More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0242 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0242  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  100 
 
 		 206 aa  414  9.999999999999999e-116  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.916441  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1132  single-stranded DNA-binding protein  50.65 
 
 		 209 aa  197  7.999999999999999e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1586  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  53.59 
 
 		 188 aa  193  2e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0652  single-stranded DNA-binding protein  53.99 
 
 		 183 aa  191  5e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1214  single-stranded DNA-binding protein  52.58 
 
 		 182 aa  190  1e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.589073  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1089  single-stranded DNA-binding protein  52.58 
 
 		 182 aa  190  1e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0058  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  70.16 
 
 		 161 aa  185  4e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.631212  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1997  amino acid carrier protein AlsT  76.32 
 
 		 175 aa  184  7e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.473255  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0952  single-stranded DNA-binding protein  53.81 
 
 		 175 aa  184  1.0000000000000001e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1661  single-stranded DNA-binding protein  64.42 
 
 		 172 aa  158  4e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0862  single-strand binding protein  53.85 
 
 		 166 aa  152  5e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2626  single-strand binding protein  43.8 
 
 		 176 aa  112  3e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.377428  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6278  single-stranded DNA-binding protein  37.8 
 
 		 190 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2288  single-strand binding protein  44.86 
 
 		 159 aa  105  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1690  single-strand binding protein  39.55 
 
 		 137 aa  104  1e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3951  single-strand binding protein  47.66 
 
 		 161 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3865  single-strand binding protein  47.66 
 
 		 161 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.672811  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3808  single-strand binding protein  47.66 
 
 		 163 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39281  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0848  single-strand binding protein family  41.32 
 
 		 142 aa  103  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000446358  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3926  single-strand binding protein  47.66 
 
 		 156 aa  101  7e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1863  single-strand binding protein  45.71 
 
 		 166 aa  101  9e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.621974 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5572  single-strand binding protein  43.4 
 
 		 184 aa  100  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  41.98 
 
 		 146 aa  100  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1608  single-strand binding protein  46.23 
 
 		 151 aa  100  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.409638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1903  single-strand binding protein  46.23 
 
 		 151 aa  100  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2539  single-strand binding protein  45.95 
 
 		 150 aa  100  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000217555  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3313  single-strand binding protein  33.53 
 
 		 231 aa  99.8  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0358843  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0315  single-stranded DNA-binding protein  50 
 
 		 181 aa  99.4  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2815  single-stranded DNA-binding protein  33.33 
 
 		 177 aa  99.4  4e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  46.23 
 
 		 188 aa  99.4  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4439  single-strand binding protein  47.12 
 
 		 170 aa  98.6  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3093  single-stranded DNA-binding protein  48.08 
 
 		 199 aa  98.2  8e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2957  single-stranded DNA-binding protein  48.08 
 
 		 192 aa  98.2  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.602343  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0061  single-stranded DNA-binding protein  48.08 
 
 		 196 aa  98.2  8e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1529  single-stranded DNA-binding protein  48.08 
 
 		 192 aa  98.2  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0781  single-stranded DNA-binding protein  48.08 
 
 		 185 aa  97.8  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0611  single-stranded DNA-binding protein  48.08 
 
 		 184 aa  97.8  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0596  single-stranded DNA-binding protein  48.08 
 
 		 179 aa  97.8  9e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5984  single-strand binding protein  40.19 
 
 		 171 aa  97.8  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.933717 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  45.19 
 
 		 147 aa  97.4  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4106  single-stranded DNA-binding protein  45.71 
 
 		 177 aa  97.4  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0111  single-strand binding protein  45.71 
 
 		 173 aa  97.4  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00797744  hitchhiker  0.00729769 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0611  single-stranded DNA-binding protein  45.71 
 
 		 179 aa  97.4  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0353597 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0450  single-strand binding protein  41.74 
 
 		 152 aa  97.4  1e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000062046  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  44.23 
 
 		 149 aa  97.4  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0691  single-strand binding protein  45.37 
 
 		 182 aa  96.7  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0438  single-strand binding protein  38.3 
 
 		 157 aa  96.7  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.367584 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0500  single-stranded DNA-binding protein  47.12 
 
 		 186 aa  96.7  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2163  single-stranded DNA-binding protein  47.12 
 
 		 184 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0148  single-strand binding protein  36.11 
 
 		 200 aa  97.1  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000650066  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0538  single-stranded DNA-binding protein  47.12 
 
 		 182 aa  96.7  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2746  single-strand binding protein  49.52 
 
 		 154 aa  96.7  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2777  single-stranded DNA-binding protein  47.12 
 
 		 184 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450674  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2788  single-stranded DNA-binding protein  47.12 
 
 		 183 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.481192 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0369  single-stranded DNA-binding protein  46.67 
 
 		 181 aa  95.9  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0107  single-strand binding protein  46.02 
 
 		 165 aa  96.3  3e-19  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0655467  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4573  single-stranded DNA-binding protein  42.62 
 
 		 171 aa  96.3  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03931  single-strand DNA-binding protein  44.04 
 
 		 178 aa  95.5  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0479609  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3933  single-strand binding protein  44.04 
 
 		 178 aa  95.5  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4301  single-stranded DNA-binding protein  44.04 
 
 		 178 aa  95.5  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03891  hypothetical protein  44.04 
 
 		 178 aa  95.5  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0417311  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5562  single-stranded DNA-binding protein  44.04 
 
 		 178 aa  95.5  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.214992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4611  single-stranded DNA-binding protein  44.04 
 
 		 178 aa  95.5  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3968  single-stranded DNA-binding protein  44.04 
 
 		 178 aa  95.5  4e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0530108 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4521  single-stranded DNA-binding protein  44.04 
 
 		 178 aa  95.5  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3307  single-strand binding protein  45.71 
 
 		 167 aa  95.9  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.358097  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4028  single-strand binding protein  38.58 
 
 		 238 aa  95.5  5e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0555  single-strand binding protein  43.81 
 
 		 183 aa  95.5  5e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2184  single-strand binding protein  47.62 
 
 		 160 aa  95.5  5e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0571  single-strand binding protein  42.06 
 
 		 222 aa  95.5  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499632  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2695  single-stranded DNA-binding protein  46.15 
 
 		 186 aa  95.1  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.284268 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6107  single-stranded DNA-binding protein  46.15 
 
 		 184 aa  95.1  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.603331 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2293  single-strand binding protein  43.81 
 
 		 155 aa  95.1  6e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2837  single-stranded DNA-binding protein  46.15 
 
 		 187 aa  95.1  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0731757  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0327  single-strand binding protein  41.41 
 
 		 201 aa  94.7  7e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00747942  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03705  single-stranded DNA-binding protein  43.64 
 
 		 178 aa  94.7  8e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2424  single-strand binding protein  46.6 
 
 		 167 aa  94.7  9e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00208547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0516  single-strand binding protein  44.86 
 
 		 234 aa  94.4  9e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.490928  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0640  single-strand binding protein  38.76 
 
 		 236 aa  94  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.021198  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2227  single-strand binding protein  43.4 
 
 		 152 aa  94  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.261214  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3772  single-strand binding protein  46.67 
 
 		 167 aa  94.4  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0461  single-stranded DNA-binding protein  42.73 
 
 		 183 aa  94.4  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1729  single-stranded DNA binding protein  45.71 
 
 		 149 aa  94.4  1e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0422  single-stranded DNA-binding protein  45.79 
 
 		 178 aa  93.2  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.508741 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0581  single-strand binding protein  38.76 
 
 		 234 aa  93.2  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00543875  normal  0.0620215 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0980  single-strand binding protein  41.61 
 
 		 136 aa  93.6  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3023  single-strand binding protein  43.81 
 
 		 163 aa  94  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.208974  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3753  single-strand binding protein  38.76 
 
 		 234 aa  93.2  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000011541  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0556  single-strand binding protein  38.76 
 
 		 234 aa  93.2  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00736875  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03522  Single-strand binding protein (SSB) (Helix-destabilizing protein)  40.35 
 
 		 161 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.721181  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5019  single-strand binding protein  47.17 
 
 		 130 aa  93.2  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0663797  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03473  hypothetical protein  40.35 
 
 		 161 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.953641  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0140  single-strand binding protein  36.13 
 
 		 164 aa  92.8  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3710  single-strand binding protein  43.97 
 
 		 242 aa  92.8  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000568362  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0587  single-strand binding protein  38.76 
 
 		 236 aa  93.2  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0173283  normal  0.785333 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1677  single-strand binding protein  44.66 
 
 		 168 aa  92.4  4e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000004529  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  43.27 
 
 		 148 aa  92.4  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1550  single-stranded DNA-binding protein  46.67 
 
 		 177 aa  92.4  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.202411  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5215  single-stranded DNA-binding protein  46.67 
 
 		 177 aa  92.4  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656478  normal  0.693787 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  43.27 
 
 		 146 aa  92  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>