More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0566 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0566  transcription regulator protein  100 
 
 		 207 aa  414  9.999999999999999e-116  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.000000411686  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0120  transcription regulator protein  38.35 
 
 		 209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1551  transcription regulator protein  35.82 
 
 		 205 aa  125  4.0000000000000003e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000200418  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1589  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0417  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 210 aa  102  5e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.582738  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0391  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 210 aa  99.4  3e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.914065  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1558  transcriptional regulator, TetR family  31.19 
 
 		 208 aa  92.8  3e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1641  transcriptional regulator, TetR family protein  34.51 
 
 		 145 aa  88.2  8e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.216203  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  26.87 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 208 aa  76.3  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1544  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 219 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  31.71 
 
 		 213 aa  75.1  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  35.2 
 
 		 205 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  30.89 
 
 		 213 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 210 aa  71.6  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0743  TetR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 216 aa  71.2  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  30.3 
 
 		 219 aa  68.9  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 209 aa  68.2  0.00000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003358  transcriptional regulator  29.85 
 
 		 251 aa  68.2  0.00000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.433364  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3994  TetR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 225 aa  68.2  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2443  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 237 aa  67  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0506357 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  25.71 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1443  transcriptional regulator, TetR family  29.85 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79888  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  34.55 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1019  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  27.87 
 
 		 220 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0406  transcriptional regulator, TetR family  23.31 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0181245  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 		 220 aa  65.1  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  30.84 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 214 aa  64.7  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0747  TetR family transcriptional regulator  26 
 
 		 206 aa  64.7  0.0000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 225 aa  64.7  0.0000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  27.87 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  26.72 
 
 		 230 aa  64.3  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8100  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978856  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1167  regulatory protein TetR  31.86 
 
 		 220 aa  63.9  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000201787  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00902  transcription regulator protein  26.27 
 
 		 209 aa  62  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.603909 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0097  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 207 aa  62  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  25.68 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1650  TetR family transcriptional regulator  25.59 
 
 		 196 aa  61.2  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00305011  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4201  hypothetical protein  30.51 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0705  regulatory protein, TetR  31.15 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  26.55 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 244 aa  60.1  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  22.49 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  22.49 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  22.49 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  22.97 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  22.49 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1767  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.271955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2672  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1138  TetR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 228 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  29.93 
 
 		 226 aa  58.5  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  29.93 
 
 		 226 aa  58.5  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3682  TetR family transcriptional regulator  22.9 
 
 		 540 aa  58.2  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0191871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 266 aa  58.2  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1609  TetR family transcriptional regulator  22.86 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193721 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1447  TetR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.268108  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 125 aa  57  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  22.28 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  22.28 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  38.81 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5073  transcriptional regulator TetR family  26.72 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.479761  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  38.81 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 257 aa  56.6  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2027  TetR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0123  transcriptional regulator, TetR family  27.73 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5288  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  23.42 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  38.81 
 
 		 264 aa  55.5  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3277  TetR family transcriptional regulator  21.29 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  21.92 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  23.22 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0024  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  20.47 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  26.61 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  20.94 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>