More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0566 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0566  transcription regulator protein  100 
 
 
207 aa  414  1e-115  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  4.11686e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0120  transcription regulator protein  38.35 
 
 
209 aa  133  2e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1551  transcription regulator protein  35.82 
 
 
205 aa  125  4e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  2.00418e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1589  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 
210 aa  103  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0417  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 
210 aa  102  5e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.582738  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0391  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 
210 aa  99.4  3e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.914065  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1558  transcriptional regulator, TetR family  31.19 
 
 
208 aa  92.8  3e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1641  transcriptional regulator, TetR family protein  34.51 
 
 
145 aa  88.2  8e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.216203  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  26.87 
 
 
207 aa  76.6  2e-13  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  28.37 
 
 
208 aa  76.3  3e-13  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1544  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 
219 aa  75.5  5e-13  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  31.71 
 
 
213 aa  75.1  7e-13  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  35.2 
 
 
205 aa  74.3  1e-12  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  30.89 
 
 
213 aa  72.4  5e-12  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 
210 aa  71.6  8e-12  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0743  TetR family transcriptional regulator  26.51 
 
 
216 aa  71.2  1e-11  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  30.3 
 
 
219 aa  68.9  4e-11  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 
209 aa  68.2  8e-11  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3994  TetR family transcriptional regulator  24.26 
 
 
225 aa  68.2  9e-11  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003358  transcriptional regulator  29.85 
 
 
251 aa  68.2  9e-11  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.433364  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2443  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 
237 aa  67  2e-10  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0506357 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1443  transcriptional regulator, TetR family  29.85 
 
 
204 aa  67  2e-10  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79888  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  25.71 
 
 
224 aa  66.6  2e-10  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  34.55 
 
 
207 aa  66.2  3e-10  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1019  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 
200 aa  65.9  4e-10  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 
207 aa  66.2  4e-10  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  27.87 
 
 
220 aa  65.5  5e-10  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0406  transcriptional regulator, TetR family  23.31 
 
 
206 aa  65.1  6e-10  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0181245  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 
220 aa  65.1  7e-10  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  30.84 
 
 
211 aa  65.1  7e-10  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 
214 aa  64.7  8e-10  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  25.37 
 
 
225 aa  64.7  9e-10  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0747  TetR family transcriptional regulator  26 
 
 
206 aa  64.7  9e-10  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  26.72 
 
 
230 aa  64.3  1e-09  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  27.87 
 
 
220 aa  64.3  1e-09  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 
217 aa  63.5  2e-09  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8100  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 
218 aa  63.5  2e-09  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978856  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1167  regulatory protein TetR  31.86 
 
 
220 aa  63.9  2e-09  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  2.01787e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0097  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
207 aa  62  6e-09  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00902  transcription regulator protein  26.27 
 
 
209 aa  62  6e-09  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.603909 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  25.68 
 
 
218 aa  61.6  8e-09  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4201  hypothetical protein  30.51 
 
 
201 aa  61.6  9e-09  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1650  TetR family transcriptional regulator  25.59 
 
 
196 aa  61.2  9e-09  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00305011  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 
213 aa  60.8  1e-08  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0705  regulatory protein, TetR  31.15 
 
 
211 aa  60.8  1e-08  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 
210 aa  61.2  1e-08  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  22.49 
 
 
208 aa  60.5  2e-08  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  22.49 
 
 
216 aa  60.1  2e-08  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
244 aa  60.1  2e-08  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  22.49 
 
 
216 aa  60.5  2e-08  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  26.55 
 
 
222 aa  60.5  2e-08  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  22.97 
 
 
212 aa  60.1  3e-08  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  29.37 
 
 
202 aa  59.3  4e-08  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  22.49 
 
 
216 aa  59.3  4e-08  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 
205 aa  59.3  4e-08  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
210 aa  59.3  4e-08  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 
217 aa  58.9  5e-08  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1767  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 
209 aa  58.9  6e-08  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.271955  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2672  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
208 aa  58.9  6e-08  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 
234 aa  58.5  6e-08  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1138  TetR family transcriptional regulator  25.62 
 
 
228 aa  58.5  7e-08  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  29.93 
 
 
226 aa  58.5  7e-08  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  29.93 
 
 
226 aa  58.5  7e-08  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 
266 aa  58.2  8e-08  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3682  TetR family transcriptional regulator  22.9 
 
 
540 aa  58.2  8e-08  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0191871  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1609  TetR family transcriptional regulator  22.86 
 
 
224 aa  57.4  1e-07  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000193721 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 
273 aa  57.4  1e-07  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1447  TetR family transcriptional regulator  29.36 
 
 
214 aa  57.4  1e-07  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.268108  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 
211 aa  57.4  2e-07  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  22.28 
 
 
200 aa  56.6  2e-07  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
125 aa  57  2e-07  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  7.72402e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  22.28 
 
 
200 aa  56.6  2e-07  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  24.66 
 
 
210 aa  56.2  3e-07  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 
221 aa  56.2  3e-07  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5073  transcriptional regulator TetR family  26.72 
 
 
227 aa  56.2  3e-07  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.479761  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2027  TetR family transcriptional regulator  25.45 
 
 
208 aa  56.6  3e-07  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  25.47 
 
 
257 aa  56.6  3e-07  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  38.81 
 
 
247 aa  56.2  3e-07  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  38.81 
 
 
255 aa  56.2  3e-07  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0123  transcriptional regulator, TetR family  27.73 
 
 
224 aa  56.6  3e-07  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 
209 aa  56.6  3e-07  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 
214 aa  56.6  3e-07  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5288  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 
186 aa  55.8  4e-07  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  24.68 
 
 
208 aa  55.8  4e-07  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
216 aa  55.8  4e-07  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  23.42 
 
 
206 aa  55.8  4e-07  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 
212 aa  56.2  4e-07  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 
220 aa  56.2  4e-07  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 
212 aa  55.5  5e-07  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  23.22 
 
 
207 aa  55.5  5e-07  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 
243 aa  55.5  5e-07  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3277  TetR family transcriptional regulator  21.29 
 
 
188 aa  55.5  5e-07  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  38.81 
 
 
264 aa  55.5  5e-07  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  21.92 
 
 
228 aa  55.5  5e-07  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  26.61 
 
 
243 aa  55.5  6e-07  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  20.47 
 
 
206 aa  55.5  6e-07  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0024  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 
212 aa  55.5  6e-07  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 
212 aa  55.5  6e-07  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  20.94 
 
 
207 aa  55.1  6e-07  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 
212 aa  55.5  6e-07  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>