More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0512 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0512  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
215 aa  423  1e-117  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1315  ABC transporter-related protein  52.91 
 
 
222 aa  205  4e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.26423  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1841  ABC transporter related  45.07 
 
 
224 aa  204  7e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0297689  normal  0.0173978 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2817  ABC transporter related  44.91 
 
 
247 aa  196  2.0000000000000003e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2172  ABC transporter related protein  46.54 
 
 
222 aa  193  2e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00192331  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0441  ABC transporter, ATPase subunit  39.27 
 
 
228 aa  190  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.123309  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0681  ABC transporter related  44.44 
 
 
232 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1261  ABC transporter, ATP-binding protein  43.19 
 
 
227 aa  189  4e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0475  ABC transporter-related protein  38.89 
 
 
228 aa  187  1e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.761135  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3639  ABC transporter related  42.13 
 
 
228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0694  ABC transporter related protein  45.54 
 
 
225 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0470  ABC transporter related  38.43 
 
 
228 aa  181  8.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3589  ABC transporter related protein  41.67 
 
 
228 aa  180  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1881  (3R)-hydroxymyristoyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase ((3R)-hydroxymyristoyl ACP dehydrase)  45.66 
 
 
222 aa  178  7e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.398507  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1471  ABC transporter related  41.3 
 
 
242 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.51412  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3212  cyclic nucleotide-binding protein  41.58 
 
 
388 aa  171  6.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2710  cyclic nucleotide-binding protein  40.59 
 
 
388 aa  166  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2384  ABC transporter ATP-binding protein  43.87 
 
 
228 aa  164  8e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0127106  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1867  ABC transporter, ATPase subunit  41.67 
 
 
408 aa  163  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  42.5 
 
 
227 aa  162  4.0000000000000004e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1995  ABC transporter related protein  41.74 
 
 
229 aa  161  6e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.691117  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  43.5 
 
 
228 aa  161  6e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1468  ABC transporter related  43.78 
 
 
233 aa  160  9e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.377952  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0478  ABC transporter related protein  41.79 
 
 
220 aa  159  3e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1004  ABC transporter related  40.49 
 
 
234 aa  158  6e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.664588  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  45 
 
 
230 aa  157  1e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2431  ABC transporter related  39.27 
 
 
246 aa  156  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000823093  decreased coverage  0.000192607 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5546  ABC transporter related  40.74 
 
 
224 aa  156  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.361355  hitchhiker  0.00000572537 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  42.23 
 
 
642 aa  156  2e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3220  ABC transporter related  39.32 
 
 
235 aa  156  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000135458  normal  0.0828287 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  42 
 
 
229 aa  155  4e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2196  ABC transporter related  41.59 
 
 
230 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.439888  normal  0.425297 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  38.73 
 
 
247 aa  155  6e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2644  ABC transporter, ATP-binding protein  42.38 
 
 
230 aa  154  7e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05403  ABC transporter ATPase subunit  38.21 
 
 
237 aa  154  8e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3166  ABC transporter related protein  40.91 
 
 
240 aa  154  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.240946  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1717  ABC transporter related  37.79 
 
 
248 aa  154  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4701  ABC transporter, ATP-binding protein  39.11 
 
 
230 aa  153  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.91334  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2658  ABC transporter-related protein  37.38 
 
 
227 aa  153  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5642  ABC transporter related protein  40.28 
 
 
230 aa  153  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.109368 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  41.29 
 
 
231 aa  153  2e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0791  ABC transporter, ATP-binding protein  39.91 
 
 
220 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.271834 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8051  ABC transporter-related protein  35.15 
 
 
235 aa  152  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260355  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0529  ABC transport protein  41.79 
 
 
220 aa  152  4e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.476252  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1614  ABC transporter related  38.31 
 
 
244 aa  152  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185933  normal  0.045401 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3044  ABC transporter related  37.9 
 
 
239 aa  152  5e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2078  ABC transporter related  41 
 
 
227 aa  152  5e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.106777  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0437  ABC transporter related protein  38.92 
 
 
229 aa  152  5e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  43.56 
 
 
222 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0269  ABC-type transport system, ATP-binding component  37.62 
 
 
227 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  41.01 
 
 
242 aa  151  7e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1760  ABC transporter related  41.15 
 
 
250 aa  151  8.999999999999999e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  37.74 
 
 
234 aa  151  8.999999999999999e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  41.26 
 
 
642 aa  151  8.999999999999999e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  37.74 
 
 
234 aa  151  8.999999999999999e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1100  ABC transporter related  40.45 
 
 
235 aa  151  8.999999999999999e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1176  ABC transporter related  39.55 
 
 
235 aa  150  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000377551 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0487  ABC transporter related protein  39.42 
 
 
231 aa  150  1e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2147  ABC transporter related  40.1 
 
 
252 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.852094 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0493  ABC transporter related  39.02 
 
 
259 aa  150  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1252  ABC transporter related  41.5 
 
 
234 aa  150  2e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.252759 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2019  ABC transporter related protein  38.76 
 
 
228 aa  150  2e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0275435  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3273  ABC transporter, ATP-binding protein  42.03 
 
 
223 aa  149  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.942342  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4405  ABC transporter related  36 
 
 
224 aa  150  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00499909  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3267  ABC transporter, ATP-binding protein  41.55 
 
 
223 aa  149  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194795  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0681  ABC transporter related  37.81 
 
 
283 aa  149  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0103  ABC transporter related  39.13 
 
 
230 aa  149  3e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2216  ABC transporter related  39.02 
 
 
228 aa  149  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0456  ABC transporter related  38.92 
 
 
229 aa  149  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3711  ABC transporter related  37.13 
 
 
235 aa  149  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.587902 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0165  heme exporter protein CcmA  38.43 
 
 
221 aa  149  3e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0101  ABC transporter, ATP-binding protein  39.13 
 
 
230 aa  149  3e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3314  ABC transporter related protein  42.4 
 
 
643 aa  149  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  36.87 
 
 
255 aa  149  3e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29510  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  39.71 
 
 
250 aa  149  4e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3243  ABC transporter, ATP-binding protein  41.55 
 
 
223 aa  149  4e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0194  hypothetical protein  39.6 
 
 
226 aa  149  4e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000219285  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3022  ABC transporter ATP-binding protein  42.03 
 
 
223 aa  148  5e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.191779  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3007  ABC transporter, ATP-binding protein  42.03 
 
 
223 aa  148  5e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3012  ABC transporter, ATP-binding protein  42.23 
 
 
319 aa  148  5e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.331598  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3255  ABC transporter ATP-binding protein  42.03 
 
 
223 aa  148  5e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.676269  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0697  ABC transporter related  36.59 
 
 
232 aa  149  5e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10839 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2004  ABC transporter, ATP-binding protein  41.55 
 
 
223 aa  148  5e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.476728  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2430  hypothetical protein  41.04 
 
 
345 aa  148  5e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0121441  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  37.02 
 
 
653 aa  148  5e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  37.38 
 
 
238 aa  148  6e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0253  ABC transporter related  38.1 
 
 
229 aa  148  6e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.588254 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3253  ABC transporter, ATP-binding protein  42.03 
 
 
223 aa  148  6e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  40.48 
 
 
235 aa  148  6e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7810  ABC transporter related  38.24 
 
 
261 aa  148  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1654  ABC transporter, ATP-binding protein  42.5 
 
 
216 aa  148  6e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4474  ABC transporter related  40.43 
 
 
227 aa  148  7e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1835  ABC transporter, ATP-binding protein  42.5 
 
 
217 aa  148  7e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.131138  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2055  ABC transporter related  36.63 
 
 
222 aa  148  7e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000459409 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0083  ABC transporter related  37.13 
 
 
228 aa  147  8e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3195  putative ABC transporter, ATP-binding protein  37.85 
 
 
227 aa  148  8e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1165  ABC transporter, ATP-binding protein  41.21 
 
 
218 aa  148  8e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2017  ABC transporter related  39.8 
 
 
234 aa  147  9e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000531605 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2375  ABC-type transport system, ATPase component  37.61 
 
 
229 aa  147  9e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000797432  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2412  cell division ATP-binding protein FtsE  38.39 
 
 
230 aa  147  9e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.122374  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>