246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0335 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0335  permease  100 
 
 		 331 aa  653    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.943617  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1092  permease  76.36 
 
 		 337 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000361743  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4283  permease  74.62 
 
 		 337 aa  475  1e-133  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0731  permease  72.51 
 
 		 337 aa  475  1e-133  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000936228  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1066  permease  75.91 
 
 		 337 aa  471  1e-132  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2048  permease  66.36 
 
 		 336 aa  436  1e-121  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1223  permease  62.05 
 
 		 334 aa  396  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2565  permease  57.62 
 
 		 338 aa  374  1e-102  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000010966  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1109  permease  61.37 
 
 		 284 aa  366  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1299  permease  58.23 
 
 		 338 aa  354  8.999999999999999e-97  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.201061  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1408  permease  57.41 
 
 		 332 aa  351  1e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.598043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0548  permease  52.72 
 
 		 318 aa  340  1e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000695477  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1178  permease  46.36 
 
 		 315 aa  293  4e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.330417  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2844  permease  49.5 
 
 		 348 aa  290  2e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.693493  normal  0.0127415 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2555  permease  45.28 
 
 		 349 aa  288  7e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000127833  hitchhiker  0.00212732 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4600  permease  49.32 
 
 		 345 aa  286  4e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2566  permease  46.23 
 
 		 324 aa  285  9e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.931351 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3641  permease  48.24 
 
 		 348 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2196  permease  49.17 
 
 		 317 aa  282  5.000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000111416  normal  0.407571 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0438  permease  45.87 
 
 		 315 aa  282  6.000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1875  permease  46.15 
 
 		 315 aa  282  6.000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1707  permease  45.72 
 
 		 352 aa  279  5e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2955  hypothetical protein  48.49 
 
 		 315 aa  277  2e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2640  permease  47.37 
 
 		 323 aa  276  2e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0751  permease  50.16 
 
 		 318 aa  276  3e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0934  permease  43.63 
 
 		 319 aa  276  3e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00064116  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3673  permease  47.23 
 
 		 351 aa  276  3e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2282  permease  45.36 
 
 		 330 aa  276  4e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.954207 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3942  permease  47.97 
 
 		 354 aa  273  2.0000000000000002e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4202  transporter  46.05 
 
 		 352 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0519  permease  47.16 
 
 		 315 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3620  permease  45.7 
 
 		 351 aa  273  4.0000000000000004e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0153  hypothetical protein  44.89 
 
 		 323 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1709  hypothetical protein  45.28 
 
 		 323 aa  272  6e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00218353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0464  permease  44.22 
 
 		 350 aa  272  6e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000958774  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1474  permease  46.43 
 
 		 353 aa  272  6e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.614025  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2023  permease  45.33 
 
 		 350 aa  271  9e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0507  permease  44.83 
 
 		 356 aa  271  1e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1204  permease  48.25 
 
 		 318 aa  271  1e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3647  permease  44.37 
 
 		 364 aa  270  2e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.5727 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0398  hypothetical protein  44.19 
 
 		 344 aa  270  2e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.679708  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0819  permease  49.2 
 
 		 318 aa  270  2e-71  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.350869  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1117  permease  45.72 
 
 		 352 aa  269  5e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.107708 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3419  permease  46.96 
 
 		 354 aa  268  8e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0265  permease  43.62 
 
 		 367 aa  266  5e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.803514 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0049  permease  44.7 
 
 		 353 aa  265  7e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2949  permease  46.78 
 
 		 351 aa  261  8.999999999999999e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4062  permease  42.86 
 
 		 377 aa  261  1e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.78082  normal  0.984142 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1783  permease  45.12 
 
 		 362 aa  261  1e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3722  permease-like  43.42 
 
 		 381 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2777  permease-like  43.71 
 
 		 363 aa  258  9e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1427  putative permease  43.14 
 
 		 322 aa  258  1e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1704  hypothetical protein  42.76 
 
 		 341 aa  258  1e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0857  permease  46.31 
 
 		 315 aa  257  2e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.398013  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1027  transporter  45.36 
 
 		 366 aa  255  6e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1645  permease  44.82 
 
 		 350 aa  255  6e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701842  normal  0.852279 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0110  permease  40.88 
 
 		 321 aa  255  8e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3659  permease  44.27 
 
 		 349 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1089  permease  45.03 
 
 		 366 aa  253  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3415  permease  44.52 
 
 		 351 aa  251  9.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1935  permease  43.9 
 
 		 353 aa  249  4e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2181  permease  42.67 
 
 		 319 aa  248  1e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000463978  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5316  permease  41.07 
 
 		 354 aa  247  2e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.465068  normal  0.121906 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1870  permease  41.08 
 
 		 319 aa  243  3e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.788351  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4014  permease  43 
 
 		 370 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.519367  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4076  permease  45.1 
 
 		 349 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0164237  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0728  permease  39.51 
 
 		 353 aa  236  5.0000000000000005e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3776  permease  37.74 
 
 		 331 aa  229  5e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3832  permease  37.42 
 
 		 331 aa  229  6e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0535  hypothetical protein  38.06 
 
 		 331 aa  228  1e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3958  permease  37.1 
 
 		 331 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0492  permease  37.1 
 
 		 331 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3190  permease  35.65 
 
 		 335 aa  226  3e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0534  permease  37.42 
 
 		 331 aa  225  9e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3497  permease  38.06 
 
 		 331 aa  224  2e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1725  permease  37.22 
 
 		 337 aa  219  5e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1221  permease  35.87 
 
 		 332 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1810  permease  35.81 
 
 		 328 aa  218  1e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2333  permease  35.56 
 
 		 332 aa  218  2e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.685877  normal  0.0887616 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3818  permease  35.56 
 
 		 332 aa  218  2e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1442  permease  38.73 
 
 		 371 aa  216  5e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0486  permease  34.03 
 
 		 338 aa  210  3e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3357  putative permease  35.6 
 
 		 336 aa  209  6e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.138974  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1828  permease  33.75 
 
 		 330 aa  207  3e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.22223  normal  0.735803 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0849  permease  36.93 
 
 		 316 aa  205  1e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000568724 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0589  permease  33.98 
 
 		 332 aa  198  1.0000000000000001e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1430  permease  33.55 
 
 		 318 aa  188  9e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.611447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2503  permease  33.9 
 
 		 318 aa  175  8e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.523202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0864  permease  33.45 
 
 		 308 aa  161  1e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0015  permease  32.67 
 
 		 301 aa  159  4e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.684774  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0966  permease  30.03 
 
 		 311 aa  157  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000479758  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0665  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF318 domain protein)  32.27 
 
 		 324 aa  153  2.9999999999999998e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0820  hypothetical protein  30.14 
 
 		 293 aa  153  4e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1498  permease  31.08 
 
 		 307 aa  152  8e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.562403  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2452  putative permease  31.16 
 
 		 304 aa  151  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0083  putative permease  30.03 
 
 		 306 aa  148  1.0000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2516  permease  31.58 
 
 		 316 aa  145  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.114382  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0315  permease  34.16 
 
 		 296 aa  140  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1217  permease  28.61 
 
 		 332 aa  137  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2425  hypothetical protein  31.94 
 
 		 294 aa  136  5e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.395757  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>