More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0564 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A0390  hypothetical protein  38.17 
 
 
1055 aa  723  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  2.97308e-08 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3092  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  40.18 
 
 
1056 aa  748  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.185291  normal  0.0905875 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2449  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  40.06 
 
 
1063 aa  745  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0901  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  38.48 
 
 
1062 aa  734  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.629732  normal  0.563916 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0827  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  39.85 
 
 
1055 aa  777  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2528  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  39.53 
 
 
1066 aa  721  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.149577 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3713  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  38.92 
 
 
1058 aa  748  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.135226 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0931  multidrug-efflux transporter  40.04 
 
 
1055 aa  781  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1563  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  39.09 
 
 
1061 aa  748  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0482838  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2637  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  39.16 
 
 
1066 aa  720  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1357  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  40.95 
 
 
1040 aa  802  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000452964 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0132  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  38.3 
 
 
1045 aa  753  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.14672  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4788  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  38.28 
 
 
1062 aa  735  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.654766 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2938  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  40.18 
 
 
1041 aa  733  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.585633  normal  0.0317577 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2447  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  40.7 
 
 
1059 aa  766  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1025  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  40.57 
 
 
1050 aa  779  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.406583 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3817  multidrug resistance protein MdtF  40.37 
 
 
1037 aa  749  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0885908 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0479  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  38.68 
 
 
1064 aa  747  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.981936  normal  0.0489217 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0648  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.34 
 
 
1089 aa  823  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4635  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  39.21 
 
 
1061 aa  722  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.730926  normal  0.35721 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3467  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  38.71 
 
 
1040 aa  732  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.379499  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2608  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  38.53 
 
 
1057 aa  746  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.373387  normal  0.321065 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4426  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  39.96 
 
 
1050 aa  748  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3428  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  38.79 
 
 
1076 aa  723  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3305  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  38.43 
 
 
1046 aa  764  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3434  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  36.27 
 
 
1055 aa  720  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0847845  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1392  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  43.87 
 
 
1049 aa  852  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5127  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  39.44 
 
 
1043 aa  744  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.20146  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00482  AcrB protein  39.07 
 
 
1056 aa  748  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.746584  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3746  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  40.12 
 
 
1050 aa  761  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.756771  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3257  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  38.84 
 
 
1073 aa  749  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.662335  normal  0.89676 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6991  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  38.29 
 
 
1064 aa  749  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.699098  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4149  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  43.15 
 
 
1055 aa  867  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3912  multidrug resistance protein MdtF  40.27 
 
 
1037 aa  744  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.149985  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0394  acriflavine resistance protein B  40.08 
 
 
1049 aa  752  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5504  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.34 
 
 
1089 aa  823  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.170679  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2616  aminoglycoside/multidrug efflux system  39.81 
 
 
1037 aa  781  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.935344  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0505  acriflavine resistance protein B  40.08 
 
 
1049 aa  752  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3154  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  40.08 
 
 
1049 aa  752  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2193  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  38.36 
 
 
1044 aa  737  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.778616  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1151  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  40.06 
 
 
1043 aa  790  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3700  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  40.74 
 
 
1033 aa  752  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1126  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  40.18 
 
 
1048 aa  746  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  6.46715e-06  unclonable  4.81916e-08 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2284  acriflavin resistance protein  39.24 
 
 
1055 aa  734  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00646069 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1256  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  40.04 
 
 
1038 aa  789  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.393229  normal  0.26342 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0153  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  38.05 
 
 
1050 aa  726  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1639  multidrug resistance protein MdtF  56.7 
 
 
1041 aa  1214  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0267869  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4000  multidrug resistance protein MdtF  40.37 
 
 
1037 aa  747  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3751  acriflavine resistance protein F  39.82 
 
 
1034 aa  741  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0990355  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2749  aminoglycoside/multidrug efflux system  40 
 
 
1037 aa  784  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.927319  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0496  acriflavine resistance protein B  40.08 
 
 
1049 aa  752  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3716  multidrug resistance protein MdtF  40.27 
 
 
1037 aa  745  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00687785  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3459  acriflavine resistance protein F  39.94 
 
 
1034 aa  742  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0766453  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2599  aminoglycoside/multidrug efflux system  39.9 
 
 
1037 aa  783  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0538  acriflavine resistance protein B  40.08 
 
 
1049 aa  752  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4060  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  37.66 
 
 
1052 aa  727  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00709591  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4384  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  38.48 
 
 
1044 aa  749  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0500  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  38.74 
 
 
1051 aa  726  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1207  aminoglycoside/multidrug efflux system  40 
 
 
1037 aa  784  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0440  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  39.84 
 
 
1034 aa  740  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.875483 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0203  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  40.27 
 
 
1037 aa  745  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.115131 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3208  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  40.78 
 
 
1050 aa  747  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.10162  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1382  aminoglycoside/multidrug efflux system  39.67 
 
 
1043 aa  766  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4026  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  40.04 
 
 
1049 aa  754  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.40035  normal  0.354384 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1336  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  39.22 
 
 
1047 aa  751  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1087  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  39.56 
 
 
1059 aa  721  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4428  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  40.32 
 
 
1050 aa  771  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.391889  normal  0.149359 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2510  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.63 
 
 
1059 aa  771  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.307051  normal  0.508426 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2481  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  40.04 
 
 
1042 aa  728  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.107947  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1139  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  39.37 
 
 
1063 aa  750  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2879  multidrug efflux protein  40.78 
 
 
1050 aa  747  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.985137 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2796  aminoglycoside/multidrug efflux system  39.67 
 
 
1085 aa  766  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.174051  normal  0.16394 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0689  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  40.27 
 
 
1066 aa  734  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181022  normal  0.681508 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5741  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  37.38 
 
 
1046 aa  722  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.194313  normal  0.0197837 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01756  hypothetical protein  38.98 
 
 
1053 aa  731  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2886  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  40.48 
 
 
1065 aa  808  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.418369  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00418  hypothetical protein  40.08 
 
 
1049 aa  752  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2511  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  38.11 
 
 
1052 aa  734  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1010  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  40.43 
 
 
1047 aa  735  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.407288  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3423  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  40.02 
 
 
1050 aa  760  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3809  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  38.68 
 
 
1056 aa  755  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0639553  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3366  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  37.75 
 
 
1062 aa  728  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0201859 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2200  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  39.19 
 
 
1050 aa  745  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.139566 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4832  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  38.61 
 
 
1054 aa  723  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.921314  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2563  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  40.04 
 
 
1091 aa  745  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0179005  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51560  multidrug efflux pump RND-family transporter protein  36.32 
 
 
1046 aa  722  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.793904  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44060  multidrug efflux pump HAE1-family transporter protein  43.24 
 
 
1069 aa  868  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.447353  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33870  Multidrug efflux RND transporter MexF  39.83 
 
 
1057 aa  755  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01890  Hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  39.58 
 
 
1046 aa  764  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1560  RND efflux system, inner membrane transporter CmeB  57.7 
 
 
1040 aa  1214  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1153  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  38.11 
 
 
1058 aa  723  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0328718  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0942  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  39.44 
 
 
1077 aa  748  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.26246  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02323  hypothetical protein  40 
 
 
1037 aa  784  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03075  hypothetical protein  39.84 
 
 
1034 aa  741  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03315  hypothetical protein  40.27 
 
 
1037 aa  745  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1920  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  45.91 
 
 
1044 aa  895  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0960887  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1621  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  43.31 
 
 
1048 aa  830  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.557587  normal  0.228387 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1165  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  55.14 
 
 
1042 aa  1137  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  2.32541e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001386  cation/multidrug efflux pump  39.96 
 
 
1027 aa  791  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000503  inner membrane efflux transporter of RND family multidrug efflux pump  39.27 
 
 
972 aa  721  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>