More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0529 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0529  sensor histidine kinase  100 
 
 
388 aa  761    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0841  sensor histidine kinase  40.87 
 
 
374 aa  275  8e-73  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0909327  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0137  sensor histidine kinase  42.71 
 
 
375 aa  262  8.999999999999999e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1279  sensor histidine kinase  34.61 
 
 
388 aa  195  1e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00018737  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1357  sensor histidine kinase  32.49 
 
 
396 aa  186  4e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1325  hypothetical protein  34.76 
 
 
389 aa  183  5.0000000000000004e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.219372  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1235  sensor histidine kinase  39.06 
 
 
353 aa  182  7e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000222357  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1366  histidine kinase  36.6 
 
 
371 aa  167  2e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0489187  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1102  two-component sensor histidine kinase  41.54 
 
 
407 aa  166  5e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.588024  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0127  two-component sensor histidine kinase  38.87 
 
 
435 aa  159  1e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.202899  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0885  histidine kinase  33.33 
 
 
331 aa  155  1e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.096312  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0096  ATP-binding region ATPase domain protein  37.83 
 
 
395 aa  152  1e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0259  histidine kinase  34.54 
 
 
389 aa  116  7.999999999999999e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0156401  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1580  ATP-binding region ATPase domain protein  33.97 
 
 
497 aa  105  1e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0273  ATP-binding region ATPase domain protein  32.93 
 
 
393 aa  104  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0256  ATP-binding region ATPase domain protein  34.29 
 
 
379 aa  104  3e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0527  histidine kinase  26.07 
 
 
425 aa  101  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1918  putative two-component sensor  27.65 
 
 
372 aa  100  4e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1476  domain of unknown function DUF1745  36.15 
 
 
629 aa  99.8  7e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.153758  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1459  histidine kinase  35.55 
 
 
405 aa  99.8  7e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.855537  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0534  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.73 
 
 
405 aa  96.7  6e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.132719  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0520  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.73 
 
 
405 aa  96.3  8e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.103033  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0385  putative two-component sensor  27.53 
 
 
368 aa  95.1  2e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4086  histidine kinase  22.7 
 
 
412 aa  94.7  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.3591 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5017  histidine kinase  27.71 
 
 
427 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1415  histidine kinase  22.63 
 
 
430 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1444  histidine kinase  22.63 
 
 
430 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0737  histidine kinase  24.69 
 
 
455 aa  90.9  3e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00375027  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8878  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  22.48 
 
 
460 aa  89.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.575508  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1774  histidine kinase  31.12 
 
 
290 aa  88.2  2e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0626  histidine kinase  28.44 
 
 
256 aa  88.2  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.657871  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.94 
 
 
495 aa  88.6  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0692  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.08 
 
 
419 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.640091 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4629  histidine kinase  20.7 
 
 
443 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000316217 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1394  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.78 
 
 
447 aa  87.4  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.335601  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 
500 aa  86.3  9e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463081  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0121  ATP-binding region ATPase domain protein  27.63 
 
 
281 aa  84.7  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2302  histidine kinase  27.11 
 
 
408 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000110141  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0416  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.83 
 
 
377 aa  83.6  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.611617 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1288  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.74 
 
 
525 aa  82.8  0.000000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.62366  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1741  histidine kinase  32.09 
 
 
356 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000297787  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.78 
 
 
482 aa  82.4  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1817  sensor histidine kinase  29.67 
 
 
351 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1956  sensor histidine kinase  29.67 
 
 
351 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1773  sensor histidine kinase  29.55 
 
 
347 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3065  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  25.66 
 
 
1128 aa  81.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1478  histidine kinase  28.95 
 
 
270 aa  81.6  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000106668  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13150  histidine kinase  23.36 
 
 
436 aa  81.3  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3062  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.98 
 
 
458 aa  82  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1492  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.23 
 
 
624 aa  81.6  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.411872  decreased coverage  0.00494446 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2063  sensor histidine kinase  30 
 
 
357 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000411382  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1791  sensor histidine kinase  29.67 
 
 
351 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0358387  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3320  histidine kinase  26.11 
 
 
1128 aa  81.3  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.515444 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.82 
 
 
614 aa  81.3  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1893  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.1 
 
 
644 aa  80.9  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2731  twp-component sensor histidine kinase  30.19 
 
 
422 aa  80.5  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3275  histidine kinase  24.77 
 
 
487 aa  80.1  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27524  normal  0.179403 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3365  sensor histidine kinase  28.9 
 
 
357 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.17571  hitchhiker  0.0000000000000135665 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3282  histidine kinase  23.35 
 
 
483 aa  79.7  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5313  histidine kinase  28.57 
 
 
710 aa  79.7  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0905538 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1513  histidine kinase  26.77 
 
 
317 aa  80.1  0.00000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1562  histidine kinase  26.77 
 
 
317 aa  80.1  0.00000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49440  sensory histidine protein kinase TctE  20.17 
 
 
474 aa  80.1  0.00000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0032  histidine kinase  26.87 
 
 
423 aa  80.1  0.00000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1524  Signal transduction histidine kinase  30.24 
 
 
517 aa  80.1  0.00000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.13171  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4223  histidine kinase  18.59 
 
 
436 aa  79.7  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1993  sensor histidine kinase  28.44 
 
 
253 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.237870000000001e-44 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0323  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.14 
 
 
706 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.976803  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6289  histidine kinase  24.34 
 
 
463 aa  79.3  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0135333  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0836  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  28.04 
 
 
599 aa  79  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.342989  normal  0.397263 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0875  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.56 
 
 
548 aa  79.3  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00314  sensory histidine kinase in two-component region  25.32 
 
 
468 aa  79  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3924  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.7 
 
 
436 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0800  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.39 
 
 
403 aa  79  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2225  histidine kinase  27.4 
 
 
845 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0086849  normal  0.197777 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1535  phosphate regulon two-component sensor kinase transcription regulator protein  26.15 
 
 
443 aa  79  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.591465  normal  0.777366 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0186  histidine kinase  27.27 
 
 
810 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2610  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  25.12 
 
 
421 aa  78.2  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.69998 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1212  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.94 
 
 
457 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2163  histidine kinase  27.4 
 
 
845 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1424  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.27 
 
 
1152 aa  78.2  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.68675 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1809  Signal transduction histidine kinase  27.05 
 
 
432 aa  78.2  0.0000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000615791  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3341  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.92 
 
 
365 aa  78.2  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.049327 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1282  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.57 
 
 
548 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.153514  normal  0.0403413 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04658  two-component system sensor protein  25.12 
 
 
405 aa  78.6  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0314695  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0505  Signal transduction histidine kinase  21.34 
 
 
417 aa  77.8  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.611545 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2207  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.44 
 
 
760 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.166244 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  27.83 
 
 
452 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1734  Signal transduction histidine kinase  27.56 
 
 
381 aa  77.8  0.0000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01700  signal transduction histidine kinase  21.2 
 
 
492 aa  77.4  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.560312  normal  0.659062 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0538  histidine kinase  27.27 
 
 
336 aa  77.4  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000789394  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2042  sensor histidine kinase  29.44 
 
 
351 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.711965  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4230  sensor histidine kinase TctE  20.5 
 
 
460 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2684  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.95 
 
 
645 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4262  histidine kinase  18.35 
 
 
436 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0130026 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0059  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.43 
 
 
415 aa  77.4  0.0000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000404489  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0681  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  20.96 
 
 
448 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.953793  normal  0.661096 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3180  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.84 
 
 
455 aa  77.4  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0372  histidine kinase  19.48 
 
 
432 aa  77  0.0000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.623288  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3306  sensor histidine kinase  27.18 
 
 
1171 aa  77  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>