More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0612 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0612  translation initiation factor IF-3  100 
 
 		 173 aa  347  6e-95  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0082  translation initiation factor IF-3  67.44 
 
 		 171 aa  233  7e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000496209  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0329  translation initiation factor IF-3  70.93 
 
 		 172 aa  223  1e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000359846  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1818  translation initiation factor IF-3  72.73 
 
 		 165 aa  220  9e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.228131  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1701  translation initiation factor IF-3  70.35 
 
 		 172 aa  219  9.999999999999999e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00889873  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0200  translation initiation factor IF-3  71.51 
 
 		 172 aa  218  1.9999999999999999e-56  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0239  translation initiation factor IF-3  71.51 
 
 		 172 aa  218  1.9999999999999999e-56  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0217  translation initiation factor IF-3  71.51 
 
 		 172 aa  218  3.9999999999999997e-56  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0029  translation initiation factor IF-3  69.77 
 
 		 173 aa  215  2e-55  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0067  translation initiation factor IF-3  56.47 
 
 		 172 aa  189  1e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101132  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0425  translation initiation factor IF-3  46.78 
 
 		 171 aa  151  4e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00000964088  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2156  translation initiation factor IF-3  43.93 
 
 		 175 aa  142  2e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000187486  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1409  translation initiation factor IF-3  43.9 
 
 		 172 aa  142  3e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  1.37178e-16  unclonable  1.3418400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0798  translation initiation factor IF-3  44.05 
 
 		 202 aa  141  4e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2660  translation initiation factor IF-3  44.64 
 
 		 190 aa  141  4e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000648528  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05720  translation initiation factor 3  46.11 
 
 		 207 aa  141  6e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000188671  normal  0.0169059 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0215  translation initiation factor IF-3  42.6 
 
 		 198 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.62616e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0333  translation initiation factor IF-3  43.29 
 
 		 194 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2150  translation initiation factor IF-3  44.17 
 
 		 173 aa  138  3e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.235978  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4706  translation initiation factor IF-3  42.69 
 
 		 195 aa  138  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000432272  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4471  translation initiation factor IF-3  42.69 
 
 		 195 aa  138  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000220658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4306  translation initiation factor IF-3  42.69 
 
 		 195 aa  138  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000145665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4317  translation initiation factor IF-3  42.69 
 
 		 195 aa  138  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000117232  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1937  translation initiation factor IF-3  43.29 
 
 		 194 aa  139  3e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0510424  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4819  translation initiation factor IF-3  42.69 
 
 		 186 aa  138  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000690292  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0588  translation initiation factor IF-3  43.29 
 
 		 194 aa  139  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.954262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1758  translation initiation factor 3  41.56 
 
 		 154 aa  138  3.9999999999999997e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000120038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3622  translation initiation factor IF-3  44.24 
 
 		 357 aa  138  3.9999999999999997e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0913675  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4683  translation initiation factor IF-3  43.9 
 
 		 166 aa  136  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000101645  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4699  translation initiation factor IF-3  43.9 
 
 		 166 aa  136  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000260309  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0554  translation initiation factor IF-3  43.9 
 
 		 166 aa  136  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000012216  unclonable  2.53125e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4690  translation initiation factor IF-3  43.9 
 
 		 166 aa  136  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.37112e-62 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3261  translation initiation factor IF-3  42.69 
 
 		 195 aa  137  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000125648  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4406  translation initiation factor IF-3  43.9 
 
 		 166 aa  135  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000111711  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2996  translation initiation factor IF-3  45.45 
 
 		 173 aa  135  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0671  translation initiation factor IF-3  44.44 
 
 		 192 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.395911  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1233  translation initiation factor IF-3  44.31 
 
 		 198 aa  135  3.0000000000000003e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000135112  normal  0.0984034 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0044  translation initiation factor IF-3  37.06 
 
 		 173 aa  134  5e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1516  translation initiation factor IF-3  42.42 
 
 		 172 aa  134  6.0000000000000005e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.027432  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1090  hypothetical protein  42.94 
 
 		 179 aa  134  7.000000000000001e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000129093  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15200  translation initiation factor 3  44.31 
 
 		 197 aa  133  9.999999999999999e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000028162  normal  0.0802518 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1383  translation initiation factor IF-3  42.68 
 
 		 187 aa  132  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111233  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0660  translation initiation factor IF-3  41.46 
 
 		 176 aa  133  1.9999999999999998e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000367528  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1434  translation initiation factor IF-3  40.85 
 
 		 225 aa  132  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0842222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1225  translation initiation factor 3  43.64 
 
 		 164 aa  132  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000314962  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2804  translation initiation factor IF-3  41.1 
 
 		 180 aa  131  3.9999999999999996e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4639  translation initiation factor IF-3  40.12 
 
 		 219 aa  131  3.9999999999999996e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000486529  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3163  translation initiation factor IF-3  42.59 
 
 		 252 aa  131  3.9999999999999996e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0170352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1976  translation initiation factor IF-3  41.86 
 
 		 173 aa  130  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1937  translation initiation factor IF-3  41.1 
 
 		 174 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.0464847 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1241  translation initiation factor 3  39.02 
 
 		 170 aa  129  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000256408  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1678  translation initiation factor IF-3  39.02 
 
 		 170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0127847  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1319  translation initiation factor IF-3  43.45 
 
 		 190 aa  129  2.0000000000000002e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0918782  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0475  translation initiation factor IF-3  42.33 
 
 		 253 aa  129  2.0000000000000002e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1311  translation initiation factor IF-3  43.03 
 
 		 164 aa  129  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000644552  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1032  translation initiation factor IF-3  40.24 
 
 		 238 aa  128  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4532  translation initiation factor IF-3  41.98 
 
 		 204 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.199562 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4675  translation initiation factor IF-3  40.85 
 
 		 177 aa  127  6e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.361003  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4551  translation initiation factor IF-3  39.63 
 
 		 221 aa  127  7.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.352825 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0522  translation initiation factor IF-3  43.83 
 
 		 193 aa  127  7.000000000000001e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.0000000692532  hitchhiker  0.000000579185 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2613  translation initiation factor IF-3  39.53 
 
 		 172 aa  127  8.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0154974  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0724  translation initiation factor IF-3  43.4 
 
 		 194 aa  127  9.000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000346718  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2466  translation initiation factor IF-3  42.07 
 
 		 177 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00240261  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1578  translation initiation factor IF-3  41.46 
 
 		 178 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1968  translation initiation factor IF-3  42.07 
 
 		 183 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00361564  hitchhiker  0.00796429 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4267  translation initiation factor IF-3  41.36 
 
 		 178 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0641  translation initiation factor IF-3  41.72 
 
 		 175 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129727 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2038  translation initiation factor IF-3  41.46 
 
 		 177 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.369536 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0488  translation initiation factor IF-3  44.52 
 
 		 184 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.270402  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3480  translation initiation factor IF-3  42.07 
 
 		 183 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0422454  normal  0.0155112 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3224  translation initiation factor IF-3  42.07 
 
 		 183 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.51494 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0766  translation initiation factor IF-3  42.76 
 
 		 181 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2400  translation initiation factor IF-3  40.24 
 
 		 164 aa  125  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00646191  normal  0.390668 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0534  translation initiation factor IF-3  40.26 
 
 		 165 aa  125  3e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000758155  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3158  translation initiation factor IF-3  40.49 
 
 		 173 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3024  translation initiation factor IF-3  38.37 
 
 		 173 aa  124  5e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2172  translation initiation factor IF-3  41.61 
 
 		 154 aa  124  5e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000864988  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1249  translation initiation factor IF-3  37.95 
 
 		 174 aa  124  5e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.246001 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2638  translation initiation factor IF-3  45.34 
 
 		 169 aa  124  7e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.294805  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1316  translation initiation factor IF-3  39.52 
 
 		 351 aa  124  9e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1612  translation initiation factor IF-3  40.49 
 
 		 173 aa  124  9e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252676 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0930  translation initiation factor 3  38.41 
 
 		 178 aa  124  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2853  translation initiation factor IF-3  42.41 
 
 		 174 aa  123  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0116753 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1624  translation initiation factor IF-3  40.49 
 
 		 176 aa  122  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101313 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1906  translation initiation factor IF-3  40.49 
 
 		 173 aa  122  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0069  translation initiation factor IF-3  40.12 
 
 		 171 aa  122  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.097761 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2109  translation initiation factor IF-3  41.46 
 
 		 219 aa  122  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000273336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1149  translation initiation factor IF-3  39.51 
 
 		 202 aa  123  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2666  translation initiation factor IF-3  38.92 
 
 		 176 aa  122  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2459  translation initiation factor 3  39.52 
 
 		 243 aa  122  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0441  translation initiation factor IF-3  40.24 
 
 		 179 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.077533  normal  0.427819 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1204  translation initiation factor IF-3  42.6 
 
 		 171 aa  122  3e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000244125  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01384  translation initiation factor IF-3  41.29 
 
 		 159 aa  122  3e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2242  translation initiation factor IF-3  39.02 
 
 		 166 aa  122  3e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000466118  hitchhiker  0.00531509 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0207  translation initiation factor IF-3  40.49 
 
 		 173 aa  122  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2218  translation initiation factor IF-3  37.65 
 
 		 182 aa  122  3e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000264089  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2769  translation initiation factor IF-3  40.61 
 
 		 178 aa  121  4e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0803  translation initiation factor IF-3  40.74 
 
 		 178 aa  121  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2307  translation initiation factor IF-3  41.72 
 
 		 154 aa  122  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00282878  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2642  translation initiation factor IF-3  40.61 
 
 		 178 aa  121  5e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>