895663  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2954  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.97 
 
 
179 aa  42  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0301983  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3897  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.43 
 
 
179 aa  41.6  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.890159  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0369  F0F1 ATP synthase subunit delta  21.74 
 
 
180 aa  42  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.398312 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5486  F0F1 ATP synthase subunit delta  25 
 
 
180 aa  41.6  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.151912  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5430  F0F1 ATP synthase subunit delta  25 
 
 
180 aa  41.6  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0101333  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0037  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.43 
 
 
179 aa  41.6  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0129228  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5433  F0F1 ATP synthase subunit delta  25 
 
 
180 aa  41.6  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5521  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.71 
 
 
180 aa  41.2  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000263908  hitchhiker  0.00000000000000110124 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>