More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0164 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012040  Cla_a026  DNA topoisomerase III TraE  53.97 
 
 		 676 aa  706    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0164  DNA topoisomerase 3 (DNA topoisomerase III)  100 
 
 		 716 aa  1461    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.000863773  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0045  DNA topoisomerase III  54.15 
 
 		 730 aa  744    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0221365  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0087  DNA topoisomerase III  41.33 
 
 		 717 aa  474  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.451504 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0003  DNA topoisomerase 3  41.49 
 
 		 717 aa  474  1e-132  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000970275  n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0022  DNA topoisomerase III  41.71 
 
 		 718 aa  472  1e-132  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.270283  normal  0.995092 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08201  DNA topoisomerase III  35.03 
 
 		 734 aa  435  1e-120  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  0.0178997  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1542  DNA topoisomerase III  37.92 
 
 		 645 aa  409  1e-113  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0776  DNA topoisomerase III  36.32 
 
 		 645 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000730539  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0063  DNA topoisomerase III  33.83 
 
 		 730 aa  405  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6523  DNA topoisomerase III  34.2 
 
 		 687 aa  401  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.728561  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6614  DNA topoisomerase III  34.2 
 
 		 687 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.668751  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0121  DNA topoisomerase 3  37.44 
 
 		 733 aa  398  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.488261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03041  DNA topoisomerase III  35.28 
 
 		 654 aa  392  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002917  DNA topoisomerase III  35.13 
 
 		 655 aa  391  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3061  DNA topoisomerase III  33.7 
 
 		 702 aa  389  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2400  DNA topoisomerase III  35.55 
 
 		 668 aa  391  1e-107  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2246  DNA topoisomerase III  33.96 
 
 		 685 aa  386  1e-106  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.205011  n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4169  DNA topoisomerase type IA central domain protein  36.34 
 
 		 764 aa  386  1e-106  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1498  DNA topoisomerase III  34.42 
 
 		 732 aa  386  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2461  DNA topoisomerase III  36.7 
 
 		 643 aa  386  1e-106  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.42133  normal  0.125855 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4319  DNA topoisomerase III  32.37 
 
 		 687 aa  388  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.535821  normal  0.574882 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2830  DNA topoisomerase III  35.17 
 
 		 705 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0290514 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1433  DNA topoisomerase III  33.97 
 
 		 706 aa  383  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2753  DNA topoisomerase III  35.17 
 
 		 705 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1486  DNA topoisomerase III  33.97 
 
 		 704 aa  385  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.892881 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2145  DNA topoisomerase III  33.44 
 
 		 694 aa  385  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.393649  normal  0.847419 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1630  DNA topoisomerase III  35.3 
 
 		 647 aa  385  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000168302  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1612  DNA topoisomerase III  34.84 
 
 		 680 aa  381  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2736  DNA topoisomerase III  35.12 
 
 		 705 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1658  DNA topoisomerase III  36.01 
 
 		 679 aa  380  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0371283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1625  DNA topoisomerase III  34.39 
 
 		 672 aa  380  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2146  DNA topoisomerase III  31.97 
 
 		 654 aa  380  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.232139  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1623  DNA topoisomerase III  35.02 
 
 		 705 aa  381  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.730482 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2435  DNA topoisomerase III  34.26 
 
 		 708 aa  382  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.874224  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2976  DNA topoisomerase III  35.35 
 
 		 666 aa  376  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.930481 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3275  DNA topoisomerase III  35.74 
 
 		 670 aa  377  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.287374  normal  0.133974 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2529  DNA topoisomerase III  32.66 
 
 		 722 aa  378  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0020  topoisomerase  36.52 
 
 		 726 aa  375  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4792  DNA topoisomerase III  34.83 
 
 		 649 aa  372  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2155  DNA topoisomerase III  35.79 
 
 		 647 aa  372  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2299  DNA topoisomerase III  34.59 
 
 		 670 aa  371  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4425  DNA topoisomerase III  33.79 
 
 		 707 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.669794  normal  0.110888 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1401  DNA topoisomerase III  34.05 
 
 		 653 aa  367  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1310  DNA topoisomerase III  34.6 
 
 		 632 aa  363  5.0000000000000005e-99  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00570993  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1877  DNA topoisomerase III  33.54 
 
 		 649 aa  362  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000540839  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1979  DNA topoisomerase III  33.55 
 
 		 641 aa  361  3e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000598454  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0023  DNA topoisomerase III  33.14 
 
 		 679 aa  360  4e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2088  DNA topoisomerase III  33.55 
 
 		 642 aa  360  4e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00112487  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2343  DNA topoisomerase III  33.55 
 
 		 641 aa  360  5e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000133374  normal  0.0757376 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2018  DNA topoisomerase III  33.59 
 
 		 653 aa  360  6e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000256516  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1986  DNA topoisomerase III  33.59 
 
 		 653 aa  360  7e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136291  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2048  DNA topoisomerase III  33.39 
 
 		 649 aa  360  7e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.177023  normal  0.939846 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1409  DNA topoisomerase III  33.39 
 
 		 649 aa  360  7e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0199719  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01732  DNA topoisomerase III  33.59 
 
 		 653 aa  359  8e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00246982  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1879  DNA topoisomerase III  33.59 
 
 		 653 aa  359  8e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000411002  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1847  DNA topoisomerase III  33.59 
 
 		 653 aa  359  8e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000137821  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1869  DNA topoisomerase III  33.59 
 
 		 653 aa  359  8e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000214138  decreased coverage  0.00000617518 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01720  hypothetical protein  33.59 
 
 		 653 aa  359  8e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00317357  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2483  DNA topoisomerase III  33.75 
 
 		 653 aa  359  9e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000298229  normal  0.566589 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1428  DNA topoisomerase III  33.59 
 
 		 651 aa  359  9e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0037378  normal  0.804884 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1972  DNA topoisomerase III  33.85 
 
 		 641 aa  359  9.999999999999999e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.850932  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4107  DNA topoisomerase III  33.09 
 
 		 679 aa  359  9.999999999999999e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0727596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1425  DNA topoisomerase III  33.23 
 
 		 649 aa  358  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.864642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2718  DNA topoisomerase III  34.46 
 
 		 641 aa  358  1.9999999999999998e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.94815  hitchhiker  0.00169428 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1392  DNA topoisomerase III  33.23 
 
 		 649 aa  358  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.213648  normal  0.301409 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0310  DNA topoisomerase III  33.09 
 
 		 679 aa  357  2.9999999999999997e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000929429 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0618  DNA topoisomerase III  32.21 
 
 		 669 aa  358  2.9999999999999997e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2541  DNA topoisomerase III  30.72 
 
 		 744 aa  357  3.9999999999999996e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.111653  normal  0.0440835 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2208  DNA topoisomerase III  33.49 
 
 		 641 aa  355  2e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.948709  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2268  DNA topoisomerase III  33.54 
 
 		 641 aa  354  4e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1684  DNA topoisomerase III  33.75 
 
 		 634 aa  352  8.999999999999999e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2923  DNA topoisomerase III  32.5 
 
 		 654 aa  352  2e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.177177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4716  DNA topoisomerase III  32.61 
 
 		 689 aa  351  2e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1966  DNA topoisomerase III  33.23 
 
 		 640 aa  351  3e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3295  DNA topoisomerase III  31.91 
 
 		 655 aa  350  4e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.17428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3001  DNA topoisomerase III  31.52 
 
 		 655 aa  345  1e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.514044  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1737  DNA topoisomerase III  32.58 
 
 		 676 aa  345  1e-93  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1738  DNA topoisomerase III  32.46 
 
 		 699 aa  343  5e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2001  DNA topoisomerase III  32.09 
 
 		 721 aa  342  2e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0468853  normal  0.227685 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3423  DNA topoisomerase III  32.67 
 
 		 654 aa  340  7e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1425  DNA topoisomerase III  32.28 
 
 		 683 aa  339  8e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.771336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0283  DNA topoisomerase III  32.42 
 
 		 684 aa  338  1.9999999999999998e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.860324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4150  DNA topoisomerase III  31.38 
 
 		 670 aa  337  5e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0356061  normal  0.0728569 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1473  DNA topoisomerase III  31.63 
 
 		 673 aa  334  3e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.199053 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1445  DNA topoisomerase III  31.35 
 
 		 670 aa  332  2e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.159298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0099  DNA topoisomerase III  30.56 
 
 		 854 aa  331  3e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1311  DNA topoisomerase III  31.26 
 
 		 670 aa  331  3e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.617817  normal  0.472468 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0558  DNA topoisomerase III  29.09 
 
 		 680 aa  328  2.0000000000000001e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1814  DNA topoisomerase III  29.33 
 
 		 746 aa  327  4.0000000000000003e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000049095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3624  DNA topoisomerase III  31.02 
 
 		 652 aa  325  2e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.203006  normal  0.930533 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0974  DNA topoisomerase III  30.85 
 
 		 799 aa  324  4e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1657  DNA topoisomerase III  30.77 
 
 		 666 aa  324  4e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1223  DNA topoisomerase III  30.96 
 
 		 670 aa  323  5e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.183641 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0990  DNA topoisomerase III  29.75 
 
 		 671 aa  323  7e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.585612  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3385  DNA topoisomerase III  30.2 
 
 		 676 aa  323  9.000000000000001e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.191763  normal  0.100638 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2298  DNA topoisomerase III  30.2 
 
 		 676 aa  323  9.000000000000001e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000135741  hitchhiker  0.000195203 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1814  DNA topoisomerase III  31.02 
 
 		 653 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.230615  normal  0.182925 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1853  DNA topoisomerase III  30.83 
 
 		 695 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.989434  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2233  DNA topoisomerase III  29.36 
 
 		 671 aa  322  1.9999999999999998e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0145948  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>