More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0567 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0567  co-chaperonin GroES  100 
 
 
87 aa  174  5e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  7.22404e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0700  co-chaperonin GroES  71.26 
 
 
87 aa  129  1e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0190508  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0309  co-chaperonin GroES  66.67 
 
 
86 aa  117  5e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0556646  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0668  co-chaperonin GroES  64.37 
 
 
86 aa  116  8e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000199289  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1035  co-chaperonin GroES  62.07 
 
 
86 aa  108  3e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.281335  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1355  co-chaperonin GroES  59.77 
 
 
86 aa  107  5e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00428249  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1233  co-chaperonin GroES  59.77 
 
 
86 aa  107  5e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  3.77642e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0510  co-chaperonin GroES  59.77 
 
 
86 aa  107  5e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  1.16909e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0632  co-chaperonin GroES  62.07 
 
 
86 aa  107  5e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  4.49182e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0756  chaperonin Cpn10  56.18 
 
 
88 aa  100  9e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.544888  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2295  chaperonin Cpn10  51.14 
 
 
88 aa  91.3  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2130  chaperonin Cpn10  46.88 
 
 
95 aa  85.9  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  3.18883e-13  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02000  Chaperonin GroES (HSP10)  48.39 
 
 
94 aa  85.1  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0662925  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2494  chaperonin Cpn10  44.19 
 
 
87 aa  83.6  9e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  6.70366e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0453  chaperonin Cpn10  46.32 
 
 
95 aa  81.6  3e-15  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0489  chaperonin Cpn10  43.75 
 
 
100 aa  81.3  4e-15  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  4.58511e-05  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4151  co-chaperonin GroES  46.88 
 
 
96 aa  81.3  5e-15  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0190602  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3027  chaperonin Cpn10  48.42 
 
 
121 aa  80.5  7e-15  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0586  chaperonin Cpn10  45.26 
 
 
95 aa  79.7  1e-14  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.515387  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0549  co-chaperonin GroES  46.32 
 
 
95 aa  79.3  2e-14  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  1.9989e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4586  co-chaperonin GroES  45.26 
 
 
95 aa  79  2e-14  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.480478 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3375  chaperonin Cpn10  47.92 
 
 
95 aa  79.3  2e-14  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0900877 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1076  chaperonin Cpn10  41.67 
 
 
98 aa  78.6  2e-14  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.12184  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1212  chaperonin Cpn10  44.79 
 
 
101 aa  78.6  3e-14  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.694559  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0196  co-chaperonin GroES  45.26 
 
 
98 aa  78.2  4e-14  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0178  co-chaperonin GroES  45.26 
 
 
98 aa  78.2  4e-14  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000749715  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0120  chaperonin Cpn10  45.83 
 
 
96 aa  77.8  5e-14  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427234  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1705  chaperonin, 10 kDa subunit  44.79 
 
 
96 aa  77  8e-14  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1165  chaperonin Cpn10  44.21 
 
 
96 aa  76.6  9e-14  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.731664  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3678  chaperonin Cpn10  40.62 
 
 
100 aa  76.3  1e-13  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00275768  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2920  chaperonin 10 Kd subunit  45.26 
 
 
103 aa  76.6  1e-13  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.907264  normal  0.269903 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0034  chaperonin Cpn10  45.26 
 
 
95 aa  76.3  1e-13  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0295415  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1547  co-chaperonin GroES  46.32 
 
 
95 aa  76.6  1e-13  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.807216  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4130  chaperonin Cpn10  43.75 
 
 
101 aa  76.6  1e-13  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00154355  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2345  co-chaperonin GroES  41.67 
 
 
96 aa  75.5  2e-13  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  2.86758e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2314  co-chaperonin GroES  43.96 
 
 
103 aa  75.5  2e-13  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0230  co-chaperonin GroES  46.24 
 
 
94 aa  75.9  2e-13  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  7.01184e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4306  co-chaperonin GroES  42.71 
 
 
96 aa  75.5  2e-13  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  2.35031e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1282  chaperonin Cpn10  42.71 
 
 
104 aa  75.5  2e-13  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0543961  normal  0.509292 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1909  co-chaperonin GroES  38.54 
 
 
96 aa  75.5  2e-13  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.815751  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2520  chaperone Hsp10, part of GroE chaperone system  45.26 
 
 
95 aa  75.9  2e-13  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.691961  normal  0.971453 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0535  co-chaperonin GroES  43.16 
 
 
96 aa  75.5  2e-13  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.235794  normal  0.722093 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3339  co-chaperonin GroES  45.83 
 
 
95 aa  76.3  2e-13  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.148697  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0286  co-chaperonin GroES  38.54 
 
 
127 aa  75.5  2e-13  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  3.13463e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2778  chaperonin Cpn10  42.71 
 
 
98 aa  75.5  2e-13  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0358  chaperonin Cpn10  45.16 
 
 
98 aa  75.9  2e-13  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3335  chaperonin Cpn10  45.83 
 
 
96 aa  75.1  3e-13  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5581  chaperonin Cpn10  43.16 
 
 
95 aa  75.1  3e-13  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0605  chaperonin Cpn10  43.16 
 
 
95 aa  74.7  3e-13  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.131818 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3660  chaperonin Cpn10  45.83 
 
 
96 aa  75.1  3e-13  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.39196  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0794  co-chaperonin GroES  45.83 
 
 
95 aa  74.7  3e-13  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0142401 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3096  chaperonin Cpn10  44.21 
 
 
104 aa  75.1  3e-13  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0543  co-chaperonin GroES  43.75 
 
 
96 aa  75.1  3e-13  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00172283  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0699  co-chaperonin GroES  43.75 
 
 
96 aa  75.1  3e-13  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  1.27096e-08  unclonable  2.92135e-11 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5366  chaperonin Cpn10  43.75 
 
 
95 aa  75.1  3e-13  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.583884  normal  0.676466 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0092  co-chaperonin GroES  42.27 
 
 
96 aa  75.1  3e-13  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  2.41636e-06  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4265  chaperonin Cpn10  43.75 
 
 
104 aa  74.7  3e-13  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.228969  normal  0.0528982 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1770  chaperonin Cpn10  44.79 
 
 
95 aa  75.5  3e-13  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0933044  normal  0.173989 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2504  co-chaperonin GroES  42.71 
 
 
104 aa  75.5  3e-13  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2190  co-chaperonin GroES  43.16 
 
 
95 aa  74.7  4e-13  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0984  co-chaperonin GroES  43.16 
 
 
95 aa  74.7  4e-13  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3714  co-chaperonin GroES  42.55 
 
 
97 aa  74.7  4e-13  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.31168 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1844  co-chaperonin GroES  47.78 
 
 
91 aa  74.7  4e-13  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.986067  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0723  co-chaperonin GroES  40.62 
 
 
96 aa  74.7  4e-13  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2228  co-chaperonin GroES  44.21 
 
 
105 aa  74.7  4e-13  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.145562  normal  0.505926 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3233  co-chaperonin GroES  44.21 
 
 
105 aa  74.7  4e-13  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.211647  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0958  co-chaperonin GroES  40.62 
 
 
96 aa  74.7  4e-13  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2573  co-chaperonin GroES  44.21 
 
 
98 aa  74.7  4e-13  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.320362  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0438  co-chaperonin GroES  40.62 
 
 
96 aa  74.7  4e-13  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  7.05596e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0521  co-chaperonin GroES  46.67 
 
 
89 aa  74.7  4e-13  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.125145 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1109  co-chaperonin GroES  42.55 
 
 
94 aa  74.7  4e-13  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2310  co-chaperonin GroES  43.16 
 
 
95 aa  74.7  4e-13  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0742  co-chaperonin GroES  40.62 
 
 
96 aa  74.7  4e-13  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5464  co-chaperonin GroES  44.21 
 
 
104 aa  74.3  5e-13  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.835161  normal  0.183317 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2458  co-chaperonin GroES  44.21 
 
 
104 aa  74.3  5e-13  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1485  co-chaperonin GroES  43.62 
 
 
94 aa  74.3  6e-13  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00014757  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4783  co-chaperonin GroES  43.16 
 
 
96 aa  74.3  6e-13  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0265575  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0674  chaperonin Cpn10  43.16 
 
 
95 aa  73.9  6e-13  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248436  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5250  co-chaperonin GroES  43.16 
 
 
96 aa  74.3  6e-13  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.584342  normal  0.464773 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1173  co-chaperonin GroES  41.49 
 
 
98 aa  73.9  6e-13  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.749354  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0611  Chaperonin Cpn10  44.09 
 
 
98 aa  73.9  6e-13  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.740191  normal  0.337946 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5848  chaperonin Cpn10  39.58 
 
 
104 aa  73.9  6e-13  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134005  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5326  co-chaperonin GroES  43.16 
 
 
96 aa  74.3  6e-13  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.769005  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0028  co-chaperonin GroES  45.83 
 
 
95 aa  74.3  6e-13  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  6.32588e-17  normal  0.625386 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3359  co-chaperonin GroES  43.16 
 
 
95 aa  73.9  7e-13  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.755845  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2031  co-chaperonin GroES  39.58 
 
 
95 aa  73.6  9e-13  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.133549  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3593  co-chaperonin GroES  42.55 
 
 
97 aa  73.2  1e-12  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3660  co-chaperonin GroES  42.55 
 
 
97 aa  73.2  1e-12  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0336408  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1919  chaperonin Cpn10  45.26 
 
 
100 aa  72.8  1e-12  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3734  co-chaperonin GroES  42.55 
 
 
97 aa  73.2  1e-12  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.619596  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0251  co-chaperonin GroES  44.09 
 
 
94 aa  73.2  1e-12  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000150313  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1768  chaperonin Cpn10  43.16 
 
 
95 aa  73.2  1e-12  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.939398  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2078  chaperonin Cpn10  40.62 
 
 
104 aa  73.2  1e-12  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.354886  normal  0.301492 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1737  co-chaperonin GroES  43.16 
 
 
95 aa  73.2  1e-12  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.168742  hitchhiker  0.00175489 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2523  chaperonin Cpn10  41.05 
 
 
104 aa  72.8  1e-12  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0316  chaperonin Cpn10  46.67 
 
 
92 aa  72.8  1e-12  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0011552  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2191  co-chaperonin GroES  42.11 
 
 
105 aa  72.8  1e-12  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0740  co-chaperonin GroES  41.05 
 
 
95 aa  72.8  1e-12  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3033  co-chaperonin GroES  45.26 
 
 
104 aa  72.8  1e-12  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.960902  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5039  chaperonin Cpn10  40.62 
 
 
104 aa  73.2  1e-12  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.747065  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>