240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0347 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0347  uracil-DNA glycosylase  100 
 
 		 235 aa  478  1e-134  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1111  uracil-DNA glycosylase  74.56 
 
 		 231 aa  352  2e-96  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0112  uracil-DNA glycosylase  73.93 
 
 		 232 aa  351  5e-96  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1822  uracil-DNA glycosylase  71.05 
 
 		 230 aa  328  4e-89  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0126  uracil-DNA glycosylase  63.16 
 
 		 229 aa  293  2e-78  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.560482  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0093  uracil-DNA glycosylase  61.23 
 
 		 231 aa  285  4e-76  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0121  uracil-DNA glycosylase  59.91 
 
 		 231 aa  281  9e-75  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0081  uracil-DNA glycosylase  59.91 
 
 		 231 aa  280  2e-74  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.110525  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2726  uracil-DNA glycosylase  59.91 
 
 		 223 aa  264  8.999999999999999e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0400  hypothetical protein  57.73 
 
 		 220 aa  256  2e-67  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1349  uracil-DNA glycosylase  55.16 
 
 		 231 aa  256  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2992  uracil-DNA glycosylase  54.82 
 
 		 235 aa  256  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13610  uracil-DNA glycosylase  55.16 
 
 		 232 aa  254  8e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1562  uracil-DNA glycosylase  59.55 
 
 		 223 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.118173  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0198  uracil-DNA glycosylase  56.56 
 
 		 221 aa  250  1e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.495889  normal  0.174961 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3241  uracil-DNA glycosylase  54.5 
 
 		 233 aa  249  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0009  uracil-DNA glycosylase  59.28 
 
 		 224 aa  248  6e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2820  uracil-DNA glycosylase  52.25 
 
 		 241 aa  248  7e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1556  uracil-DNA glycosylase  55.36 
 
 		 225 aa  248  8e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.478183 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1381  uracil-DNA glycosylase  54.26 
 
 		 229 aa  246  3e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.541157  normal  0.225249 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1676  uracil-DNA glycosylase  53.78 
 
 		 245 aa  246  3e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0536187  normal  0.595891 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1413  uracil-DNA glycosylase  52.91 
 
 		 230 aa  245  4e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0481  uracil-DNA glycosylase  52.27 
 
 		 223 aa  244  8e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0802006  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4397  uracil-DNA glycosylase  53.36 
 
 		 230 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1590  uracil-DNA glycosylase  53.78 
 
 		 269 aa  243  1.9999999999999999e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000051966  hitchhiker  0.00000589305 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4308  uracil-DNA glycosylase  52.47 
 
 		 230 aa  242  3e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4236  uracil-DNA glycosylase  52.47 
 
 		 230 aa  242  5e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0246  uracil-DNA glycosylase  53.39 
 
 		 221 aa  241  6e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00388102 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3970  uracil-DNA glycosylase  52.91 
 
 		 230 aa  241  7.999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.439338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54590  uracil-DNA glycosylase  54.26 
 
 		 231 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000185097  normal  0.0296541 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3206  uracil-DNA glycosylase  51.77 
 
 		 261 aa  240  1e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.240216 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0808  uracil-DNA glycosylase  53.33 
 
 		 231 aa  240  1e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4770  uracil-DNA glycosylase  54.26 
 
 		 231 aa  240  1e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.740506  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1497  uracil-DNA glycosylase  52.42 
 
 		 247 aa  239  2e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0754216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03712  uracil-DNA glycosylase  52.25 
 
 		 241 aa  237  9e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0237  uracil-DNA glycosylase  52 
 
 		 222 aa  236  2e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3560  uracil-DNA glycosylase  50.44 
 
 		 233 aa  236  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1054  uracil-DNA glycosylase  51.12 
 
 		 230 aa  236  2e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2152  uracil-DNA glycosylase  50 
 
 		 253 aa  235  4e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.957234  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2241  uracil-DNA glycosylase  49.55 
 
 		 253 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2033  uracil-DNA glycosylase  55 
 
 		 221 aa  232  3e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3454  uracil-DNA glycosylase  52 
 
 		 229 aa  233  3e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0594128 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1218  uracil-DNA glycosylase  55.29 
 
 		 218 aa  231  6e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.145482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2912  uracil-DNA glycosylase  53.39 
 
 		 221 aa  231  1e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0496469  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1058  uracil-DNA glycosylase  53.21 
 
 		 225 aa  227  1e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1088  uracil-DNA glycosylase  50.69 
 
 		 229 aa  226  2e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0467841  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3082  uracil-DNA glycosylase  52.56 
 
 		 228 aa  227  2e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0349858  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1097  uracil-DNA glycosylase  50.69 
 
 		 229 aa  226  2e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00580941  normal  0.146724 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2737  uracil-DNA glycosylase  50.69 
 
 		 229 aa  226  2e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000100069  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2796  uracil-DNA glycosylase  51.63 
 
 		 228 aa  226  2e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.416019  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2956  uracil-DNA glycosylase  50.69 
 
 		 229 aa  226  2e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0497126  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2269  uracil-DNA glycosylase  48.43 
 
 		 243 aa  226  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1193  uracil-DNA glycosylase  52.56 
 
 		 228 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00106549  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2733  uracil-DNA glycosylase  50.23 
 
 		 229 aa  225  6e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00800854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2586  uracil-DNA glycosylase  52.49 
 
 		 222 aa  224  6e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03325  uracil-DNA glycosylase  50.69 
 
 		 221 aa  225  6e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100053  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2867  uracil-DNA glycosylase  50.23 
 
 		 229 aa  225  6e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0155178  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10973  putative uracil-DNA glycosylase  54.3 
 
 		 221 aa  225  6e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1084  uracil-DNA glycosylase  49.77 
 
 		 240 aa  224  7e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000321985  hitchhiker  0.00000000131635 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3670  uracil-DNA glycosylase  50.9 
 
 		 237 aa  224  7e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.769625  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02474  uracil-DNA glycosylase  50.23 
 
 		 229 aa  224  9e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.386825  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02438  hypothetical protein  50.23 
 
 		 229 aa  224  9e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.372619  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0465  uracil-DNA glycosylase  48.66 
 
 		 226 aa  224  1e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.878798  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2288  uracil-DNA glycosylase  52.73 
 
 		 223 aa  223  2e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.4813e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3817  uracil-DNA glycosylase  49.77 
 
 		 229 aa  223  3e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.01333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0951  uracil-DNA glycosylase  52.75 
 
 		 225 aa  222  4e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1938  uracil-DNA glycosylase  49.54 
 
 		 226 aa  221  4.9999999999999996e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104572  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1057  uracil-DNA glycosylase  49.1 
 
 		 228 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0610651  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3683  uracil-DNA glycosylase  49.3 
 
 		 227 aa  219  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000721221  normal  0.0564802 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2839  uracil-DNA glycosylase  51.36 
 
 		 225 aa  218  6e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2059  uracil-DNA glycosylase  46.82 
 
 		 245 aa  218  8.999999999999998e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.963745 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1041  uracil-DNA glycosylase  52.34 
 
 		 217 aa  217  1e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000282189  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1173  uracil-DNA glycosylase  51.85 
 
 		 228 aa  216  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0255291  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3595  uracil-DNA glycosylase  51.85 
 
 		 228 aa  216  2e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004450  uracil-DNA glycosylase  48.64 
 
 		 226 aa  216  2.9999999999999998e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0252327  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1121  uracil-DNA glycosylase  51.85 
 
 		 228 aa  216  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0977602  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0362  uracil-DNA glycosylase  50.89 
 
 		 232 aa  215  4e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0490386  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5297  uracil-DNA glycosylase  48.42 
 
 		 225 aa  216  4e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.355342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_94976  predicted protein  48.86 
 
 		 244 aa  215  4e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.978497 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2551  uracil-DNA glycosylase  50.23 
 
 		 224 aa  215  5e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2757  uracil-DNA glycosylase  47.73 
 
 		 229 aa  214  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00257883  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2863  uracil-DNA glycosylase  47.27 
 
 		 229 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.466868  normal  0.345403 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2859  uracil-DNA glycosylase  47.27 
 
 		 229 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.721357  normal  0.53223 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2975  uracil-DNA glycosylase  47.27 
 
 		 229 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2841  uracil-DNA glycosylase  47.27 
 
 		 229 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.619436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3065  uracil-DNA glycosylase  49.3 
 
 		 229 aa  214  9.999999999999999e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.550581  hitchhiker  0.000204445 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0965  uracil-DNA glycosylase  43.84 
 
 		 221 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0201981  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2096  uracil-DNA glycosylase  47.49 
 
 		 229 aa  212  3.9999999999999995e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2929  uracil-DNA glycosylase  47.25 
 
 		 219 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000416129  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3371  uracil-DNA glycosylase  50 
 
 		 224 aa  211  9e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000031363  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1283  uracil-DNA glycosylase  46.98 
 
 		 216 aa  210  1e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0138995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0054  uracil-DNA glycosylase  52 
 
 		 223 aa  211  1e-53  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0249  uracil-DNA glycosylase  52.31 
 
 		 225 aa  209  2e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3221  uracil-DNA glycosylase  45.62 
 
 		 221 aa  209  2e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00088309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0922  uracil-DNA glycosylase  48.65 
 
 		 226 aa  210  2e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000179843  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1067  uracil-DNA glycosylase  42.92 
 
 		 221 aa  208  5e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000655251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00945  uracil-DNA glycosylase  47.73 
 
 		 226 aa  208  5e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12267  predicted protein  46.61 
 
 		 227 aa  208  6e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0613  uracil-DNA glycosylase  51.16 
 
 		 222 aa  208  6e-53  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1034  uracil-DNA glycosylase  42.92 
 
 		 221 aa  208  7e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000379797  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>